Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Tresbach, Rafael Hencke
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIPAMPA
Texto Completo: http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/642
Resumo: As abelhas são a principal espécie responsável pela polinização e propagação de espécies vegetais. Além da polinização, produtos úteis aos seres humanos como mel, apitoxina, cera, geleia real e própolis são fornecidos pelas abelhas. Entretanto, patologias como a nosemose, que é uma das responsáveis pelo Distúrbio de Colapso de Colônias, podem levar a perdas de colmeias e declínio de produção e, consequentemente, perdas econômicas. O presente trabalho objetiva padronizar um método para a detecção dos microsporídios Nosema apis e Nosema ceranae em amostras de mel, visando fornecer uma alternativa rápida e confiável aos atuais métodos e utilizando o produto mais abundante da colmeia. Para este trabalho, utilizaram-se três protocolos de extração de DNA de forma a compará-los, sendo um protocolo com o uso de micro-ondas e outros dois com kits comerciais, sendo um para extração de DNA genômico de células animais e bacterianas e outro para extração de DNA genômico vegetal. Avaliamos 15 amostras de mel do estado do Rio Grande do Sul coletadas entre 2007 e 2008 e que foram consideradas positivas para presença de esporos de Nosema spp. por microscopia óptica, porém sem determinação de espécie.Dos três métodos que foram analisados neste trabalho, apenas o método utilizando o kit de extração de DNA genômico de plantas permitiu a amplificação de produtos dos tamanhos esperados. Das 15 amostras utilizadas, 14 mostraram amplificação para N. apis e 11 revelaram presença de N. ceranae. Com estes resultados, pudemos padronizar um método para identificação precoce das espécies de Nosema presentes em amostras de mel. O protocolo se mostrou rápido e eficiente e capaz de extrair DNA genômico de qualidade a partir de amostras de mel para identificação de N. apis e N. ceranae utilizando PCR.
id UNIP_199dfa93534c6a6cf23dbe8efb7dd1a3
oai_identifier_str oai:repositorio.unipampa.edu.br:riu/642
network_acronym_str UNIP
network_name_str Repositório Institucional da UNIPAMPA
repository_id_str
spelling Boldo, Juliano TomazzoniTresbach, Rafael Hencke2016-11-24T18:31:16Z2016-11-24T18:31:16Z2014-08-22http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/642As abelhas são a principal espécie responsável pela polinização e propagação de espécies vegetais. Além da polinização, produtos úteis aos seres humanos como mel, apitoxina, cera, geleia real e própolis são fornecidos pelas abelhas. Entretanto, patologias como a nosemose, que é uma das responsáveis pelo Distúrbio de Colapso de Colônias, podem levar a perdas de colmeias e declínio de produção e, consequentemente, perdas econômicas. O presente trabalho objetiva padronizar um método para a detecção dos microsporídios Nosema apis e Nosema ceranae em amostras de mel, visando fornecer uma alternativa rápida e confiável aos atuais métodos e utilizando o produto mais abundante da colmeia. Para este trabalho, utilizaram-se três protocolos de extração de DNA de forma a compará-los, sendo um protocolo com o uso de micro-ondas e outros dois com kits comerciais, sendo um para extração de DNA genômico de células animais e bacterianas e outro para extração de DNA genômico vegetal. Avaliamos 15 amostras de mel do estado do Rio Grande do Sul coletadas entre 2007 e 2008 e que foram consideradas positivas para presença de esporos de Nosema spp. por microscopia óptica, porém sem determinação de espécie.Dos três métodos que foram analisados neste trabalho, apenas o método utilizando o kit de extração de DNA genômico de plantas permitiu a amplificação de produtos dos tamanhos esperados. Das 15 amostras utilizadas, 14 mostraram amplificação para N. apis e 11 revelaram presença de N. ceranae. Com estes resultados, pudemos padronizar um método para identificação precoce das espécies de Nosema presentes em amostras de mel. O protocolo se mostrou rápido e eficiente e capaz de extrair DNA genômico de qualidade a partir de amostras de mel para identificação de N. apis e N. ceranae utilizando PCR.Honey bee (Apis mellifera) is the main species responsible by pollination and vegetable propagation. Aside pollination, several products used by human beings, i. e. honey, apitoxin, wax, royal jelly and propolis are provided by honey bees. However, pathologies like nosemosis, which is one of the main causes of Colony Collapse Disorder, may be responsible for severe colony losses and overall production decline, leading to economic losses. This work aims to standardize a technique for detection of Nosema apis and Nosema ceranae in honey samples, providing a fast and reliable alternative for the current methods, using as sample the most abundant product of honey bees. For this work, three DNA extraction protocols were tested and compared. One protocol used a microwave to disrupt and further extract DNA from cells and two other protocols used commercial kits: a kit for genomic DNA extraction from animal tissue and bacteria cell samples and a kit for plant genomic DNA extraction. Fifteen honey samples collected in Rio Grande do Sul State in 2007 and 2008 were tested. Nosema spp. spores were previously detected using optic microscopy in the samples, but no species were reliably determined. Considering the three tested methods, only the method using the plant genomic DNA extraction kit presented was able to obtain the expected PCR products. Fourteen out of the 15 honey samples tested were positive for N. apis and 11 out of the 15 samples were positive for N. ceranae. Standardization of a technique for early detection of Nosema species in honey samples was possible. The developed protocol proved to be fast and efficient, allowing extraction of genomic DNA in appropriate quality from honey samples and suitable for N. apis and N. ceranae detection.Universidade Federal do PampaCampus São GabrielAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::CIENCIAS AGRARIASNosema apisNosema ceranaeMelApis melliferaDetecção por PCRHoneyPolymerase Chain ReactionEstabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de melEstablishment of a protocol for detection of Nosema apis and Nosema ceranae in honey samplesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UNIPAMPAinstname:Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)instacron:UNIPAMPACC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81232https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/4/license_rdf66e71c371cc565284e70f40736c94386MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/5/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD55ORIGINALEstabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel.pdfEstabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel.pdfapplication/pdf754349https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/1/Estabelecimento%20de%20um%20protocolo%20para%20detec%c3%a7%c3%a3o%20de%20Nosema%20apis%20e%20Nosema%20ceranae%20a%20partir%20de%20amostras%20de%20mel.pdf47d65894ae2b365c13f6068516522852MD51TEXTEstabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel.pdf.txtEstabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel.pdf.txtExtracted texttext/plain81169https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/6/Estabelecimento%20de%20um%20protocolo%20para%20detec%c3%a7%c3%a3o%20de%20Nosema%20apis%20e%20Nosema%20ceranae%20a%20partir%20de%20amostras%20de%20mel.pdf.txt619654d708a54fa746ce1de580cc3567MD56riu/6422021-03-26 13:46:21.65oai:repositorio.unipampa.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://dspace.unipampa.edu.br:8080/oai/requestsisbi@unipampa.edu.bropendoar:2021-03-26T16:46:21Repositório Institucional da UNIPAMPA - Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Establishment of a protocol for detection of Nosema apis and Nosema ceranae in honey samples
title Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
spellingShingle Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
Tresbach, Rafael Hencke
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
Nosema apis
Nosema ceranae
Mel
Apis mellifera
Detecção por PCR
Honey
Polymerase Chain Reaction
title_short Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
title_full Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
title_fullStr Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
title_full_unstemmed Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
title_sort Estabelecimento de um protocolo para detecção de Nosema apis e Nosema ceranae a partir de amostras de mel
author Tresbach, Rafael Hencke
author_facet Tresbach, Rafael Hencke
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Boldo, Juliano Tomazzoni
dc.contributor.author.fl_str_mv Tresbach, Rafael Hencke
contributor_str_mv Boldo, Juliano Tomazzoni
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
topic CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
Nosema apis
Nosema ceranae
Mel
Apis mellifera
Detecção por PCR
Honey
Polymerase Chain Reaction
dc.subject.por.fl_str_mv Nosema apis
Nosema ceranae
Mel
Apis mellifera
Detecção por PCR
dc.subject.eng.fl_str_mv Honey
Polymerase Chain Reaction
description As abelhas são a principal espécie responsável pela polinização e propagação de espécies vegetais. Além da polinização, produtos úteis aos seres humanos como mel, apitoxina, cera, geleia real e própolis são fornecidos pelas abelhas. Entretanto, patologias como a nosemose, que é uma das responsáveis pelo Distúrbio de Colapso de Colônias, podem levar a perdas de colmeias e declínio de produção e, consequentemente, perdas econômicas. O presente trabalho objetiva padronizar um método para a detecção dos microsporídios Nosema apis e Nosema ceranae em amostras de mel, visando fornecer uma alternativa rápida e confiável aos atuais métodos e utilizando o produto mais abundante da colmeia. Para este trabalho, utilizaram-se três protocolos de extração de DNA de forma a compará-los, sendo um protocolo com o uso de micro-ondas e outros dois com kits comerciais, sendo um para extração de DNA genômico de células animais e bacterianas e outro para extração de DNA genômico vegetal. Avaliamos 15 amostras de mel do estado do Rio Grande do Sul coletadas entre 2007 e 2008 e que foram consideradas positivas para presença de esporos de Nosema spp. por microscopia óptica, porém sem determinação de espécie.Dos três métodos que foram analisados neste trabalho, apenas o método utilizando o kit de extração de DNA genômico de plantas permitiu a amplificação de produtos dos tamanhos esperados. Das 15 amostras utilizadas, 14 mostraram amplificação para N. apis e 11 revelaram presença de N. ceranae. Com estes resultados, pudemos padronizar um método para identificação precoce das espécies de Nosema presentes em amostras de mel. O protocolo se mostrou rápido e eficiente e capaz de extrair DNA genômico de qualidade a partir de amostras de mel para identificação de N. apis e N. ceranae utilizando PCR.
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-08-22
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-11-24T18:31:16Z
dc.date.available.fl_str_mv 2016-11-24T18:31:16Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/642
url http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/642
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Pampa
dc.publisher.department.fl_str_mv Campus São Gabriel
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Pampa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNIPAMPA
instname:Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)
instacron:UNIPAMPA
instname_str Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)
instacron_str UNIPAMPA
institution UNIPAMPA
reponame_str Repositório Institucional da UNIPAMPA
collection Repositório Institucional da UNIPAMPA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/4/license_rdf
https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/5/license.txt
https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/1/Estabelecimento%20de%20um%20protocolo%20para%20detec%c3%a7%c3%a3o%20de%20Nosema%20apis%20e%20Nosema%20ceranae%20a%20partir%20de%20amostras%20de%20mel.pdf
https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/642/6/Estabelecimento%20de%20um%20protocolo%20para%20detec%c3%a7%c3%a3o%20de%20Nosema%20apis%20e%20Nosema%20ceranae%20a%20partir%20de%20amostras%20de%20mel.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 66e71c371cc565284e70f40736c94386
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
47d65894ae2b365c13f6068516522852
619654d708a54fa746ce1de580cc3567
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNIPAMPA - Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)
repository.mail.fl_str_mv sisbi@unipampa.edu.br
_version_ 1813274854730760192