Estimativa da diversidade genética de Queixadas (Tayassu pecari) da região do Taboco (Corguinho, MS)
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11449/121202 |
Resumo: | The Brazilian fauna has been constantly threatened by deforestation and forest fragmentation. As a result, many populations become isolated and small which negatively impacts their genetic diversity, putting them at a higher risk of extinction than large and stable populations. The aim of this work was to estimate the genetic diversity of white-lipped peccaries (Tayassu pecari) in the region of Taboco (Corguinho, MS), a fragmented area; and to compare these estimates with that obtained previously for two populations from Brazilian Pantanal, which is considered a relatively well-preserved biome and where the species is not threatened. A total of 18 blood and 72 hair samples of white-lipped peccaries had their DNA extracted and amplified for five polymorphic microsatellite loci. With the individuals identified, genetic diversity indicators (such as number of alleles, allelic richness, expected end and observed) and the inbreeding coefficient FIS were calculated. In addition, to verify if the population suffered a recent population bottleneck, we used the tests implemented in the program Bottleneck. The population of Taboco showed no evidence of recent population bottleneck (p > 0.05) or inbreeding (FIS = 0.008; p > 0.022). In addition, the levels of genetic diversity in this population (mean number of alleles = 2.60; mean allelic richness = 2.56 mean observed and expected heterozygosities = 0.45 and 0.47, respectively) were statistically similar to those found previously for the two populations from Pantanal (p > 0,05); although the region of Taboco is more impacted than the Pantanal. Even though we showed no evidence of loss of genetic diversity, it does not mean that the population is not suffering with fragmentation; but that there was not sufficient time to evidence the genetic changes. In addition, may be occurring gene flow with populations of nearby fragments, which is maintaining... (Complete abstract click electronic access below) |
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Estimativa da diversidade genética de Queixadas (Tayassu pecari) da região do Taboco (Corguinho, MS)QueixadaGenetica animalMarcadores biologicosDiversidade genéticaBiodiversidadePaisagens fragmentadasAnimais - PopulaçãoCorguinho (MS)The Brazilian fauna has been constantly threatened by deforestation and forest fragmentation. As a result, many populations become isolated and small which negatively impacts their genetic diversity, putting them at a higher risk of extinction than large and stable populations. The aim of this work was to estimate the genetic diversity of white-lipped peccaries (Tayassu pecari) in the region of Taboco (Corguinho, MS), a fragmented area; and to compare these estimates with that obtained previously for two populations from Brazilian Pantanal, which is considered a relatively well-preserved biome and where the species is not threatened. A total of 18 blood and 72 hair samples of white-lipped peccaries had their DNA extracted and amplified for five polymorphic microsatellite loci. With the individuals identified, genetic diversity indicators (such as number of alleles, allelic richness, expected end and observed) and the inbreeding coefficient FIS were calculated. In addition, to verify if the population suffered a recent population bottleneck, we used the tests implemented in the program Bottleneck. The population of Taboco showed no evidence of recent population bottleneck (p > 0.05) or inbreeding (FIS = 0.008; p > 0.022). In addition, the levels of genetic diversity in this population (mean number of alleles = 2.60; mean allelic richness = 2.56 mean observed and expected heterozygosities = 0.45 and 0.47, respectively) were statistically similar to those found previously for the two populations from Pantanal (p > 0,05); although the region of Taboco is more impacted than the Pantanal. Even though we showed no evidence of loss of genetic diversity, it does not mean that the population is not suffering with fragmentation; but that there was not sufficient time to evidence the genetic changes. In addition, may be occurring gene flow with populations of nearby fragments, which is maintaining... (Complete abstract click electronic access below)A fauna brasileira vem sendo constantemente ameaçada pelos desmatamentos e fragmentação das florestas. Em decorrência disso, muitas populações se tornam isoladas e pequenas o que pode trazer impactos na diversidade genética das mesmas, tornando-as mais propensas a extinção do que populações grandes e estáveis. Nesse trabalho, foi estimada a diversidade genética de queixadas (Tayassu pecari) na região do Taboco, Corguinho (MS), uma área fragmentada; e as estimativas geradas foram comparadas com estimativas prévias obtidas para duas populações do Pantanal Sul-Matogrossense, bioma considerado mais bem preservado e onde a espécie não está ameaçada. Um total de 18 amostras de sangue e de 72 de pelos tiveram seu DNA extraído e amplificado para cinco locos polimórficos de microssatélites. Uma vez identificados os indivíduos, estimativas de indicadores de diversidade genética (como número de alelos, riqueza alélica, heterozigosidades esperada e observada) e o coeficiente de endogamia FIS foram calculados. Além disso, para verificar se as populações passaram por gargalo populacional recente, foram utilizados os testes implementados no programa Bottleneck. A população analisada da região do Taboco não apresentou evidências de gargalo populacional recente (p > 0,05) e nem de estar sofrendo com a endogamia (FIS = 0,008; p > 0,022). Além disso, os níveis de diversidade genética nesta população (número médio de alelos = 2,60; riqueza alélica média = 2,56; heterozigosidades observada e esperada médias = 0,45 e 0,47, respectivamente) foram estatisticamente similares aos encontrados previamente para as duas populações do Pantanal Sul-Matogrossense (p > 0,05); embora a região do Taboco seja mais impactada e a do Pantanal mais preservada. O fato de não ter sido evidenciada perda de diversidade genética não significa que a população não esteja sofrendo... (resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Biondo, Cibele [UNESP]Rodrigues, Mauro Galetti [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Silva, Flávia Maria Appolinário da [UNESP]2015-03-23T15:28:54Z2015-03-23T15:28:54Z2012info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis35 f.application/pdfSILVA, Flávia Maria Appolinário da. Estimativa da diversidade genética de Queixadas (Tayassu pecari) da região do Taboco (Corguinho, MS). 2012. 35 f. Trabalho de conclusão de curso (licenciatura - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Rio Claro, 2012.http://hdl.handle.net/11449/121202000709703silva_fma_tcc_rcla.pdf3431375174670630Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-12-26T06:23:12Zoai:repositorio.unesp.br:11449/121202Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T21:23:31.876235Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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The Brazilian fauna has been constantly threatened by deforestation and forest fragmentation. As a result, many populations become isolated and small which negatively impacts their genetic diversity, putting them at a higher risk of extinction than large and stable populations. The aim of this work was to estimate the genetic diversity of white-lipped peccaries (Tayassu pecari) in the region of Taboco (Corguinho, MS), a fragmented area; and to compare these estimates with that obtained previously for two populations from Brazilian Pantanal, which is considered a relatively well-preserved biome and where the species is not threatened. A total of 18 blood and 72 hair samples of white-lipped peccaries had their DNA extracted and amplified for five polymorphic microsatellite loci. With the individuals identified, genetic diversity indicators (such as number of alleles, allelic richness, expected end and observed) and the inbreeding coefficient FIS were calculated. In addition, to verify if the population suffered a recent population bottleneck, we used the tests implemented in the program Bottleneck. The population of Taboco showed no evidence of recent population bottleneck (p > 0.05) or inbreeding (FIS = 0.008; p > 0.022). In addition, the levels of genetic diversity in this population (mean number of alleles = 2.60; mean allelic richness = 2.56 mean observed and expected heterozygosities = 0.45 and 0.47, respectively) were statistically similar to those found previously for the two populations from Pantanal (p > 0,05); although the region of Taboco is more impacted than the Pantanal. Even though we showed no evidence of loss of genetic diversity, it does not mean that the population is not suffering with fragmentation; but that there was not sufficient time to evidence the genetic changes. In addition, may be occurring gene flow with populations of nearby fragments, which is maintaining... (Complete abstract click electronic access below) |
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