RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Leite, Susi Meire Maximino
Data de Publicação: 2008
Outros Autores: Mori, Edson Seizo [UNESP], Valle, Celina Ferraz do, Bonine, César Augusto Valencise, Marino, Celso Luís [UNESP]
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622008000600001
http://hdl.handle.net/11449/5714
Resumo: Este estudo visou avaliar a variabilidade e distância genética dentro de uma população-base de melhoramento genético de Eucalyptus grandis. A avaliação da variabilidade genética tem como objetivos principais analisar a base genética da população-base e montar um banco de dados marcadores moleculares da população em análise. Essa população é formada por 327 indivíduos, principalmente das procedências de Coff's Harbour, Atherton e Rio Claro. Devido à heterozigosidade natural dessa população, ela pode ser dividida em diversas subpopulações, de acordo com a latitude e longitude de origem; e dentro de subpopulações, em função do grau de melhoramento genético já realizado do material analisado no Brasil. Isso permitiu avaliar quanto da variabilidade detectada dentro da população-base foi devido a esses fatores: procedência e grau de melhoramento. A aplicação da técnica RAPD permitiu avaliar 70 locos polimórficos, que foram analisados utilizando-se o coeficiente de Jaccard, o que resultou em matrizes de similaridade genética entre os indivíduos. Os dados de similaridade genética posteriormente foram submetidos à análise estatística. Osdados indicaram que a população-base apresenta ampla base genética, com média de similaridade genética de 0,328. O subgrupo denominado Região 3, composto por material selvagem da macrorregião de Atherton, juntamente com material de APS da macrorregião de Coff's Harbour, foi um dos que mais contribuíram para a ampla base genética da população-base. Foi possível detectar diferença estatística entre as populações selvagens das procedências de Atherton e Coff's Harbour, assim como entre essas procedências e a de Rio Claro.
id UNSP_2609584d4027155c7978ae4ba3b39a4c
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/5714
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maidenVariabilidade genética através da técnica RAPD de uma população-base multiprocedências de Eucalyptus grandis hill ex maidenMarcadores molecularesmelhoramento genético florestalgenética de populaçõesMolecular markersforest tree breedingpopulation geneticsEste estudo visou avaliar a variabilidade e distância genética dentro de uma população-base de melhoramento genético de Eucalyptus grandis. A avaliação da variabilidade genética tem como objetivos principais analisar a base genética da população-base e montar um banco de dados marcadores moleculares da população em análise. Essa população é formada por 327 indivíduos, principalmente das procedências de Coff's Harbour, Atherton e Rio Claro. Devido à heterozigosidade natural dessa população, ela pode ser dividida em diversas subpopulações, de acordo com a latitude e longitude de origem; e dentro de subpopulações, em função do grau de melhoramento genético já realizado do material analisado no Brasil. Isso permitiu avaliar quanto da variabilidade detectada dentro da população-base foi devido a esses fatores: procedência e grau de melhoramento. A aplicação da técnica RAPD permitiu avaliar 70 locos polimórficos, que foram analisados utilizando-se o coeficiente de Jaccard, o que resultou em matrizes de similaridade genética entre os indivíduos. Os dados de similaridade genética posteriormente foram submetidos à análise estatística. Osdados indicaram que a população-base apresenta ampla base genética, com média de similaridade genética de 0,328. O subgrupo denominado Região 3, composto por material selvagem da macrorregião de Atherton, juntamente com material de APS da macrorregião de Coff's Harbour, foi um dos que mais contribuíram para a ampla base genética da população-base. Foi possível detectar diferença estatística entre as populações selvagens das procedências de Atherton e Coff's Harbour, assim como entre essas procedências e a de Rio Claro.This study aimed to evaluate the genetic variability among individuals of a base population of Eucalyptus grandis and to build a molecular marker database for the analyzed populations. The Eucalyptus grandis base population comprised 327 individuals from Coff's Harbour, Atherton and Rio Claro. A few plants came from other sites (Belthorpe MT. Pandanus, Kenilworth, Yabbra, etc.). Since this base population had a heterogeneous composition, the groups were divided according to geographic localization (latitude and longitude), and genetic breeding level. Thus, the influence of those two factors (geographic localization and genetic breeding level) on the genetic variability detected was discussed. The RAPD technique allowed the evaluation of 70 loci. The binary matrix was used to estimate the genetic similarity among individuals using Jaccard's Coefficient. Parametric statistical tests were used to compare within-group similarity of the means. The obtained results showed that the base population had wide genetic variability and a mean genetic similarity of 0.328. Sub-group 3 (wild materials from the Atherton region) showed mean genetic similarity of 0.318. S.P.A. (from Coff's Harbour region) had a mean genetic similarity of 0.322 and was found to be very important for maintenance of variation in the base population. This can be explained since the individuals from those groups accounted for most of the base population (48.3% for it). The base population plants with genetic similarity higher than 0.60 should be phenotypically analyzed again in order to clarify the tendency of genetic variability during breeding programs.Votorantim CelulosePaper S. AUniversidade de Marília Centro de Ciências AgráriasUNESP FCA Departamento de Produção VegetalVcp Florestal S A, Pesquisa e DesenvolvimentoUniversidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho Departamento de GenéticaUNESP FCA Departamento de Produção VegetalUniversidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho Departamento de GenéticaSociedade de Investigações FlorestaisUniversidade de Marília (UNIMAR)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Vcp Florestal S A, Pesquisa e DesenvolvimentoLeite, Susi Meire MaximinoMori, Edson Seizo [UNESP]Valle, Celina Ferraz doBonine, César Augusto ValenciseMarino, Celso Luís [UNESP]2014-05-20T13:20:28Z2014-05-20T13:20:28Z2008-12-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article961-967application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622008000600001Revista Árvore. Sociedade de Investigações Florestais, v. 32, n. 6, p. 961-967, 2008.0100-6762http://hdl.handle.net/11449/571410.1590/S0100-67622008000600001S0100-67622008000600001WOS:000265798000001S0100-67622008000600001.pdf472467429572595801653487382083190000-0003-4524-954XSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengRevista Árvore0.3920,458info:eu-repo/semantics/openAccess2024-04-30T15:54:20Zoai:repositorio.unesp.br:11449/5714Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T14:28:09.432803Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
Variabilidade genética através da técnica RAPD de uma população-base multiprocedências de Eucalyptus grandis hill ex maiden
title RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
spellingShingle RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
Leite, Susi Meire Maximino
Marcadores moleculares
melhoramento genético florestal
genética de populações
Molecular markers
forest tree breeding
population genetics
title_short RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
title_full RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
title_fullStr RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
title_full_unstemmed RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
title_sort RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden
author Leite, Susi Meire Maximino
author_facet Leite, Susi Meire Maximino
Mori, Edson Seizo [UNESP]
Valle, Celina Ferraz do
Bonine, César Augusto Valencise
Marino, Celso Luís [UNESP]
author_role author
author2 Mori, Edson Seizo [UNESP]
Valle, Celina Ferraz do
Bonine, César Augusto Valencise
Marino, Celso Luís [UNESP]
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade de Marília (UNIMAR)
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Vcp Florestal S A, Pesquisa e Desenvolvimento
dc.contributor.author.fl_str_mv Leite, Susi Meire Maximino
Mori, Edson Seizo [UNESP]
Valle, Celina Ferraz do
Bonine, César Augusto Valencise
Marino, Celso Luís [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Marcadores moleculares
melhoramento genético florestal
genética de populações
Molecular markers
forest tree breeding
population genetics
topic Marcadores moleculares
melhoramento genético florestal
genética de populações
Molecular markers
forest tree breeding
population genetics
description Este estudo visou avaliar a variabilidade e distância genética dentro de uma população-base de melhoramento genético de Eucalyptus grandis. A avaliação da variabilidade genética tem como objetivos principais analisar a base genética da população-base e montar um banco de dados marcadores moleculares da população em análise. Essa população é formada por 327 indivíduos, principalmente das procedências de Coff's Harbour, Atherton e Rio Claro. Devido à heterozigosidade natural dessa população, ela pode ser dividida em diversas subpopulações, de acordo com a latitude e longitude de origem; e dentro de subpopulações, em função do grau de melhoramento genético já realizado do material analisado no Brasil. Isso permitiu avaliar quanto da variabilidade detectada dentro da população-base foi devido a esses fatores: procedência e grau de melhoramento. A aplicação da técnica RAPD permitiu avaliar 70 locos polimórficos, que foram analisados utilizando-se o coeficiente de Jaccard, o que resultou em matrizes de similaridade genética entre os indivíduos. Os dados de similaridade genética posteriormente foram submetidos à análise estatística. Osdados indicaram que a população-base apresenta ampla base genética, com média de similaridade genética de 0,328. O subgrupo denominado Região 3, composto por material selvagem da macrorregião de Atherton, juntamente com material de APS da macrorregião de Coff's Harbour, foi um dos que mais contribuíram para a ampla base genética da população-base. Foi possível detectar diferença estatística entre as populações selvagens das procedências de Atherton e Coff's Harbour, assim como entre essas procedências e a de Rio Claro.
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008-12-01
2014-05-20T13:20:28Z
2014-05-20T13:20:28Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622008000600001
Revista Árvore. Sociedade de Investigações Florestais, v. 32, n. 6, p. 961-967, 2008.
0100-6762
http://hdl.handle.net/11449/5714
10.1590/S0100-67622008000600001
S0100-67622008000600001
WOS:000265798000001
S0100-67622008000600001.pdf
4724674295725958
0165348738208319
0000-0003-4524-954X
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622008000600001
http://hdl.handle.net/11449/5714
identifier_str_mv Revista Árvore. Sociedade de Investigações Florestais, v. 32, n. 6, p. 961-967, 2008.
0100-6762
10.1590/S0100-67622008000600001
S0100-67622008000600001
WOS:000265798000001
S0100-67622008000600001.pdf
4724674295725958
0165348738208319
0000-0003-4524-954X
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv Revista Árvore
0.392
0,458
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 961-967
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade de Investigações Florestais
publisher.none.fl_str_mv Sociedade de Investigações Florestais
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808128363756257280