Caracterização do gene da proteína capsidial de dois isolados, patologicamente distintos e sorologicamente semelhantes, do Grapevine virus B em videiras no Estado de São Paulo
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2004 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000100011 http://hdl.handle.net/11449/22538 |
Resumo: | No presente trabalho, descreve-se a caracterização do gene codificador da proteína capsidial de dois isolados sintomatologicamente distintos do Grapevine virus B (GVB). Para isto, RNA totais foram extraídos de folhas e pecíolos de videiras (Vitis spp.) infetadas, cultivares Rubi (GVB-C SP) e Itália (GVB-I SP) e utilizados para amplificar, por RT/PCR, um fragmento entre as posições 6425 e 7118 (694 nucleotídeos, nt) do RNA do GVB (GenBank, acesso X75448). O fragmento obtido inclui o gene da proteína capsidial (594 nt) codificando 197 aminoácidos com massa molecular estimada em aproximadamente 21.600 Da. A seqüência do GVB-C SP apresentou maior similaridade de nucleotídeos e aminoácidos deduzidos com o isolado italiano (acesso X75448), enquanto que o GVB-I SP foi mais similar a um outro isolado brasileiro do GVB descrito no Rio Grande do Sul (GVB BR1, acesso AF438410). Os dois isolados paulistas do GVB podem ser diferenciados por digestão com a enzima de restrição EcoRI, uma vez que há um sítio interno no GVB-C SP que está ausente no isolado GVB-I SP. |
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Caracterização do gene da proteína capsidial de dois isolados, patologicamente distintos e sorologicamente semelhantes, do Grapevine virus B em videiras no Estado de São PauloCharacterization of the coat protein gene of two isolates, pathologically distinct and serologically similar, of Grapevine virus B in corky bark-affected grapevines in São Paulo State, BrazilVitivirusVitis spp.fendilhamento corticalgrapevine corky barkgrapevine rugose woodcomplexo do lenho rugosoNo presente trabalho, descreve-se a caracterização do gene codificador da proteína capsidial de dois isolados sintomatologicamente distintos do Grapevine virus B (GVB). Para isto, RNA totais foram extraídos de folhas e pecíolos de videiras (Vitis spp.) infetadas, cultivares Rubi (GVB-C SP) e Itália (GVB-I SP) e utilizados para amplificar, por RT/PCR, um fragmento entre as posições 6425 e 7118 (694 nucleotídeos, nt) do RNA do GVB (GenBank, acesso X75448). O fragmento obtido inclui o gene da proteína capsidial (594 nt) codificando 197 aminoácidos com massa molecular estimada em aproximadamente 21.600 Da. A seqüência do GVB-C SP apresentou maior similaridade de nucleotídeos e aminoácidos deduzidos com o isolado italiano (acesso X75448), enquanto que o GVB-I SP foi mais similar a um outro isolado brasileiro do GVB descrito no Rio Grande do Sul (GVB BR1, acesso AF438410). Os dois isolados paulistas do GVB podem ser diferenciados por digestão com a enzima de restrição EcoRI, uma vez que há um sítio interno no GVB-C SP que está ausente no isolado GVB-I SP.The present work describes the characterization of the coat protein gene of two isolates of Grapevine virus B (GVB), which can be differentiated by their biological behavior on some grape cultivars. The total RNA was extracted from leaves and petioles of infected grapevines (Vitis spp.) of the cultivars Rubi (GVB-C SP) and Italy (GVB-I SP) and used to amplify, by RT/PCR, a fragment between positions 6425 and 7118 (694 nucleotides, nt) of the genomic RNA (GenBank, access X75448). The fragment comprises the coat protein gene (594 nt) coding for 197 amino acids with a predicted Mr of 21,600 Da. The sequence of GVB-C SP showed a greater similarity of nucleotides and deduced amino acids with the Italian isolate (access X74448), while the GVB-I SP was similar to a Brazilian isolate described in the State of Rio Grande do Sul , Brazil (GVB BR1, access AF438410). The isolates GVB-C SP and GVB-I SP can be differentiated by digestion with the enzyme EcoRI, since this restriction site is present on the GVB-C SP but absent on GVB-I SP.Universidade Estadual Paulista Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas Departamento de Zoologia e BotânicaUniversidade de São Paulo Instituto de Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiros Departamento de Entomologia, Fitopatologia e Zoologia AgrícolaIAC-Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de FitossanidadeUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas Departamento de Zoologia e BotânicaSociedade Brasileira de FitopatologiaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Universidade de São Paulo (USP)IAC-Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de FitossanidadeMoreira, Andreia E [UNESP]Gaspar, José O [UNESP]Camargo, Luís Eduardo AKuniyuk, Hugo2014-05-20T14:04:13Z2014-05-20T14:04:13Z2004-02-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article75-79application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000100011Fitopatologia Brasileira. Sociedade Brasileira de Fitopatologia, v. 29, n. 1, p. 75-79, 2004.0100-4158http://hdl.handle.net/11449/2253810.1590/S0100-41582004000100011S0100-41582004000100011S0100-41582004000100011.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporFitopatologia Brasileirainfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-10-28T06:05:55Zoai:repositorio.unesp.br:11449/22538Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T16:13:37.062833Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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