Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Canduri, F. [UNESP]
Data de Publicação: 2003
Outros Autores: Silveira, N. J. F. da [UNESP], Camera Jr, J. C. [UNESP], Azevedo Jr, W. F. de
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-46702003000100006
http://hdl.handle.net/11449/22115
Resumo: O presente trabalho descreve modelos moleculares para os complexos binários CDK9, CDK5 e CDK1 complexados com Flavopiridol e Roscovitina. Esses modelos estruturais indicam que os inibidores ligam-se fortemente ao sítio de ligação de ATP das CDKs e comparações estruturais dos complexos CDK2-Flavopiridol e CDK2-Roscovitina relacionam diferenças estruturais com diferenças na inibição dessas CDKs por esses inibidores. Essas estruturas abrem a possibilidade de testar novas famílias de inibidores, em adição aos novos substituintes para as estruturas já conhecidas, tais como flavonas e derivados de adenina.
id UNSP_440f63d2049725774287c6416451e9d4
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/22115
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitorsEstudo de bioinformática estrutural de quinases dependentes de ciclinas complexadas com inibidoresCDKFlavopiridolBioinformaticsStructuredrug designCDKFlavopiridolBioinformáticaestruturadesenho de drogasO presente trabalho descreve modelos moleculares para os complexos binários CDK9, CDK5 e CDK1 complexados com Flavopiridol e Roscovitina. Esses modelos estruturais indicam que os inibidores ligam-se fortemente ao sítio de ligação de ATP das CDKs e comparações estruturais dos complexos CDK2-Flavopiridol e CDK2-Roscovitina relacionam diferenças estruturais com diferenças na inibição dessas CDKs por esses inibidores. Essas estruturas abrem a possibilidade de testar novas famílias de inibidores, em adição aos novos substituintes para as estruturas já conhecidas, tais como flavonas e derivados de adenina.The present work describes molecular models for the binary complexes CDK9, CDK5 and CDK1 complexed with Flavopiridol and Roscovitine. These structural models indicate that the inhibitors strongly bind to the ATP-binding pocket of CDKs and the structural comparison with the complexes CDK2:Flavopiridol and CDK2:Roscovitine correlates the structural differences with differences in inhibition of these CDKs by the inhibitors. These structures open the possibility of testing new inhibitor families, in addition to new substituents for the already known lead structures such as flavones and adenine derivatives.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)UNESP IBILCE Departamento de FísicaInstituto Butantan Center for Applied ToxinologyUNESP IBILCE Departamento de FísicaEditora UnespUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Instituto ButantanCanduri, F. [UNESP]Silveira, N. J. F. da [UNESP]Camera Jr, J. C. [UNESP]Azevedo Jr, W. F. de2014-05-20T14:02:46Z2014-05-20T14:02:46Z2003-01-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article45-53application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-46702003000100006Eclética Química. Fundação Editora da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP, v. 28, n. 1, p. 45-53, 2003.0100-4670http://hdl.handle.net/11449/2211510.1590/S0100-46702003000100006S0100-46702003000100006S0100-46702003000100006.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengEclética Químicainfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-11-13T06:11:22Zoai:repositorio.unesp.br:11449/22115Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T17:34:15.339785Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
Estudo de bioinformática estrutural de quinases dependentes de ciclinas complexadas com inibidores
title Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
spellingShingle Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
Canduri, F. [UNESP]
CDK
Flavopiridol
Bioinformatics
Structure
drug design
CDK
Flavopiridol
Bioinformática
estrutura
desenho de drogas
title_short Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
title_full Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
title_fullStr Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
title_full_unstemmed Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
title_sort Structural bioinformatics study of cyclin-dependent kinases complexed with inhibitors
author Canduri, F. [UNESP]
author_facet Canduri, F. [UNESP]
Silveira, N. J. F. da [UNESP]
Camera Jr, J. C. [UNESP]
Azevedo Jr, W. F. de
author_role author
author2 Silveira, N. J. F. da [UNESP]
Camera Jr, J. C. [UNESP]
Azevedo Jr, W. F. de
author2_role author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Instituto Butantan
dc.contributor.author.fl_str_mv Canduri, F. [UNESP]
Silveira, N. J. F. da [UNESP]
Camera Jr, J. C. [UNESP]
Azevedo Jr, W. F. de
dc.subject.por.fl_str_mv CDK
Flavopiridol
Bioinformatics
Structure
drug design
CDK
Flavopiridol
Bioinformática
estrutura
desenho de drogas
topic CDK
Flavopiridol
Bioinformatics
Structure
drug design
CDK
Flavopiridol
Bioinformática
estrutura
desenho de drogas
description O presente trabalho descreve modelos moleculares para os complexos binários CDK9, CDK5 e CDK1 complexados com Flavopiridol e Roscovitina. Esses modelos estruturais indicam que os inibidores ligam-se fortemente ao sítio de ligação de ATP das CDKs e comparações estruturais dos complexos CDK2-Flavopiridol e CDK2-Roscovitina relacionam diferenças estruturais com diferenças na inibição dessas CDKs por esses inibidores. Essas estruturas abrem a possibilidade de testar novas famílias de inibidores, em adição aos novos substituintes para as estruturas já conhecidas, tais como flavonas e derivados de adenina.
publishDate 2003
dc.date.none.fl_str_mv 2003-01-01
2014-05-20T14:02:46Z
2014-05-20T14:02:46Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-46702003000100006
Eclética Química. Fundação Editora da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP, v. 28, n. 1, p. 45-53, 2003.
0100-4670
http://hdl.handle.net/11449/22115
10.1590/S0100-46702003000100006
S0100-46702003000100006
S0100-46702003000100006.pdf
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-46702003000100006
http://hdl.handle.net/11449/22115
identifier_str_mv Eclética Química. Fundação Editora da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP, v. 28, n. 1, p. 45-53, 2003.
0100-4670
10.1590/S0100-46702003000100006
S0100-46702003000100006
S0100-46702003000100006.pdf
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv Eclética Química
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 45-53
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Editora Unesp
publisher.none.fl_str_mv Editora Unesp
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808128828035301376

Registros relacionados