Eutrofização e diversidade da fauna em estuários: uma investigação combinada de DNA ambiental e parâmetros limnológicos

• Autor(a) principal: Mota, Arthur Padial
• Data de Publicação: 2024
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: https://hdl.handle.net/11449/256468
• topic: DNA ambiental; Estuários; Eutrofização

Nas últimas décadas, os ecossistemas costeiros, que caracteristicamente apresentam vasta riqueza de espécies, vêm sofrendo com diversas mudanças ambientais devido à ação antrópica, levando à perda de biodiversidade. Nesse contexto, o amplo levantamento de espécies que habitam essas áreas de transição entre rios e mares é um passo fundamental para sua preservação. Contudo, em se tratando de ambientes marinhos e costeiros, os métodos tradicionais para estudo da composição da fauna demandam alto custo, além das dificuldades para coleta dos animais e seu caráter invasivo. O DNA ambiental (eDNA) surge então como uma alternativa mais eficiente, principalmente associado ao sequenciamento em larga escala (eDNA metabarcoding) para a identificação de amplo espectro da fauna aquática. No entanto, as metodologias e estratégias para inventário da fauna baseadas em eDNA frequentemente necessitam de aprimoramento e padronização de acordo com o contexto ambiental estudado. No presente trabalho buscou-se caracterizar regiões estuarinas sujeitas a diferentes níveis de ocupação antrópica quanto a variáveis limnológicas, assim como testar e otimizar metodologia baseada na análise do eDNA para estudo da biodiversidade de peixes. Para isso, amostras independentes de água para as análises genéticas e das variáveis ambientais foram coletadas ao longo de transecto nos estuários do Rio Juqueriquerê, em Caraguatatuba, e do Rio Escuro, em Ubatuba, áreas de maior e menor ocupação antrópica, respectivamente. Métodos de filtração de alta sensibilidade foram empregados para isolar quantificar e avaliar a qualidade do eDNA recuperado. Para identificação molecular dos peixes, fragmento do gene ribossomal 12S (12S rRNA) do DNA mitocondrial foi amplificado por PCR. Paralelamente, analisamos diversos parâmetros limnológicos de interesse, incluindo clorofila a, fósforo total e sólidos totais, além de outras variáveis medidas com sonda multiparâmetro. Os resultados mostram que o estuário do rio Juquriquerê apresentou elevada eutrofização em relação a região estuarina do rio Escuro, bem como níveis significativamente inferiores de oxigênio dissolvido e níveis mais elevados de fósforo e clorofila a, variáveis diretamente relacionadas com a eutrofização de ambientes aquáticos. Indicando maior deterioração do ambiente, comprovando o contraste das regiões e a influência da antropização sobre as variáveis ambientais da água. Para a obtenção de eDNA a metodologia associada a coleta com os filtros Sterivex™ se mostram mais eficientes do que os de nitrocelulose, nos permitindo o adequando isolamento do material genético após a extração e sucesso na amplificação por PCR do gene 12s rRNA de peixes. Dificuldades foram encontradas principalmente em relação a filtragem da água, em que por vezes os filtros entupiam durante o processo e para a adequada amplificação do eDNA dos filtros de nitrocelulose, que pode ter interferência de inibidores. De modo geral, concluímos que a análise do eDNA tem potencial para ser utilizada como estratégia para inventário de fauna nesses locais, a partir do estabelecimento de metodologia adequada, principalmente nas etapas cruciais de filtragem, extração e amplificação. Associado a análises da qualidade da água e possíveis impactos ambientais nesses ambientes o eDNA se torna uma ferramenta que possibilita diversos trabalhos futuros voltados à conservação da biodiversidade de regiões estuarinas.