Análise da variabilidade genética de acessos de Psidium spp. (Myrtaceae) avaliados quanto à reação a Meloidogyne enterolobii¹

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Eduardo José
Data de Publicação: 2012
Outros Autores: Wickert, Ester, Santos, Jaime Maia [UNESP], Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452012000200027
http://hdl.handle.net/11449/212565
Resumo: This study aimed to characterize molecular of 13 accessions of Psidium spp. (Myrtaceae) that was been identified for the reaction to rootknot guava nematode. The DNA extraction of the samples was carried according to the protocol of Shillito & Saul (1988). The molecular markers type fAFLP, were obtained from 'fAFLP Regular Plant Genomes Fingerprinting Kit' (Applied Biosystems from Brasil Ltda.) and were tested 24 selectives combinations of primers, of which 18 showed amplification that produced 272 polymorphic markers. To the analysis of the markers were employed the softwares GeneScan (ABI Prism versão 1.0) and Genotyper (ABI Prism version 1.03), and the data collected were transformed into a binary matrix that was analyzed in the software PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parcimony - version 3.01). Were calculated genetic distance índex intra and interespecific between the genotipes. It was found that the AFLP markers were efficient in the discrimination between accessions, as well as in showing genetic similarity among accessions identified as resistant to the nematode Meloidogyne enterolobii, which could be discussed in the future.
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spelling Análise da variabilidade genética de acessos de Psidium spp. (Myrtaceae) avaliados quanto à reação a Meloidogyne enterolobii¹Analysis of genetic variability of Psidium spp. (Myrtaceae) access evaluated for resistant to Meloidogyne enterolobiidisease resistancetropical fruitPsidium guajavaroot knot nematodesgenetic markerresistência de plantas a doençasfruta tropicalPsidium guajavanematoide de galhamarcadores genéticosThis study aimed to characterize molecular of 13 accessions of Psidium spp. (Myrtaceae) that was been identified for the reaction to rootknot guava nematode. The DNA extraction of the samples was carried according to the protocol of Shillito & Saul (1988). The molecular markers type fAFLP, were obtained from 'fAFLP Regular Plant Genomes Fingerprinting Kit' (Applied Biosystems from Brasil Ltda.) and were tested 24 selectives combinations of primers, of which 18 showed amplification that produced 272 polymorphic markers. To the analysis of the markers were employed the softwares GeneScan (ABI Prism versão 1.0) and Genotyper (ABI Prism version 1.03), and the data collected were transformed into a binary matrix that was analyzed in the software PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parcimony - version 3.01). Were calculated genetic distance índex intra and interespecific between the genotipes. It was found that the AFLP markers were efficient in the discrimination between accessions, as well as in showing genetic similarity among accessions identified as resistant to the nematode Meloidogyne enterolobii, which could be discussed in the future.Este trabalho teve por objetivo a caracterização molecular de 13 acessos de Psidium spp. (Myrtaceae) identificados previamente quanto à reação ao nematoide da goiabeira. A extração do DNA das amostras foi executada conforme o protocolo de Shillito e Saul (1988). Os marcadores moleculares do tipo fAFLP, foram obtidos utilizando-se do 'fAFLP Regular Plant Genomes Fingerprinting Kit' (Applied Biosystems do Brasil Ltda.) onde foram testadas 24 combinações seletivas de primers, das quais 18 apresentaram amplificação que gerou 272 marcadores polimórficos. Para a análise dos marcadores, foram utilizados os softwares GeneScan (ABI Prism versão 1.0) e Genotyper (ABI Prism versão 1.03), e os dados coletados foram transformados em matriz binária que foi analisada no software PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parcimony - versão 3.01). Foram também calculados índices de distância genética intra e interespecífica entre os materiais. Verificou-se que os marcadores AFLP foram eficientes na discriminação dos acessos entre si, bem como apontou similaridade genética entre os acessos identificados como resistentes ao nematoide Meloidogyne enterolobii, característica esta passível de exploração no futuro.Universidade Federal de São Carlos, Centro de Ciências AgráriasUniversidade Estadual Paulista, FcavUniversidade Estadual Paulista, FCAVEmpresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa CatarinaUniversidade Estadual Paulista, FcavUniversidade Estadual Paulista, FCAVSociedade Brasileira de FruticulturaUniversidade Federal de São CarlosUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa CatarinaAlmeida, Eduardo JoséWickert, EsterSantos, Jaime Maia [UNESP]Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]2021-07-14T10:41:58Z2021-07-14T10:41:58Z2012-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article532-539application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452012000200027Revista Brasileira de Fruticultura. Jaboticabal, SP, Brazil: Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 34, n. 2, p. 532-539, 2012.0100-29451806-9967http://hdl.handle.net/11449/21256510.1590/S0100-29452012000200027S0100-29452012000200027S0100-29452012000200027.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporRevista Brasileira de Fruticulturainfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-06-07T13:56:01Zoai:repositorio.unesp.br:11449/212565Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-06-07T13:56:01Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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Revista Brasileira de Fruticultura. Jaboticabal, SP, Brazil: Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 34, n. 2, p. 532-539, 2012.
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