Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ferro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: Barros, Neli Martins de [UNESP], Dabbas, Karina Maia [UNESP], Laia, Marcelo Luiz de [UNESP], Kupper, Katia Cristina [UNESP], Moraes, Vicente Alberto de, Oliveira, Julio Cezar Franco de [UNESP], Ferro, Jesus Aparecido [UNESP], Zingaretti, Sonia Maria [UNESP]
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052007000200010
http://hdl.handle.net/11449/4004
Resumo: Utilizando a técnica de macroarranjos de cDNA em membranas de náilon, analisou-se o perfil de expressão de 3.575 ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana-de-açúcar, oriundas do projeto SUCEST, em duas variedades, uma tolerante (SP80-0185) e outra suscetível (SP70-3370) ao Raquitismo da Soqueira. Foram analisadas amostras foliares de plantas inoculadas com Leifsonia xyli subsp. xyli., agente etiológico do Raquitismo, contrastadas com plantas não inoculadas (controle), para cada variedade, marcadas com sondas de cDNA e hibridizadas contra os macroarranjos. Após as hibridizações e análises estatísticas dos dados foi possível identificar 49 ESTs com expressão alterada, sendo 44 na variedade tolerante (41 ESTs induzidos e 3 reprimidos) e 5 na variedade suscetível (2 ESTs induzidos e 3 reprimidos). Os resultados obtidos sugerem que a tolerância da variedade SP80-0185 de cana-de-açúcar à bactéria fitopatogênica pode estar relacionada com a percepção de sinais extracelulares, visto que ESTs relacionados a vias de transdução de sinais apresentaram expressão gênica induzida na variedade tolerante, os quais codificam para uma EST com similaridade à H+-ATPase da membrana plasmática, fatores de transcrição G-box, OsNAC6, DNA binding, família MYB e Zinc Finger e ainda uma EST com similaridade ao fator de ligação ao G-Box, o qual corresponde a uma seqüência de DNA cis presente em vários promotores de plantas e requerido para o reconhecimento de muitos estímulos ambientais. Na variedade suscetível foi reprimido uma EST com similaridade à lipase. Esta enzima, também de membrana, faz parte da síntese do jasmonato, o qual ativa as defesas vegetais contra patógenos de plantas. Possíveis funções para os genes induzidos ou reprimidos nas cultivares de cana tolerante ou resistente ao Raquitismo são discutidas neste trabalho.
id UNSP_7e9dd7203e4008ffcb972ad8002d61d9
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/4004
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyliDifferential gene expression in sugar cane infected by Leifsonia xyli subsp: xylicDNA macroarrayPlant-pathogen interactionratoon stunting diseaseSugarcanemacroarranjos de cDNAinteração planta-patógenoCana-de-açúcarraquitismo da soqueiraUtilizando a técnica de macroarranjos de cDNA em membranas de náilon, analisou-se o perfil de expressão de 3.575 ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana-de-açúcar, oriundas do projeto SUCEST, em duas variedades, uma tolerante (SP80-0185) e outra suscetível (SP70-3370) ao Raquitismo da Soqueira. Foram analisadas amostras foliares de plantas inoculadas com Leifsonia xyli subsp. xyli., agente etiológico do Raquitismo, contrastadas com plantas não inoculadas (controle), para cada variedade, marcadas com sondas de cDNA e hibridizadas contra os macroarranjos. Após as hibridizações e análises estatísticas dos dados foi possível identificar 49 ESTs com expressão alterada, sendo 44 na variedade tolerante (41 ESTs induzidos e 3 reprimidos) e 5 na variedade suscetível (2 ESTs induzidos e 3 reprimidos). Os resultados obtidos sugerem que a tolerância da variedade SP80-0185 de cana-de-açúcar à bactéria fitopatogênica pode estar relacionada com a percepção de sinais extracelulares, visto que ESTs relacionados a vias de transdução de sinais apresentaram expressão gênica induzida na variedade tolerante, os quais codificam para uma EST com similaridade à H+-ATPase da membrana plasmática, fatores de transcrição G-box, OsNAC6, DNA binding, família MYB e Zinc Finger e ainda uma EST com similaridade ao fator de ligação ao G-Box, o qual corresponde a uma seqüência de DNA cis presente em vários promotores de plantas e requerido para o reconhecimento de muitos estímulos ambientais. Na variedade suscetível foi reprimido uma EST com similaridade à lipase. Esta enzima, também de membrana, faz parte da síntese do jasmonato, o qual ativa as defesas vegetais contra patógenos de plantas. Possíveis funções para os genes induzidos ou reprimidos nas cultivares de cana tolerante ou resistente ao Raquitismo são discutidas neste trabalho.The macroarray nylon membrane technology was used to study the differential gene expression of 3.575 ESTs clones from sugarcane libraries. Total RNA was extracted from two varieties, one known as tolerant (SP80-0185) and another known as susceptible (SP70-3370) to the ratoon stunting disease (RSD), after being inoculated with Lefsonia xyli subsp. xyli bacterial extracts, and used as probe. Out of the 3.575 ESTs, 49 showed differential expression levels. Most of the selected ESTs were found in the resistant variety, 41 being induced and 3 being repressed in response to bacterial inoculation. on the other hand, the susceptible variety showed only 5 differentially expressed genes, 2 being induced and 3 being repressed. These results indicate that the tolerance to bacterial infection could be associated to extracellular signal perception because ESTs associated to signal transduction pathways were induced in the variety SP80-185, e.g. plasma membrane H+ ATPase EST. Also, ESTs related to transcription factor expression, such as G-box, OsNAC6, DNA binding, MYB family, Zinc Finger were induced in the tolerant variety after infection. An EST with high similarity to G-Box binding factor, a cis-DNA sequence present in some plant promoter genes required to signal transduction for environmental signals, was also induced. Even though the susceptible variety had no significant difference in gene expression, a lipase-like EST was repressed when plants were infected. Lipase, a membrane enzyme, is also involved in jasmonate biosynthesis, which plays a major role in plant defense mechanisms. Putative roles for induced and repressed genes in both tolerant and susceptible varieties are discussed here.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade Estadual PaulistaInstituto BiológicoCentro de Tecnologia CanavieiraUniversidade Estadual PaulistaGrupo Paulista de FitopatologiaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Instituto BiológicoCentro de Tecnologia CanavieiraFerro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]Barros, Neli Martins de [UNESP]Dabbas, Karina Maia [UNESP]Laia, Marcelo Luiz de [UNESP]Kupper, Katia Cristina [UNESP]Moraes, Vicente Alberto deOliveira, Julio Cezar Franco de [UNESP]Ferro, Jesus Aparecido [UNESP]Zingaretti, Sonia Maria [UNESP]2014-05-20T13:17:35Z2014-05-20T13:17:35Z2007-06-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article157-166application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052007000200010Summa Phytopathologica. Grupo Paulista de Fitopatologia, v. 33, n. 2, p. 157-166, 2007.0100-5405http://hdl.handle.net/11449/400410.1590/S0100-54052007000200010S0100-54052007000200010S0100-54052007000200010.pdf01472417236124647587208482384059SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporSumma Phytopathologica0,258info:eu-repo/semantics/openAccess2023-10-22T06:08:51Zoai:repositorio.unesp.br:11449/4004Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-10-22T06:08:51Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
Differential gene expression in sugar cane infected by Leifsonia xyli subsp: xyli
title Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
spellingShingle Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
Ferro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
cDNA macroarray
Plant-pathogen interaction
ratoon stunting disease
Sugarcane
macroarranjos de cDNA
interação planta-patógeno
Cana-de-açúcar
raquitismo da soqueira
title_short Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
title_full Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
title_fullStr Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
title_full_unstemmed Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
title_sort Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli
author Ferro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
author_facet Ferro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
Barros, Neli Martins de [UNESP]
Dabbas, Karina Maia [UNESP]
Laia, Marcelo Luiz de [UNESP]
Kupper, Katia Cristina [UNESP]
Moraes, Vicente Alberto de
Oliveira, Julio Cezar Franco de [UNESP]
Ferro, Jesus Aparecido [UNESP]
Zingaretti, Sonia Maria [UNESP]
author_role author
author2 Barros, Neli Martins de [UNESP]
Dabbas, Karina Maia [UNESP]
Laia, Marcelo Luiz de [UNESP]
Kupper, Katia Cristina [UNESP]
Moraes, Vicente Alberto de
Oliveira, Julio Cezar Franco de [UNESP]
Ferro, Jesus Aparecido [UNESP]
Zingaretti, Sonia Maria [UNESP]
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Instituto Biológico
Centro de Tecnologia Canavieira
dc.contributor.author.fl_str_mv Ferro, Maria Inês Tiraboschi [UNESP]
Barros, Neli Martins de [UNESP]
Dabbas, Karina Maia [UNESP]
Laia, Marcelo Luiz de [UNESP]
Kupper, Katia Cristina [UNESP]
Moraes, Vicente Alberto de
Oliveira, Julio Cezar Franco de [UNESP]
Ferro, Jesus Aparecido [UNESP]
Zingaretti, Sonia Maria [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv cDNA macroarray
Plant-pathogen interaction
ratoon stunting disease
Sugarcane
macroarranjos de cDNA
interação planta-patógeno
Cana-de-açúcar
raquitismo da soqueira
topic cDNA macroarray
Plant-pathogen interaction
ratoon stunting disease
Sugarcane
macroarranjos de cDNA
interação planta-patógeno
Cana-de-açúcar
raquitismo da soqueira
description Utilizando a técnica de macroarranjos de cDNA em membranas de náilon, analisou-se o perfil de expressão de 3.575 ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana-de-açúcar, oriundas do projeto SUCEST, em duas variedades, uma tolerante (SP80-0185) e outra suscetível (SP70-3370) ao Raquitismo da Soqueira. Foram analisadas amostras foliares de plantas inoculadas com Leifsonia xyli subsp. xyli., agente etiológico do Raquitismo, contrastadas com plantas não inoculadas (controle), para cada variedade, marcadas com sondas de cDNA e hibridizadas contra os macroarranjos. Após as hibridizações e análises estatísticas dos dados foi possível identificar 49 ESTs com expressão alterada, sendo 44 na variedade tolerante (41 ESTs induzidos e 3 reprimidos) e 5 na variedade suscetível (2 ESTs induzidos e 3 reprimidos). Os resultados obtidos sugerem que a tolerância da variedade SP80-0185 de cana-de-açúcar à bactéria fitopatogênica pode estar relacionada com a percepção de sinais extracelulares, visto que ESTs relacionados a vias de transdução de sinais apresentaram expressão gênica induzida na variedade tolerante, os quais codificam para uma EST com similaridade à H+-ATPase da membrana plasmática, fatores de transcrição G-box, OsNAC6, DNA binding, família MYB e Zinc Finger e ainda uma EST com similaridade ao fator de ligação ao G-Box, o qual corresponde a uma seqüência de DNA cis presente em vários promotores de plantas e requerido para o reconhecimento de muitos estímulos ambientais. Na variedade suscetível foi reprimido uma EST com similaridade à lipase. Esta enzima, também de membrana, faz parte da síntese do jasmonato, o qual ativa as defesas vegetais contra patógenos de plantas. Possíveis funções para os genes induzidos ou reprimidos nas cultivares de cana tolerante ou resistente ao Raquitismo são discutidas neste trabalho.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007-06-01
2014-05-20T13:17:35Z
2014-05-20T13:17:35Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052007000200010
Summa Phytopathologica. Grupo Paulista de Fitopatologia, v. 33, n. 2, p. 157-166, 2007.
0100-5405
http://hdl.handle.net/11449/4004
10.1590/S0100-54052007000200010
S0100-54052007000200010
S0100-54052007000200010.pdf
0147241723612464
7587208482384059
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052007000200010
http://hdl.handle.net/11449/4004
identifier_str_mv Summa Phytopathologica. Grupo Paulista de Fitopatologia, v. 33, n. 2, p. 157-166, 2007.
0100-5405
10.1590/S0100-54052007000200010
S0100-54052007000200010
S0100-54052007000200010.pdf
0147241723612464
7587208482384059
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Summa Phytopathologica
0,258
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 157-166
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Grupo Paulista de Fitopatologia
publisher.none.fl_str_mv Grupo Paulista de Fitopatologia
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799964657123852288