Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Moreira, Andreia E. [UNESP]
Data de Publicação: 2004
Outros Autores: Gaspar, José O. [UNESP], Camargo, Luis E. A., Kuniyuki, Hugo
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000200015
http://hdl.handle.net/11449/22510
Resumo: O presente trabalho caracteriza o gene codificador da proteína capsidial do isolado do Grapevine virus A (GVA) encontrado no Estado de São Paulo (GVA-SP). RNA total foi extraído de folhas e pecíolos de plantas de videira (Vitis spp.) da variedade 'Kober 5BB' e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar um fragmento entre as posições 6409 e 7175 do RNA do GVA (GenBank, acesso X75433). Foi obtido um fragmento de tamanho esperado (767 nt) que inclui o gene da proteína capsidial, codificando 198 aminoácidos. A seqüência do GVA-SP apresentou similaridade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 86-92,3% e 94,5-98% com isolados do GVA da Europa, África e Japão (Acessos X75433, AF441234, AF007415, AB039841) e da região Sul do Brasil (Acesso AF494187), sendo, entretanto, mais similar aos isolados africano e italiano.
id UNSP_89a0950ed176f34903a827c3b3ecf19e
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/22510
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São PauloCharacterization of the coat protein gene of Grapevine virus A from Kober stem grooving-affected grapevines in the State of São Paulo, BrazilGVAVitivirusVitis spp.Kober stem groovingcomplexo do lenho rugososeqüenciamentoFilogeniaO presente trabalho caracteriza o gene codificador da proteína capsidial do isolado do Grapevine virus A (GVA) encontrado no Estado de São Paulo (GVA-SP). RNA total foi extraído de folhas e pecíolos de plantas de videira (Vitis spp.) da variedade 'Kober 5BB' e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar um fragmento entre as posições 6409 e 7175 do RNA do GVA (GenBank, acesso X75433). Foi obtido um fragmento de tamanho esperado (767 nt) que inclui o gene da proteína capsidial, codificando 198 aminoácidos. A seqüência do GVA-SP apresentou similaridade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 86-92,3% e 94,5-98% com isolados do GVA da Europa, África e Japão (Acessos X75433, AF441234, AF007415, AB039841) e da região Sul do Brasil (Acesso AF494187), sendo, entretanto, mais similar aos isolados africano e italiano.We report the characterization of the coat protein gene of a Brazilian isolate of Grapevine virus A (GVA-SP). Total RNA was extracted from leaves and petioles of GVA infected plants of the grape (Vitis spp.) variety 'Kober 5BB' and subjected to RT-PCR using primers designed to amplify a fragment between positions 6409 and 7175 of the GVA RNA (GenBank Accession X75433). A fragment of the expected size (767 nt) was obtained which included the coat protein gene coding for 198 amino acids. The GVA-SP sequence displayed nucleotide and amino acid similarity of, respectively, 86-92.3% and 94.5-98% with GVA isolates from Europe, Africa and Japan (Accessions X75433, AF441234, AF007415, AB039841) and Southern Brazil (Accession AF494187). The highest identity, however, was with the African and Italian isolates.Universidade Estadual Paulista Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas Departamento de Zoologia e BotânicaUniversidade de são Paulo Escola Superior de Agricultura Luis de Queiroz Departamento de Entomologia, Fitopatologia e Zoologia AgrícolaInstituto Agronômico de Campinas Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de FitossanidadeUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas Departamento de Zoologia e BotânicaSociedade Brasileira de FitopatologiaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Universidade de São Paulo (USP)Instituto Agronômico (IAC)Moreira, Andreia E. [UNESP]Gaspar, José O. [UNESP]Camargo, Luis E. A.Kuniyuki, Hugo2014-05-20T14:04:03Z2014-05-20T14:04:03Z2004-04-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article205-208application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000200015Fitopatologia Brasileira. Sociedade Brasileira de Fitopatologia, v. 29, n. 2, p. 205-208, 2004.0100-4158http://hdl.handle.net/11449/2251010.1590/S0100-41582004000200015S0100-41582004000200015S0100-41582004000200015.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporFitopatologia Brasileirainfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-01-08T06:23:26Zoai:repositorio.unesp.br:11449/22510Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T22:24:40.226494Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
Characterization of the coat protein gene of Grapevine virus A from Kober stem grooving-affected grapevines in the State of São Paulo, Brazil
title Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
spellingShingle Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
Moreira, Andreia E. [UNESP]
GVA
Vitivirus
Vitis spp.
Kober stem grooving
complexo do lenho rugoso
seqüenciamento
Filogenia
title_short Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
title_full Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
title_fullStr Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
title_full_unstemmed Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
title_sort Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo
author Moreira, Andreia E. [UNESP]
author_facet Moreira, Andreia E. [UNESP]
Gaspar, José O. [UNESP]
Camargo, Luis E. A.
Kuniyuki, Hugo
author_role author
author2 Gaspar, José O. [UNESP]
Camargo, Luis E. A.
Kuniyuki, Hugo
author2_role author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Universidade de São Paulo (USP)
Instituto Agronômico (IAC)
dc.contributor.author.fl_str_mv Moreira, Andreia E. [UNESP]
Gaspar, José O. [UNESP]
Camargo, Luis E. A.
Kuniyuki, Hugo
dc.subject.por.fl_str_mv GVA
Vitivirus
Vitis spp.
Kober stem grooving
complexo do lenho rugoso
seqüenciamento
Filogenia
topic GVA
Vitivirus
Vitis spp.
Kober stem grooving
complexo do lenho rugoso
seqüenciamento
Filogenia
description O presente trabalho caracteriza o gene codificador da proteína capsidial do isolado do Grapevine virus A (GVA) encontrado no Estado de São Paulo (GVA-SP). RNA total foi extraído de folhas e pecíolos de plantas de videira (Vitis spp.) da variedade 'Kober 5BB' e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar um fragmento entre as posições 6409 e 7175 do RNA do GVA (GenBank, acesso X75433). Foi obtido um fragmento de tamanho esperado (767 nt) que inclui o gene da proteína capsidial, codificando 198 aminoácidos. A seqüência do GVA-SP apresentou similaridade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 86-92,3% e 94,5-98% com isolados do GVA da Europa, África e Japão (Acessos X75433, AF441234, AF007415, AB039841) e da região Sul do Brasil (Acesso AF494187), sendo, entretanto, mais similar aos isolados africano e italiano.
publishDate 2004
dc.date.none.fl_str_mv 2004-04-01
2014-05-20T14:04:03Z
2014-05-20T14:04:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000200015
Fitopatologia Brasileira. Sociedade Brasileira de Fitopatologia, v. 29, n. 2, p. 205-208, 2004.
0100-4158
http://hdl.handle.net/11449/22510
10.1590/S0100-41582004000200015
S0100-41582004000200015
S0100-41582004000200015.pdf
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-41582004000200015
http://hdl.handle.net/11449/22510
identifier_str_mv Fitopatologia Brasileira. Sociedade Brasileira de Fitopatologia, v. 29, n. 2, p. 205-208, 2004.
0100-4158
10.1590/S0100-41582004000200015
S0100-41582004000200015
S0100-41582004000200015.pdf
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Fitopatologia Brasileira
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 205-208
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Fitopatologia
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Fitopatologia
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808129424808214528

Registros relacionados