Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Tanamati, Fernanda
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/153143
Resumo: A mastite em búfalas leiteiras causa perdas econômicas devido à diminuição da produção de leite, além de ter um efeito negativo no bem-estar dos animais. Deste modo, foram realizados dois estudos: o objetivo do estudo I foi avaliar o nível de expressão dos genes da lactoferrina (LTF), fator de necrose tumoral alfa (TNF-α), interleucina-1 beta (IL-1β), interleucina-8 (IL-8), e toll-like receptors 2 (TLR-2) e 4 (TLR-4) em búfalas Murrah com e sem mastite subclínica. Amostras de leite de 12 búfalas com mastite e 12 de búfalas sem mastite foram coletadas, para a extração de RNA, síntese de cDNA e validação dos perfis de expressão por qRT-PCR. O ΔΔCt foi estimado utilizando contrastes ortogonais da expressão dos genes alvo corrigidos para a expressão dos genes housekeeping entre os tratamentos. A expressão dos genes TLR-2, TLR-4, TNF-α, IL-1β e IL-8 foi regulada positivamente em búfalos com mastite, enquanto que o gene LTF não apresentou expressão diferencial. O estudo desses genes da função imune que são ativos na glândula mamária é importante para o desenvolvimento de estratégias destinadas a preservar a saúde do úbere. O objetivo do estudo II foi avaliar as proteínas presentes no soro do leite de búfalas com e sem mastite subclínica, utilizando uma abordagem proteômica para identificar proteínas diferencialmente expressas e potencial biomarcador para a doença. Para isso, 16 amostras de leite de búfalas Murrah foram coletadas, sendo oito animais com e oito animais sem mastite subclínica. O método contagem espectral foi utilizado para quantificar a abundância relativa das proteínas individuais e os bancos de dados de proteínas anotadas para Bubalus bubalis e para Bos taurus foram utilizados na análise. Após integração das anotações genéticas das referências de búfalos e bovinos, foram identificadas 1.033 proteínas, das quais 156 proteínas foram diferencialmente reguladas entre animais sadios e infectados. Foram identificados 18 processos biológicos nos quais essas proteínas participam e a catelicidina-3 foi identificada como um potencial biomarcador da mastite subclínica. Os resultados são importantes para compreender melhor o comportamento da mastite na glândula mamária das búfalas e, portanto, podem auxiliar no diagnóstico precoce da doença.
id UNSP_a53dd3624e70032cd110c99bcbc01ab6
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/153143
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínicaDifferential gene expression and analysis of milk proteins from dairy buffalo with and without subclinical mastitisBubalus bubalisglândula mamáriaLC/MS-MSproteômicaqRT-PCRmammary glandproteomicA mastite em búfalas leiteiras causa perdas econômicas devido à diminuição da produção de leite, além de ter um efeito negativo no bem-estar dos animais. Deste modo, foram realizados dois estudos: o objetivo do estudo I foi avaliar o nível de expressão dos genes da lactoferrina (LTF), fator de necrose tumoral alfa (TNF-α), interleucina-1 beta (IL-1β), interleucina-8 (IL-8), e toll-like receptors 2 (TLR-2) e 4 (TLR-4) em búfalas Murrah com e sem mastite subclínica. Amostras de leite de 12 búfalas com mastite e 12 de búfalas sem mastite foram coletadas, para a extração de RNA, síntese de cDNA e validação dos perfis de expressão por qRT-PCR. O ΔΔCt foi estimado utilizando contrastes ortogonais da expressão dos genes alvo corrigidos para a expressão dos genes housekeeping entre os tratamentos. A expressão dos genes TLR-2, TLR-4, TNF-α, IL-1β e IL-8 foi regulada positivamente em búfalos com mastite, enquanto que o gene LTF não apresentou expressão diferencial. O estudo desses genes da função imune que são ativos na glândula mamária é importante para o desenvolvimento de estratégias destinadas a preservar a saúde do úbere. O objetivo do estudo II foi avaliar as proteínas presentes no soro do leite de búfalas com e sem mastite subclínica, utilizando uma abordagem proteômica para identificar proteínas diferencialmente expressas e potencial biomarcador para a doença. Para isso, 16 amostras de leite de búfalas Murrah foram coletadas, sendo oito animais com e oito animais sem mastite subclínica. O método contagem espectral foi utilizado para quantificar a abundância relativa das proteínas individuais e os bancos de dados de proteínas anotadas para Bubalus bubalis e para Bos taurus foram utilizados na análise. Após integração das anotações genéticas das referências de búfalos e bovinos, foram identificadas 1.033 proteínas, das quais 156 proteínas foram diferencialmente reguladas entre animais sadios e infectados. Foram identificados 18 processos biológicos nos quais essas proteínas participam e a catelicidina-3 foi identificada como um potencial biomarcador da mastite subclínica. Os resultados são importantes para compreender melhor o comportamento da mastite na glândula mamária das búfalas e, portanto, podem auxiliar no diagnóstico precoce da doença.Mastitis in dairy buffalo causes economic losses due to decreased milk production, along with having a negative effect on the animals’ welfare. Thus, two studies were performed: the objective of study I was to evaluate the expression levels of lactoferrin (LTF), tumor necrosis factor alpha (TNF-α), interleukin-1 beta (IL-1β), interleukin- 8 (IL-8) and toll-like receptors 2 (TLR-2) and 4 (TLR-4) in Murrah buffaloes with and without subclinical mastitis. Milk samples were collected from 12 buffaloes with mastitis and 12 buffaloes without mastitis for RNA extraction, cDNA synthesis, and validation of expression profiles by qRT-PCR. The ΔΔCt was estimated using orthogonal contrasts of the target genes expression adjusted for the expression of the housekeeping genes between both treatments. The expression of the TLR-2, TLR-4, TNF-α, IL-1β and IL-8 genes were upregulated in buffaloes with mastitis, while the LTF gene showed no differential expression. The study of these immune function genes that are active in the mammary gland is important for the development of strategies aimed at preserving the health of the udder. The objective of study II was to evaluate the proteins present in the milk whey from buffaloes with and without subclinical mastitis, using a proteomic approach to identify differentially expressed proteins and potential biomarkers for the disease. For this, 16 samples of Murrah buffalo milk were collected, comprised of eight animals with and eight animals without subclinical mastitis. The spectral counting method was used to quantify the relative abundance of the individual proteins, and the databases of proteins annotated for Bubalus bubalis and for Bos taurus were used in the analysis. After integrating the gene annotations from the buffalo and bovine references, a total of 1,033 proteins were identified, of which 156 proteins were differentially regulated between healthy and affected animals. 18 biological processes in which these proteins participate were identified, and cathelicidin-3 was identified as a potential biomarker of subclinical mastitis. These results are important to better understand the behavior of mastitis in the buffalo mammary gland, and in turn may aid in the early diagnosis.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 14/19321-4FAPESP: 14/25309-7FAPESP: 16/10526-8Universidade Estadual Paulista (Unesp)Tonhati, Humberto [UNESP]Stafuzza, Nedenia Bonvino [UNESP]Gimenez, Daniele FernandaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Tanamati, Fernanda2018-03-22T10:54:04Z2018-03-22T10:54:04Z2018-02-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/15314300089867733004102002P0porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2023-11-25T06:19:29Zoai:repositorio.unesp.br:11449/153143Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-11-25T06:19:29Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
Differential gene expression and analysis of milk proteins from dairy buffalo with and without subclinical mastitis
title Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
spellingShingle Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
Tanamati, Fernanda
Bubalus bubalis
glândula mamária
LC/MS-MS
proteômica
qRT-PCR
mammary gland
proteomic
title_short Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
title_full Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
title_fullStr Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
title_full_unstemmed Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
title_sort Expressão gênica diferencial e análise protéica do leite de búfalas sadias e com mastite subclínica
author Tanamati, Fernanda
author_facet Tanamati, Fernanda
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Tonhati, Humberto [UNESP]
Stafuzza, Nedenia Bonvino [UNESP]
Gimenez, Daniele Fernanda
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Tanamati, Fernanda
dc.subject.por.fl_str_mv Bubalus bubalis
glândula mamária
LC/MS-MS
proteômica
qRT-PCR
mammary gland
proteomic
topic Bubalus bubalis
glândula mamária
LC/MS-MS
proteômica
qRT-PCR
mammary gland
proteomic
description A mastite em búfalas leiteiras causa perdas econômicas devido à diminuição da produção de leite, além de ter um efeito negativo no bem-estar dos animais. Deste modo, foram realizados dois estudos: o objetivo do estudo I foi avaliar o nível de expressão dos genes da lactoferrina (LTF), fator de necrose tumoral alfa (TNF-α), interleucina-1 beta (IL-1β), interleucina-8 (IL-8), e toll-like receptors 2 (TLR-2) e 4 (TLR-4) em búfalas Murrah com e sem mastite subclínica. Amostras de leite de 12 búfalas com mastite e 12 de búfalas sem mastite foram coletadas, para a extração de RNA, síntese de cDNA e validação dos perfis de expressão por qRT-PCR. O ΔΔCt foi estimado utilizando contrastes ortogonais da expressão dos genes alvo corrigidos para a expressão dos genes housekeeping entre os tratamentos. A expressão dos genes TLR-2, TLR-4, TNF-α, IL-1β e IL-8 foi regulada positivamente em búfalos com mastite, enquanto que o gene LTF não apresentou expressão diferencial. O estudo desses genes da função imune que são ativos na glândula mamária é importante para o desenvolvimento de estratégias destinadas a preservar a saúde do úbere. O objetivo do estudo II foi avaliar as proteínas presentes no soro do leite de búfalas com e sem mastite subclínica, utilizando uma abordagem proteômica para identificar proteínas diferencialmente expressas e potencial biomarcador para a doença. Para isso, 16 amostras de leite de búfalas Murrah foram coletadas, sendo oito animais com e oito animais sem mastite subclínica. O método contagem espectral foi utilizado para quantificar a abundância relativa das proteínas individuais e os bancos de dados de proteínas anotadas para Bubalus bubalis e para Bos taurus foram utilizados na análise. Após integração das anotações genéticas das referências de búfalos e bovinos, foram identificadas 1.033 proteínas, das quais 156 proteínas foram diferencialmente reguladas entre animais sadios e infectados. Foram identificados 18 processos biológicos nos quais essas proteínas participam e a catelicidina-3 foi identificada como um potencial biomarcador da mastite subclínica. Os resultados são importantes para compreender melhor o comportamento da mastite na glândula mamária das búfalas e, portanto, podem auxiliar no diagnóstico precoce da doença.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-03-22T10:54:04Z
2018-03-22T10:54:04Z
2018-02-27
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/153143
000898677
33004102002P0
url http://hdl.handle.net/11449/153143
identifier_str_mv 000898677
33004102002P0
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799965070160035840