Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Estevam, Daniela Dutra [UNESP]
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/183369
Resumo: Quando bovinos de corte são alimentados com dietas de alto teor de concentrado em confinamentos, há um alto risco de estes terem distúrbios metabólicos, principalmente se forem do genótipo Bos taurus indicus, que em alguns estudos demonstraram ser mais sensíveis. Além disso, há uma grande variação entre os animais para lidarem com este distúrbio, principalmente pela preferência alimentar individual. Este estudo teve como objetivo identificar as regiões genômicas relacionadas à acidose ruminal de bovinos confinados da raça Nelore (n=642). Utilizou-se o painel GGP Indicus 35k, com a metodologia ssGWAS em que os efeitos dos marcadores foram obtidos a partir dos valores genômicos estimados pelo modelo GBLUP. Regiões genômicas que representaram mais de 1,0% da variância genética aditiva foram utilizadas. Os genes candidatos identificados estão envolvidos principalmente na regulação negativa ou não do processo apoptótico, secreção salivar e transporte de transmembrana. A identificação dessas regiões e seus respectivos genes candidatos pode contribuir para a formação de uma base genética para a susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore.
id UNSP_d7dab475b4a03b6acb17dc3b8fa8820d
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/183369
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamentoIdentification of genomic regions and metabolic pathways associated with susceptibility to ruminal acidosis in feedlot Nellore cattle.Identification of genomic regions and metabolic pathways associated with susceptibility to ruminal acidosis in feedlot Nellore cattle.confinamentoacidoseQuando bovinos de corte são alimentados com dietas de alto teor de concentrado em confinamentos, há um alto risco de estes terem distúrbios metabólicos, principalmente se forem do genótipo Bos taurus indicus, que em alguns estudos demonstraram ser mais sensíveis. Além disso, há uma grande variação entre os animais para lidarem com este distúrbio, principalmente pela preferência alimentar individual. Este estudo teve como objetivo identificar as regiões genômicas relacionadas à acidose ruminal de bovinos confinados da raça Nelore (n=642). Utilizou-se o painel GGP Indicus 35k, com a metodologia ssGWAS em que os efeitos dos marcadores foram obtidos a partir dos valores genômicos estimados pelo modelo GBLUP. Regiões genômicas que representaram mais de 1,0% da variância genética aditiva foram utilizadas. Os genes candidatos identificados estão envolvidos principalmente na regulação negativa ou não do processo apoptótico, secreção salivar e transporte de transmembrana. A identificação dessas regiões e seus respectivos genes candidatos pode contribuir para a formação de uma base genética para a susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore.When beef cattle are fed high-concentrate diets, there may be a high risk of metabolic disorders, such as acidosis, especially in cattle from Bos taurus indicus genotypes, which have shown to be more sensitive to this disease in some studies. In addition, it is well documented in the literature that there's great variation among animals, and each animal responds differently in order to cope with this disorder, especially when related to feed preferences, that is, the same diet may lead some animals to acidosis and others may not present any clinical signs. Therefore, this study will aim to identify genomic regions responsible for the ruminal acidosis in Nellore cattle (n=642). The GGP Indicus 35k panel was used with the ssGWAS methodology in which the effects of the markers were obtained from the genomic values estimated by the GBLUP model. Genomic regions that represented more than 1.0% of additive genetic variance were used. The identified candidate genes are mainly involved in the negative or non-regulation of apoptotic process, salivary secretion and transmembrane transport. The identification of these regions and their respective candidate genes may contribute to the formation of a genetic basis for susceptibility to rumen acidosis in Nellore cattle.Universidade Estadual Paulista (Unesp)Arrigoni, Mário De BeniMillen, Danilo Domingues [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Estevam, Daniela Dutra [UNESP]2019-08-30T13:45:08Z2019-08-30T13:45:08Z2019-08-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/18336900092453033004064048P20555360557852992porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2024-09-09T18:06:42Zoai:repositorio.unesp.br:11449/183369Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-09-09T18:06:42Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
Identification of genomic regions and metabolic pathways associated with susceptibility to ruminal acidosis in feedlot Nellore cattle.
Identification of genomic regions and metabolic pathways associated with susceptibility to ruminal acidosis in feedlot Nellore cattle.
title Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
spellingShingle Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
Estevam, Daniela Dutra [UNESP]
confinamento
acidose
title_short Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
title_full Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
title_fullStr Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
title_full_unstemmed Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
title_sort Identificação de regiões genômicas e vias metabólicas associadas com susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore terminados em confinamento
author Estevam, Daniela Dutra [UNESP]
author_facet Estevam, Daniela Dutra [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Arrigoni, Mário De Beni
Millen, Danilo Domingues [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Estevam, Daniela Dutra [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv confinamento
acidose
topic confinamento
acidose
description Quando bovinos de corte são alimentados com dietas de alto teor de concentrado em confinamentos, há um alto risco de estes terem distúrbios metabólicos, principalmente se forem do genótipo Bos taurus indicus, que em alguns estudos demonstraram ser mais sensíveis. Além disso, há uma grande variação entre os animais para lidarem com este distúrbio, principalmente pela preferência alimentar individual. Este estudo teve como objetivo identificar as regiões genômicas relacionadas à acidose ruminal de bovinos confinados da raça Nelore (n=642). Utilizou-se o painel GGP Indicus 35k, com a metodologia ssGWAS em que os efeitos dos marcadores foram obtidos a partir dos valores genômicos estimados pelo modelo GBLUP. Regiões genômicas que representaram mais de 1,0% da variância genética aditiva foram utilizadas. Os genes candidatos identificados estão envolvidos principalmente na regulação negativa ou não do processo apoptótico, secreção salivar e transporte de transmembrana. A identificação dessas regiões e seus respectivos genes candidatos pode contribuir para a formação de uma base genética para a susceptibilidade à acidose ruminal em bovinos Nelore.
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019-08-30T13:45:08Z
2019-08-30T13:45:08Z
2019-08-27
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/183369
000924530
33004064048P2
0555360557852992
url http://hdl.handle.net/11449/183369
identifier_str_mv 000924530
33004064048P2
0555360557852992
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1813546555780628480