Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites

Bibliographic Details
Main Author: Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
Publication Date: 2011
Other Authors: Rodrigues, Maria Gabriela Fontanetti [UNESP], Paula, Deise Reis de [UNESP], Mendes, Hélio Sandoval Junqueira [UNESP], Arantes, Flávio Cese [UNESP], Silva, Cristina Lacerda Soares Petrarolha
Format: Article
Language: por
Source: Repositório Institucional da UNESP
Download full: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452011000400016
http://hdl.handle.net/11449/3267
Summary: Pertencente à família Lauraceae, o abacateiro compreende três raças hortícolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares são uma ferramenta rápida e eficaz para estudos genômicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nível do DNA e não sofrem qualquer tipo de influência ambiental. Com base nesse polimorfismo, é possível fazer inferências sobre as relações entre o genótipo e o fenótipo dos indivíduos, o que, em última análise, permite aumentar a eficiência dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18 alelos, com uma média de 3,6 alelos por lócus. O dendrograma gerado a partir de análise de agrupamento UPGMA agrupou, separadamente do resto dos genótipos, a cultivar Geada da raça Antilhana, possivelmente por esta variedade ser uma raça pura, e o restante foi agrupado em dois grandes grupos das raças, a Guatemalense e a Mexicana. Os genótipos das sete variedades de abacate apresentam diversidade genética nos cinco lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR) avaliados, o que indica que são materiais promissores para utilização em futuros programas de melhoramento.
id UNSP_ee943b07abfb925f91f23db9b08184b6
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/3267
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélitesMolecular characterization and genetic diversity of different varieties of avocado by microsatellites markers (SSR)Persea americanaSSRfingerprintingbanco de germoplasmaPersea americanaSSRfingerprintinggermoplasm banksPertencente à família Lauraceae, o abacateiro compreende três raças hortícolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares são uma ferramenta rápida e eficaz para estudos genômicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nível do DNA e não sofrem qualquer tipo de influência ambiental. Com base nesse polimorfismo, é possível fazer inferências sobre as relações entre o genótipo e o fenótipo dos indivíduos, o que, em última análise, permite aumentar a eficiência dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18 alelos, com uma média de 3,6 alelos por lócus. O dendrograma gerado a partir de análise de agrupamento UPGMA agrupou, separadamente do resto dos genótipos, a cultivar Geada da raça Antilhana, possivelmente por esta variedade ser uma raça pura, e o restante foi agrupado em dois grandes grupos das raças, a Guatemalense e a Mexicana. Os genótipos das sete variedades de abacate apresentam diversidade genética nos cinco lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR) avaliados, o que indica que são materiais promissores para utilização em futuros programas de melhoramento.Belonging to Lauraceae family, avocado vegetables include three races: West Indian, Guatemalan and Mexican. Molecular markers are a fast and efficient tool for genomic studies since they detect polymorphism directly at the DNA level and do not suffer any kind of environmental influence. Based on this polymorphism, it is possible to make inferences about the relationship between genotype and phenotype of individuals, which ultimately will increase the efficiency of breeding programs. The objective of this study was to investigate the genetic diversity among seven varieties of avocados from five loci of microsatellite molecular markers (SSR). In samples of avocado evaluated it was found a total of 18 alleles, with an average of 3.6 alleles per locus. The dendrogram generated from UPGMA cluster analysis grouped separately from the rest of the genotypes the Geada cultivar an Antillean race, possibly because this strain is a pure race, the remainder was divided into two principal races groups, the Guatemalan and the Mexican. The genotypes of the seven varieties of avocado, show genetic diversity in the five loci of microsatellite molecular markers (SSR) assessed, indicating that they are promising materials for using in future breeding programs.Universidade Estadual Paulista Departamento de Produção VegetalUniversidade Estadual PaulistaFundação Educacional de AndradinaUniversidade Estadual Paulista Departamento de Produção VegetalUniversidade Estadual PaulistaSociedade Brasileira de FruticulturaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Fundação Educacional de AndradinaMartins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]Rodrigues, Maria Gabriela Fontanetti [UNESP]Paula, Deise Reis de [UNESP]Mendes, Hélio Sandoval Junqueira [UNESP]Arantes, Flávio Cese [UNESP]Silva, Cristina Lacerda Soares Petrarolha2014-05-20T13:16:24Z2014-05-20T13:16:24Z2011-12-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article1178-1184application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452011000400016Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 33, n. 4, p. 1178-1184, 2011.0100-2945http://hdl.handle.net/11449/326710.1590/S0100-29452011000400016S0100-29452011000400016WOS:000299741500016S0100-29452011000400016.pdf3560796753692798SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporRevista Brasileira de Fruticultura0.4750,410info:eu-repo/semantics/openAccess2023-11-05T06:06:39Zoai:repositorio.unesp.br:11449/3267Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-11-05T06:06:39Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
Molecular characterization and genetic diversity of different varieties of avocado by microsatellites markers (SSR)
title Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
spellingShingle Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
Persea americana
SSR
fingerprinting
banco de germoplasma
Persea americana
SSR
fingerprinting
germoplasm banks
title_short Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
title_full Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
title_fullStr Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
title_full_unstemmed Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
title_sort Caracterização molecular e diversidade genética de diferentes variedades de abacate por marcadores microssatélites
author Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
author_facet Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
Rodrigues, Maria Gabriela Fontanetti [UNESP]
Paula, Deise Reis de [UNESP]
Mendes, Hélio Sandoval Junqueira [UNESP]
Arantes, Flávio Cese [UNESP]
Silva, Cristina Lacerda Soares Petrarolha
author_role author
author2 Rodrigues, Maria Gabriela Fontanetti [UNESP]
Paula, Deise Reis de [UNESP]
Mendes, Hélio Sandoval Junqueira [UNESP]
Arantes, Flávio Cese [UNESP]
Silva, Cristina Lacerda Soares Petrarolha
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Fundação Educacional de Andradina
dc.contributor.author.fl_str_mv Martins, Antonio Baldo Geraldo [UNESP]
Rodrigues, Maria Gabriela Fontanetti [UNESP]
Paula, Deise Reis de [UNESP]
Mendes, Hélio Sandoval Junqueira [UNESP]
Arantes, Flávio Cese [UNESP]
Silva, Cristina Lacerda Soares Petrarolha
dc.subject.por.fl_str_mv Persea americana
SSR
fingerprinting
banco de germoplasma
Persea americana
SSR
fingerprinting
germoplasm banks
topic Persea americana
SSR
fingerprinting
banco de germoplasma
Persea americana
SSR
fingerprinting
germoplasm banks
description Pertencente à família Lauraceae, o abacateiro compreende três raças hortícolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares são uma ferramenta rápida e eficaz para estudos genômicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nível do DNA e não sofrem qualquer tipo de influência ambiental. Com base nesse polimorfismo, é possível fazer inferências sobre as relações entre o genótipo e o fenótipo dos indivíduos, o que, em última análise, permite aumentar a eficiência dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18 alelos, com uma média de 3,6 alelos por lócus. O dendrograma gerado a partir de análise de agrupamento UPGMA agrupou, separadamente do resto dos genótipos, a cultivar Geada da raça Antilhana, possivelmente por esta variedade ser uma raça pura, e o restante foi agrupado em dois grandes grupos das raças, a Guatemalense e a Mexicana. Os genótipos das sete variedades de abacate apresentam diversidade genética nos cinco lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR) avaliados, o que indica que são materiais promissores para utilização em futuros programas de melhoramento.
publishDate 2011
dc.date.none.fl_str_mv 2011-12-01
2014-05-20T13:16:24Z
2014-05-20T13:16:24Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452011000400016
Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 33, n. 4, p. 1178-1184, 2011.
0100-2945
http://hdl.handle.net/11449/3267
10.1590/S0100-29452011000400016
S0100-29452011000400016
WOS:000299741500016
S0100-29452011000400016.pdf
3560796753692798
url http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452011000400016
http://hdl.handle.net/11449/3267
identifier_str_mv Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 33, n. 4, p. 1178-1184, 2011.
0100-2945
10.1590/S0100-29452011000400016
S0100-29452011000400016
WOS:000299741500016
S0100-29452011000400016.pdf
3560796753692798
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Revista Brasileira de Fruticultura
0.475
0,410
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 1178-1184
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Fruticultura
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Fruticultura
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1797789612946489344