Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Tchaicka, Ligia
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/10935
Resumo: O presente estudo foi realizado para investigar os padrões filogeográficos de sete espécies de canídeos sul-americanos. Um fragmento de 588pb da região controladora do DNA mitocondrial foi obtido para seis espécies do gênero Lycalopex, e usado para inferir as relações evolutivas entre estas espécies. A análise indicou L. vetulus como espécie basal, L. fulvipes como taxa monofilético, L. culpaeus e L. griseus como espécies muito próximas. Padrões intraespecificos da variação genética foram também abordados para o gênero Lycalopex e intensivamente investigados em Cerdocyon thous, neste através de um fragmento de 512pb da região controladora do DNA mitocondrial, três íntrons nucleares e dez loci de microssatélites. L. fulvipes, L. gymnocercus e Cerdocyon thous mostraram partição geográfica entre a distribuição de seus haplótipos, indicando que barreiras históricas influenciaram a variabilidade genética atual. Os processos que geraram estes padrões e causaram a especiação do gênero Lycalopex provavelmente ocorreram no Pleistoceno, determinados pelas modificações na distribuição da vegetação e pelas oscilações nos níveis do mar. Os três diferentes marcadores utilizados para a abordagem de Cerdocyon thous mostraram-se informativos e sua análise conjunta indicou que a maior parte do fluxo gênico é determinado pelos machos nesta espécie. Os marcadores nucleares inferiram alta variabilidade e ausência de isolamento entre as populações do cachorro-do-mato.
id URGS_338319357d28602ba7a9748c0dc3bf0c
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/10935
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str 1853
spelling Tchaicka, LigiaFreitas, Thales Renato Ochotorena deEizirik, Eduardo2007-10-16T16:04:46Z2006http://hdl.handle.net/10183/10935000592572O presente estudo foi realizado para investigar os padrões filogeográficos de sete espécies de canídeos sul-americanos. Um fragmento de 588pb da região controladora do DNA mitocondrial foi obtido para seis espécies do gênero Lycalopex, e usado para inferir as relações evolutivas entre estas espécies. A análise indicou L. vetulus como espécie basal, L. fulvipes como taxa monofilético, L. culpaeus e L. griseus como espécies muito próximas. Padrões intraespecificos da variação genética foram também abordados para o gênero Lycalopex e intensivamente investigados em Cerdocyon thous, neste através de um fragmento de 512pb da região controladora do DNA mitocondrial, três íntrons nucleares e dez loci de microssatélites. L. fulvipes, L. gymnocercus e Cerdocyon thous mostraram partição geográfica entre a distribuição de seus haplótipos, indicando que barreiras históricas influenciaram a variabilidade genética atual. Os processos que geraram estes padrões e causaram a especiação do gênero Lycalopex provavelmente ocorreram no Pleistoceno, determinados pelas modificações na distribuição da vegetação e pelas oscilações nos níveis do mar. Os três diferentes marcadores utilizados para a abordagem de Cerdocyon thous mostraram-se informativos e sua análise conjunta indicou que a maior parte do fluxo gênico é determinado pelos machos nesta espécie. Os marcadores nucleares inferiram alta variabilidade e ausência de isolamento entre as populações do cachorro-do-mato.The present study was performed to investigate phylogeographic patterns of seven South American canid species. A 588bp fragment of mitochondrial DNA control region was obtained for the six species of Lycalopex genera, and used to infer evolutionary relationships between them. These analysis indicates L. vetulus as a basal species, L. fulvipes as a monophyletic taxa, and that L. culpaeus and L. griseus are closer species. Intraspecific patterns of genetic variation were also investigated for Lycalopex genera and were intensively investigated on Cerdocyon thous, in this latter by 512bp fragment of mitochondrial DNA control region, three nuclear introns and ten microsatellite loci. L. gymnocercus, L. fulvipes and Cerdocyon thous shown geographic partition between haplotype distributions, inferring that historical barriers had influenced the actual genetic variability. The processes that generate these patterns and caused the Lycalopex speciation probably took place on Pleistocene, caused by the modifications on vegetation distribution and variation on sea levels. Three different markers used for Cerdocyon thous approach were informative and their conjunct analysis indicates that gene flow can be male biased in this species. Nuclear markers inferred high variability and no geographic isolation between crab-eating fox populations.application/pdfporFilogenéticaFilogeografiaCanidaeMarcador molecularAbordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularPorto Alegre, BR-RS2006doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000592572.pdf000592572.pdfTexto completoapplication/pdf2292944http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/1/000592572.pdf2f07103698624358eb17f0c8c0a91707MD51TEXT000592572.pdf.txt000592572.pdf.txtExtracted Texttext/plain301694http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/2/000592572.pdf.txtcc793bd7f9318973c950e84e33848beaMD52THUMBNAIL000592572.pdf.jpg000592572.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1295http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/3/000592572.pdf.jpg895bc3b5c27af4434fc02a1b03c9e6b2MD5310183/109352023-09-02 03:32:39.998772oai:www.lume.ufrgs.br:10183/10935Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532023-09-02T06:32:39Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
title Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
spellingShingle Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
Tchaicka, Ligia
Filogenética
Filogeografia
Canidae
Marcador molecular
title_short Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
title_full Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
title_fullStr Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
title_full_unstemmed Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
title_sort Abordagens filogenéticas, filogeográficas e populacionais em canídeos sul-americanos
author Tchaicka, Ligia
author_facet Tchaicka, Ligia
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Tchaicka, Ligia
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Freitas, Thales Renato Ochotorena de
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Eizirik, Eduardo
contributor_str_mv Freitas, Thales Renato Ochotorena de
Eizirik, Eduardo
dc.subject.por.fl_str_mv Filogenética
Filogeografia
Canidae
Marcador molecular
topic Filogenética
Filogeografia
Canidae
Marcador molecular
description O presente estudo foi realizado para investigar os padrões filogeográficos de sete espécies de canídeos sul-americanos. Um fragmento de 588pb da região controladora do DNA mitocondrial foi obtido para seis espécies do gênero Lycalopex, e usado para inferir as relações evolutivas entre estas espécies. A análise indicou L. vetulus como espécie basal, L. fulvipes como taxa monofilético, L. culpaeus e L. griseus como espécies muito próximas. Padrões intraespecificos da variação genética foram também abordados para o gênero Lycalopex e intensivamente investigados em Cerdocyon thous, neste através de um fragmento de 512pb da região controladora do DNA mitocondrial, três íntrons nucleares e dez loci de microssatélites. L. fulvipes, L. gymnocercus e Cerdocyon thous mostraram partição geográfica entre a distribuição de seus haplótipos, indicando que barreiras históricas influenciaram a variabilidade genética atual. Os processos que geraram estes padrões e causaram a especiação do gênero Lycalopex provavelmente ocorreram no Pleistoceno, determinados pelas modificações na distribuição da vegetação e pelas oscilações nos níveis do mar. Os três diferentes marcadores utilizados para a abordagem de Cerdocyon thous mostraram-se informativos e sua análise conjunta indicou que a maior parte do fluxo gênico é determinado pelos machos nesta espécie. Os marcadores nucleares inferiram alta variabilidade e ausência de isolamento entre as populações do cachorro-do-mato.
publishDate 2006
dc.date.issued.fl_str_mv 2006
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2007-10-16T16:04:46Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/10935
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000592572
url http://hdl.handle.net/10183/10935
identifier_str_mv 000592572
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/1/000592572.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/2/000592572.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/10935/3/000592572.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 2f07103698624358eb17f0c8c0a91707
cc793bd7f9318973c950e84e33848bea
895bc3b5c27af4434fc02a1b03c9e6b2
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1810085103123038208