Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: SILVA, Claudio José Dias
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
Texto Completo: http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6202
Resumo: A cajazeira (S. mombin L.) destaca-se por produzir frutos de excelente sabor e propriedades nutricionais. Apesar disso, não existem cultivos comerciais e as áreas de ocorrência vêm sofrendo constantes supressões devido à ação antrópica. Este trabalho objetivou avaliar a diversidade genética entre plantas de cajazeiras do banco de germoplasma do IPA, por meio de marcadores ISSR. O experimento foi conduzido no Laboratório de Biotecnologia Vegetal do Departamento de Agronomia, Área de Fitotecnia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em Recife-PE, com latitude de 8º10’52’’S e longitude de 34º54’47’’W, no período de julho de 2007 a maio de 2009. Foram coletadas folhas tenras de doze plantas (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) do Banco de Germoplasma de Cajazeiras instalado na Estação Experimental de Itambé do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) (7º24’50”S e 35º06’30”W), no Município de Itambé, Pernambuco, Brasil. O DNA genômico foi obtido de acordo com a metodologia proposta por Ferreira e Grattapaglia (1998), com modificações. Para aamplificação do DNA, foram Utilizados 18 oligonucleotídeos (UBC 2, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 e UBC 891). Estas amplificações geraram 135 fragmentos, dos quais 105 polimórficos, variando de 20 a 620 pb. O UBC 834 mostrou-se mais informativo, possibilitando a diferenciação entre os 12 acessos. Os oligonucleotídeos em que prevalece a seqüência de bases GA (UBC 2, UBC 810, UBC 812 e UBC 885) amplificaram o maior número de fragmentos e de fragmentos polimórficos. Na construção do dendrograma houve a formação de quatro grandes grupos distintos, a partir de uma similaridade média de 51,69%. O acesso Dr. Moacir, oriundo de Manaus-AM, foi isolado dos demais acessos, apresentando uma similaridade de 27,45% com o acesso EAN-1, a menor encontrada entre os 12 acessos. Já entre Vianey 1 e Vianey 2 foi verificada a maior similaridade entre todos os acessos (73,21%). Com estes dados pode-se constatar a viabilidade do emprego de marcadores ISSR no estudo de diversidade genética em germoplasma de cajazeiras e a grande diversidade genética existente entre os acessos do banco.
id URPE_ba9402d845434d68e53148f570537e8d
oai_identifier_str oai:tede2:tede2/6202
network_acronym_str URPE
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
repository_id_str
spelling Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores molecularesSpondias mombin L.CajáDiversidade genéticaISSRGenetic diversityFITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETALA cajazeira (S. mombin L.) destaca-se por produzir frutos de excelente sabor e propriedades nutricionais. Apesar disso, não existem cultivos comerciais e as áreas de ocorrência vêm sofrendo constantes supressões devido à ação antrópica. Este trabalho objetivou avaliar a diversidade genética entre plantas de cajazeiras do banco de germoplasma do IPA, por meio de marcadores ISSR. O experimento foi conduzido no Laboratório de Biotecnologia Vegetal do Departamento de Agronomia, Área de Fitotecnia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em Recife-PE, com latitude de 8º10’52’’S e longitude de 34º54’47’’W, no período de julho de 2007 a maio de 2009. Foram coletadas folhas tenras de doze plantas (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) do Banco de Germoplasma de Cajazeiras instalado na Estação Experimental de Itambé do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) (7º24’50”S e 35º06’30”W), no Município de Itambé, Pernambuco, Brasil. O DNA genômico foi obtido de acordo com a metodologia proposta por Ferreira e Grattapaglia (1998), com modificações. Para aamplificação do DNA, foram Utilizados 18 oligonucleotídeos (UBC 2, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 e UBC 891). Estas amplificações geraram 135 fragmentos, dos quais 105 polimórficos, variando de 20 a 620 pb. O UBC 834 mostrou-se mais informativo, possibilitando a diferenciação entre os 12 acessos. Os oligonucleotídeos em que prevalece a seqüência de bases GA (UBC 2, UBC 810, UBC 812 e UBC 885) amplificaram o maior número de fragmentos e de fragmentos polimórficos. Na construção do dendrograma houve a formação de quatro grandes grupos distintos, a partir de uma similaridade média de 51,69%. O acesso Dr. Moacir, oriundo de Manaus-AM, foi isolado dos demais acessos, apresentando uma similaridade de 27,45% com o acesso EAN-1, a menor encontrada entre os 12 acessos. Já entre Vianey 1 e Vianey 2 foi verificada a maior similaridade entre todos os acessos (73,21%). Com estes dados pode-se constatar a viabilidade do emprego de marcadores ISSR no estudo de diversidade genética em germoplasma de cajazeiras e a grande diversidade genética existente entre os acessos do banco.The cajazeira (Spondias mombin L.) is distinguished by producing fruit of excellent taste and nutritional properties. Nevertheless, there are no commercial crops and places of occurrences of occurrence are suffering in deletions due to human action. This study aimed to evaluate the genetic diversity among plants Cajazeiras Bank of germplasm of the IPA by ISSR markers. The experiment was conducted at the Laboratório de Plant Biotecnologia Vegetal, Department of Agronomy, of the Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE), in Recife-PE, with latitude of 8 10'52''S and longitude 34 ° 54'47'' W, from July 2007 to May 2009. Tender leaves were collected from twelve plants (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) from Germplasm Bank of the Cajazeiras at the Experimental Station of the Agronomic Institute of Itambé Pernambuco (IPA) (7 ° 24'50 "S and 35 º 06'30" W) in the Municipality of Itambé, Pernambuco, Brazil. Genomic DNA was obtained according to the methodology proposed by Ferreira and Grattapaglia (1998), with modifications.For the amplification of DNA, 18 primers were used (2 UBC, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 and UBC 891). These amplifications generated 135 fragments, of which 105 polymorphic, ranging from 20 to 620pb. The UBC 834 was more informative, allowing the differentiation between the 12 accessions. The primers that prevails in the sequence of bases GA (2 UBC, UBC 810, UBC 812 and UBC 885) the highest number of amplified fragments and polymorphic fragments. In the construction of the dendrogram was the formation of four distinct groups, from an average similarity of 51.69%. Access Dr. Moacir, comes from Manaus-AM, was isolated from the other accessions, presenting a similarity of 27.45% with access EAN-1, the lowest found among the 12 accessions. Already between 1 and Vianey Vianey 2 there was a greater similarity among all accessions (73.21%). With these data we can see the viability of the use of ISSR markers to study genetic diversity in germplasm of Cajazeiras and high geneticdiversity among accessions of the bank.Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqUniversidade Federal Rural de PernambucoDepartamento de AgronomiaBrasilUFRPEPrograma de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de PlantasRESENDE, Luciane VilelaMUSSER, Rosimar dos SantosSILVA, Mairon Moura daNASCIMENTO, Ana Verônica Silva doMONTARROYOS, Angelica Virginia ValoisSILVA, Claudio José Dias2017-02-06T17:08:37Z2009-07-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSILVA, Claudio José Dias. Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares. 2009. 68 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6202porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPEinstname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)instacron:UFRPE2024-02-26T15:45:37Zoai:tede2:tede2/6202Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede/PUBhttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/oai/requestbdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.bropendoar:2024-02-26T15:45:37Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
title Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
spellingShingle Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
SILVA, Claudio José Dias
Spondias mombin L.
Cajá
Diversidade genética
ISSR
Genetic diversity
FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
title_short Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
title_full Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
title_fullStr Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
title_full_unstemmed Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
title_sort Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares
author SILVA, Claudio José Dias
author_facet SILVA, Claudio José Dias
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv RESENDE, Luciane Vilela
MUSSER, Rosimar dos Santos
SILVA, Mairon Moura da
NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do
MONTARROYOS, Angelica Virginia Valois
dc.contributor.author.fl_str_mv SILVA, Claudio José Dias
dc.subject.por.fl_str_mv Spondias mombin L.
Cajá
Diversidade genética
ISSR
Genetic diversity
FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
topic Spondias mombin L.
Cajá
Diversidade genética
ISSR
Genetic diversity
FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
description A cajazeira (S. mombin L.) destaca-se por produzir frutos de excelente sabor e propriedades nutricionais. Apesar disso, não existem cultivos comerciais e as áreas de ocorrência vêm sofrendo constantes supressões devido à ação antrópica. Este trabalho objetivou avaliar a diversidade genética entre plantas de cajazeiras do banco de germoplasma do IPA, por meio de marcadores ISSR. O experimento foi conduzido no Laboratório de Biotecnologia Vegetal do Departamento de Agronomia, Área de Fitotecnia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em Recife-PE, com latitude de 8º10’52’’S e longitude de 34º54’47’’W, no período de julho de 2007 a maio de 2009. Foram coletadas folhas tenras de doze plantas (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) do Banco de Germoplasma de Cajazeiras instalado na Estação Experimental de Itambé do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) (7º24’50”S e 35º06’30”W), no Município de Itambé, Pernambuco, Brasil. O DNA genômico foi obtido de acordo com a metodologia proposta por Ferreira e Grattapaglia (1998), com modificações. Para aamplificação do DNA, foram Utilizados 18 oligonucleotídeos (UBC 2, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 e UBC 891). Estas amplificações geraram 135 fragmentos, dos quais 105 polimórficos, variando de 20 a 620 pb. O UBC 834 mostrou-se mais informativo, possibilitando a diferenciação entre os 12 acessos. Os oligonucleotídeos em que prevalece a seqüência de bases GA (UBC 2, UBC 810, UBC 812 e UBC 885) amplificaram o maior número de fragmentos e de fragmentos polimórficos. Na construção do dendrograma houve a formação de quatro grandes grupos distintos, a partir de uma similaridade média de 51,69%. O acesso Dr. Moacir, oriundo de Manaus-AM, foi isolado dos demais acessos, apresentando uma similaridade de 27,45% com o acesso EAN-1, a menor encontrada entre os 12 acessos. Já entre Vianey 1 e Vianey 2 foi verificada a maior similaridade entre todos os acessos (73,21%). Com estes dados pode-se constatar a viabilidade do emprego de marcadores ISSR no estudo de diversidade genética em germoplasma de cajazeiras e a grande diversidade genética existente entre os acessos do banco.
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009-07-31
2017-02-06T17:08:37Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SILVA, Claudio José Dias. Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares. 2009. 68 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6202
identifier_str_mv SILVA, Claudio José Dias. Caracterização genética de cajazeiras (Spondias mombin L.) (Anacardiaceae) por meio de marcadores moleculares. 2009. 68 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
url http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6202
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural de Pernambuco
Departamento de Agronomia
Brasil
UFRPE
Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural de Pernambuco
Departamento de Agronomia
Brasil
UFRPE
Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
instacron:UFRPE
instname_str Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
instacron_str UFRPE
institution UFRPE
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
repository.mail.fl_str_mv bdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.br
_version_ 1823352165637292032