Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, João Paulo Müller da
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)
Texto Completo: http://www.repositorio.jesuita.org.br/handle/UNISINOS/2223
Resumo: Um dos mais importantes desafios para a biologia pós-genômica é atender a estrutura e o comportamento das interações moleculares complexas que controlam o comportamento celular. Para tanto é essencial à integração dos dados biológicos referentes a estas interações armazenadas em diversos banco de dados. Este é um problema difícil, pois estes dados estão disponíveis em banco de dados públicos espalhados geograficamente na rede mundial de computadores e cada um destes possui um sistema diferente de gerenciamento, formato ou visão de como representar os dados. Os principais problemas para a realização desta tarefa são:a necessidade de se desenvolver e aplicar parsers para cada banco de dados sem ausência de um vocabulário unificado. Como uma alternativa para facilitar estes problemas, este trabalho propõe a ontologia MONET (Molecular Network Ontology) que tem como objetivo ser um modelo integrado para a rede de redes que existe dentro da celula. Tal visão integrada ajuda a entender as interações de larga escala
id USIN_900dc8c3eedb64c7441203c337d5ada7
oai_identifier_str oai:www.repositorio.jesuita.org.br:UNISINOS/2223
network_acronym_str USIN
network_name_str Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)
repository_id_str
spelling 2015-03-05T13:56:59Z2015-03-05T13:56:59Z2006-03-06Made available in DSpace on 2015-03-05T13:56:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 6Um dos mais importantes desafios para a biologia pós-genômica é atender a estrutura e o comportamento das interações moleculares complexas que controlam o comportamento celular. Para tanto é essencial à integração dos dados biológicos referentes a estas interações armazenadas em diversos banco de dados. Este é um problema difícil, pois estes dados estão disponíveis em banco de dados públicos espalhados geograficamente na rede mundial de computadores e cada um destes possui um sistema diferente de gerenciamento, formato ou visão de como representar os dados. Os principais problemas para a realização desta tarefa são:a necessidade de se desenvolver e aplicar parsers para cada banco de dados sem ausência de um vocabulário unificado. Como uma alternativa para facilitar estes problemas, este trabalho propõe a ontologia MONET (Molecular Network Ontology) que tem como objetivo ser um modelo integrado para a rede de redes que existe dentro da celula. Tal visão integrada ajuda a entender as interações de larga escalaOne of the most important challenges for biology in the post-genomic is to understand the structure and behavior of the molecular interactions that controls cell behavior. Therefore is essential to integrate biological data concerning these interactions, which are stored in different databases. The integration task is dificult because these data are distributed in public databases on the world wide web and each database has diferent management systems, formats and views of how to represent biological data. The two main problems involved here are the dificulty in parsing the data when dealing with heterogeneous at file formats and the inconsistencies due to the absence of an united vocabulary. As an alternative to facilitate these problems this work proposes MONET (the Molecular Network) ontology, an integration model for the unifying of diferent molecular networks that exist inside the cell. Such integrated view facilitates the understanding of the large-scale interactions responsible for the behavior ofHewlett-Packard Brasil LtdaSilva, João Paulo Müller dahttp://lattes.cnpq.br/0269739401376216Lemke, NeyUniversidade do Vale do Rio do SinosPrograma de Pós-Graduação em Computação AplicadaUNISINOSBrasilEscola PolitécnicaConstrução e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONETCiências Exatas e da Terraintegração de dadosinteração proteína-proteínametabolismoontologiasregulação gênicadata integrationmetabolic pathwaysontologyregulation and protein-protein interactioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://www.repositorio.jesuita.org.br/handle/UNISINOS/2223info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)instname:Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS)instacron:UNISINOSORIGINALconstrucao e analise.pdfconstrucao e analise.pdfapplication/pdf1058398http://repositorio.jesuita.org.br/bitstream/UNISINOS/2223/1/construcao+e+analise.pdf8d94438cf71919f3799d410548a5b6c0MD51UNISINOS/22232015-03-11 17:46:52.173oai:www.repositorio.jesuita.org.br:UNISINOS/2223Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.repositorio.jesuita.org.br/oai/requestopendoar:2015-03-11T20:46:52Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos) - Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
title Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
spellingShingle Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
Silva, João Paulo Müller da
Ciências Exatas e da Terra
integração de dados
interação proteína-proteína
metabolismo
ontologias
regulação gênica
data integration
metabolic pathways
ontology
regulation and protein-protein interaction
title_short Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
title_full Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
title_fullStr Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
title_full_unstemmed Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
title_sort Construção e análise de modelos topológicos de redes biológicas usando a ontologia MONET
author Silva, João Paulo Müller da
author_facet Silva, João Paulo Müller da
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0269739401376216
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, João Paulo Müller da
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Lemke, Ney
contributor_str_mv Lemke, Ney
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Ciências Exatas e da Terra
topic Ciências Exatas e da Terra
integração de dados
interação proteína-proteína
metabolismo
ontologias
regulação gênica
data integration
metabolic pathways
ontology
regulation and protein-protein interaction
dc.subject.por.fl_str_mv integração de dados
interação proteína-proteína
metabolismo
ontologias
regulação gênica
dc.subject.eng.fl_str_mv data integration
metabolic pathways
ontology
regulation and protein-protein interaction
description Um dos mais importantes desafios para a biologia pós-genômica é atender a estrutura e o comportamento das interações moleculares complexas que controlam o comportamento celular. Para tanto é essencial à integração dos dados biológicos referentes a estas interações armazenadas em diversos banco de dados. Este é um problema difícil, pois estes dados estão disponíveis em banco de dados públicos espalhados geograficamente na rede mundial de computadores e cada um destes possui um sistema diferente de gerenciamento, formato ou visão de como representar os dados. Os principais problemas para a realização desta tarefa são:a necessidade de se desenvolver e aplicar parsers para cada banco de dados sem ausência de um vocabulário unificado. Como uma alternativa para facilitar estes problemas, este trabalho propõe a ontologia MONET (Molecular Network Ontology) que tem como objetivo ser um modelo integrado para a rede de redes que existe dentro da celula. Tal visão integrada ajuda a entender as interações de larga escala
publishDate 2006
dc.date.issued.fl_str_mv 2006-03-06
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-05T13:56:59Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-03-05T13:56:59Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.repositorio.jesuita.org.br/handle/UNISINOS/2223
url http://www.repositorio.jesuita.org.br/handle/UNISINOS/2223
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade do Vale do Rio do Sinos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada
dc.publisher.initials.fl_str_mv UNISINOS
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Escola Politécnica
publisher.none.fl_str_mv Universidade do Vale do Rio do Sinos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)
instname:Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS)
instacron:UNISINOS
instname_str Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS)
instacron_str UNISINOS
institution UNISINOS
reponame_str Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)
collection Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos)
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.jesuita.org.br/bitstream/UNISINOS/2223/1/construcao+e+analise.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 8d94438cf71919f3799d410548a5b6c0
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNISINOS (RBDU Repositório Digital da Biblioteca da Unisinos) - Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801844943109488640