Quanticação de angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas de embrião de galinha
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113338/ |
Resumo: | A angiogênese é um processo natural de formação de vasos sanguíneos a partir de uma vasculatura existente. Este fenômeno é controlado por diferentes fatores de estímulo e inibição. Perturbações no equilíbrio desses fatores podem ocasionar um crescimento descontrolado ou incompleto dos vasos, podendo estar relacionados a diferentes doenças. Para entender a ação e os efeitos de diferentes substâncias na ângiogênese, experimentos in vivo são realizados utilizando membranas corioalantóicas (CAM) de embrião de galinha. Para a quanticação da angiogênese, realizam-se análises da rede vascular dessas membranas em imagens obtidas por microscópios. As quanticações manuais podem ser cansativas, tediosas, demoradas e sujeitas a erros e variações subjetivas. Neste trabalho abordamos a questão da quanticação computacional de angiogênese em imagens da CAM. Investigamos diferentes medidas de quanticação existentes na literatura, e também propomos algumas novas medidas. A metodologia adotada consiste na segmentação dos vasos, realizada de forma semi-automática, a detecção de pontos de interesse na rede vascular, a classicação dos segmentos de vasos, e por m o cálculo das medidas. Na parte experimental, utilizamos um conjunto de imagens cedidas pelo Laboratório de Imunologia do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológi- cas da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP, sobre as quais aplicamos a metodologia adotada. Descrevemos e discutimos as correlações observadas entre a percepção visual e as medidas calculadas. |
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Quanticação de angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas de embrião de galinhaQuantication of angiogenesis in chick embryo chorioallantoic membrane imagesAprendizado ComputacionalNeovascularização FisiológicaA angiogênese é um processo natural de formação de vasos sanguíneos a partir de uma vasculatura existente. Este fenômeno é controlado por diferentes fatores de estímulo e inibição. Perturbações no equilíbrio desses fatores podem ocasionar um crescimento descontrolado ou incompleto dos vasos, podendo estar relacionados a diferentes doenças. Para entender a ação e os efeitos de diferentes substâncias na ângiogênese, experimentos in vivo são realizados utilizando membranas corioalantóicas (CAM) de embrião de galinha. Para a quanticação da angiogênese, realizam-se análises da rede vascular dessas membranas em imagens obtidas por microscópios. As quanticações manuais podem ser cansativas, tediosas, demoradas e sujeitas a erros e variações subjetivas. Neste trabalho abordamos a questão da quanticação computacional de angiogênese em imagens da CAM. Investigamos diferentes medidas de quanticação existentes na literatura, e também propomos algumas novas medidas. A metodologia adotada consiste na segmentação dos vasos, realizada de forma semi-automática, a detecção de pontos de interesse na rede vascular, a classicação dos segmentos de vasos, e por m o cálculo das medidas. Na parte experimental, utilizamos um conjunto de imagens cedidas pelo Laboratório de Imunologia do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológi- cas da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP, sobre as quais aplicamos a metodologia adotada. Descrevemos e discutimos as correlações observadas entre a percepção visual e as medidas calculadas.Angiogenesis is the process of natural formation of blood vessels from pre-existing vascular network. This phenomenon is controlled by dierent angiogenesis stimulating and inhibiting factors. Perturbations of the equilibrium of these factors may cause a uncontrolled or incomplete growth of the vessels, being associated to several types of diseases. To understand the action and eects of dierent substances in angiogenesis, in vivo experiments are performed using chick embryo chorioallantoic membrane (CAM). To quantify angiogenesis, the vascular network in these membranes are analyzed from images obtained by means of a microscopy. Manual quantication may be tiring, tedious, time consuming, and prone to errors and subjective variations. In this work we address the issue of computational quantication of angiogenesis in CAM images. We investigate dierent quantication measures reported in the related literature and also propose some new measures. The adopted methodology consists of vessel segmentation, performed in a semi-automatic way, detection of points of in- terest in the vascular network, classication of vessel segments, and at last the computation of the measures. In the experimental part, we use a set of images provided by the Laboratório de Imunologia of Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas of USP, which are processed by the proposed methodology. We describe and discuss the correlations observed between visual perception and computed measures.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPHirata, Nina Sumiko TomitaDe La Cruz, Leandro Ticlia2015-05-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113338/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-07-27T19:27:05Zoai:teses.usp.br:tde-20230727-113338Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-07-27T19:27:05Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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