Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Yasuda, Caroline Schnoll
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-26052023-151437/
Resumo: Introdução: O Hipogonadismo Hipogonadotrófico Isolado congênito (HHC) é causado por um defeito na produção ou secreção de GnRH pelo hipotálamo ou pela resistência hipofisária à ação do GnRH. O HHc é uma condição rara, clínica e geneticamente heterogênea; cerca de 50 a 60% dos indivíduos afetados apresentam anosmia associada, caracterizando a síndrome de Kallmann. Com o avanço das técnicas de biologia molecular na última década, um número cada vez maior de defeitos genéticos tem sido implicado na patogênese molecular do HHC congênito. No entanto, atualmente somente cerca de 40 a 50% dos casos de HHC apresentam diagnóstico molecular definido. O estudo das CNVs é indicado para investigação molecular de fenótipos sindrômicos complexos, porém até o presente momento, essa analise ainda não havia sido utilizada em uma grande coorte de pacientes com HHC. O Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array) é uma técnica de citogenômica que permite avaliar, com uma maior resolução a detecção de variação no número de cópias (copy number variation - CNV). Objetivos: Detectar deleções ou duplicações submicroscópicas em um grupo selecionado de pacientes de HHC com apresentação sindrômica sem causa definida. Identificar novas regiões cromossômicas e/ou novos genes possivelmente relacionados à etiologia da HHC. E estabelecer a correlação entre o genótipo mutante e o fenótipo observado nesses pacientes. Pacientes e Métodos: A coorte foi constituída por 50 indivíduos, dos quais: 35 homens e 15 mulheres; 21 com síndrome de Kallmann e 29 com HHC normósmico. Onze deles apresentavam alguma característica clinica adicional não relacionada ao quadro reprodutivo, como defeitos da linha da média, malformações renais, surdez, anormalidades esqueléticas, alterações neurológicas ou distúrbios psiquiátricos. Os achados foram comparados com CNVs descritas em bancos de dados de controles normais compilados pelo Database of Genomic Variants, e também pelos estudos de CNV em indivíduos com fenótipos alterados, depositados no banco de dados do DECIPHER (Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensemble Resources). Resultados: Foram identificadas 21 CNVs em 19 pacientes e entre os resultados mais importantes, destacamos três CNVs identificadas em regiões cromossômicas com genes codificantes e associados a síndromes conhecidas. Duas foram classificadas como patogênicas. Ambas deleções: uma de 515 kb, localizada no cromossomo 16 associada à síndrome de microdeleção 16p11.2 e a outra, de 598 kb localizada no cromossomo 15 abrangendo o gene SIN3A causador da síndrome Witteveen-Kolk. A terceira CNV foi uma VUS de destaque por ser uma duplicação de 40,6 kb do tipo intragênica envolvendo o gene KMT2C, causador da Síndrome de Kleefstra tipo 2 possivelmente associada ao HHC em alguns casos. Conclusão: Os resultados obtidos sugerem a associação de síndromes complexas ao HHC colocando principalmente os genes SIN3A e o KMT2C como possíveis genes candidatos nas próximas investigações de casos de HHC. Nossos resultados corroboram as evidências atuais da importância da análise global do número de cópias genômicas como um teste genético-clínico para elucidação diagnóstica em pacientes com HHC especialmente os casos sindrômicos
id USP_262b33a8f9ecdcc0b8b295edba9915dc
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-26052023-151437
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenitoNew approaches in molecular-genetic research in congenital hypogonadotropic hypogonadismGenesGenesGenótipoGenotypeGonadotropin-releasing hormoneHipogonadismoHormônio liberador de gonadotrofinaHypogonadismKallmann syndromeMolecular genotype techniquesSíndrome de KallmannTécnicas de diagnóstico molecularIntrodução: O Hipogonadismo Hipogonadotrófico Isolado congênito (HHC) é causado por um defeito na produção ou secreção de GnRH pelo hipotálamo ou pela resistência hipofisária à ação do GnRH. O HHc é uma condição rara, clínica e geneticamente heterogênea; cerca de 50 a 60% dos indivíduos afetados apresentam anosmia associada, caracterizando a síndrome de Kallmann. Com o avanço das técnicas de biologia molecular na última década, um número cada vez maior de defeitos genéticos tem sido implicado na patogênese molecular do HHC congênito. No entanto, atualmente somente cerca de 40 a 50% dos casos de HHC apresentam diagnóstico molecular definido. O estudo das CNVs é indicado para investigação molecular de fenótipos sindrômicos complexos, porém até o presente momento, essa analise ainda não havia sido utilizada em uma grande coorte de pacientes com HHC. O Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array) é uma técnica de citogenômica que permite avaliar, com uma maior resolução a detecção de variação no número de cópias (copy number variation - CNV). Objetivos: Detectar deleções ou duplicações submicroscópicas em um grupo selecionado de pacientes de HHC com apresentação sindrômica sem causa definida. Identificar novas regiões cromossômicas e/ou novos genes possivelmente relacionados à etiologia da HHC. E estabelecer a correlação entre o genótipo mutante e o fenótipo observado nesses pacientes. Pacientes e Métodos: A coorte foi constituída por 50 indivíduos, dos quais: 35 homens e 15 mulheres; 21 com síndrome de Kallmann e 29 com HHC normósmico. Onze deles apresentavam alguma característica clinica adicional não relacionada ao quadro reprodutivo, como defeitos da linha da média, malformações renais, surdez, anormalidades esqueléticas, alterações neurológicas ou distúrbios psiquiátricos. Os achados foram comparados com CNVs descritas em bancos de dados de controles normais compilados pelo Database of Genomic Variants, e também pelos estudos de CNV em indivíduos com fenótipos alterados, depositados no banco de dados do DECIPHER (Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensemble Resources). Resultados: Foram identificadas 21 CNVs em 19 pacientes e entre os resultados mais importantes, destacamos três CNVs identificadas em regiões cromossômicas com genes codificantes e associados a síndromes conhecidas. Duas foram classificadas como patogênicas. Ambas deleções: uma de 515 kb, localizada no cromossomo 16 associada à síndrome de microdeleção 16p11.2 e a outra, de 598 kb localizada no cromossomo 15 abrangendo o gene SIN3A causador da síndrome Witteveen-Kolk. A terceira CNV foi uma VUS de destaque por ser uma duplicação de 40,6 kb do tipo intragênica envolvendo o gene KMT2C, causador da Síndrome de Kleefstra tipo 2 possivelmente associada ao HHC em alguns casos. Conclusão: Os resultados obtidos sugerem a associação de síndromes complexas ao HHC colocando principalmente os genes SIN3A e o KMT2C como possíveis genes candidatos nas próximas investigações de casos de HHC. Nossos resultados corroboram as evidências atuais da importância da análise global do número de cópias genômicas como um teste genético-clínico para elucidação diagnóstica em pacientes com HHC especialmente os casos sindrômicosCongenital isolated hypogonadotropic hypogonadism (IHH) is a rare condition caused by GnRH deficiency, due to defective hypothalamic gonadotropin-releasing hormone (GnRH) production or secretion, or by pituitary resistance to the GnRH action. Congenital IHH is more prevalent in men and about 50% to 60% of affected individuals present with associated anosmia or hyposmia, characterizing Kallmann\'s syndrome. On the last years, with the advancing on the molecular biology field, a growing number of genetic defaults have been linked to the CHH molecular pathogenesis. On the other hand, nowadays, only 40% to 50% of the CHH have a defined molecular diagnostic. The copy number variation (CNV) study is used to search for complex syndromic phenotypes, but until the present moment, this analysis was not yet used in a large coort of patients with CHH. The Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array) is a citogenomic technique that allows the evaluation, with better resolution, and the detections of CNV. Objective: The present project was developed with the objective of detect submicroscopic deletions or duplications in a selected group of CHH patients with syndromic presentation that have no defined cause. Identify new chromosomic regions and/or new genes possibly related to the CHH etiology. And to establish correlations with the genotypes and the phenotype observed in these patients. Patients and Method: The coort has 50 individuals, been 35 men and 15 women; 21 with Kallman syndrome and 29 with normosmic CHH. Eleven of then present some additional clinical feature not related to the reproductive phenotypes, like defaults on the midline, kidney malfrormations, deafness, skeleton malformation, neurologic disorders or psychiatric disturbance. The findings were analyzed and compared to CNV founded from normal controls previously described and compiled by the Database of Genomic Variants, and also by the previous studies of CNV from individuals with some phonetical feature, from the DECIPHER (Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensemble Resources). Results: Twenty-one CNVs were identified in 19 patients and, among the most important results, three of them stand out, located in chromosomic regions with codifying genes and associated with already known syndromes. Two of them were deletions and classified as pathogenic: one with 515 kb on the 16o chromosome, linked to the 16p11.2 microdeletion syndrome, and other one, also a deletion, with 598 kb, sited on the 15o chromosome, compassing the SIN3A gene liked to the Witteveen-Kolk syndrome. The third CNV is a VUS (variant of unknown significance), highlighted by been a type intragenic duplication with 40.6 kb, compassing the KMT2C gene, responsible for the Kleefstra Syndrome 2, possibly associated to CHH in some cases. Conclusion: The results founded suggest an association between these complex syndromes and CHH, and emphasize specially the SIN3A and KMT2C genes as possible candidates in future assays for patients with CHH. Our results enhance the actual evidences that elevate the importance of the CNV analysis as a genetic-clinic test to diagnostic elucidation in CHH patients, specially the syndromic casesBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSilveira, Letícia Ferreira GontijoYasuda, Caroline Schnoll2023-02-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-26052023-151437/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-06-01T18:25:43Zoai:teses.usp.br:tde-26052023-151437Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-06-01T18:25:43Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
New approaches in molecular-genetic research in congenital hypogonadotropic hypogonadism
title Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
spellingShingle Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
Yasuda, Caroline Schnoll
Genes
Genes
Genótipo
Genotype
Gonadotropin-releasing hormone
Hipogonadismo
Hormônio liberador de gonadotrofina
Hypogonadism
Kallmann syndrome
Molecular genotype techniques
Síndrome de Kallmann
Técnicas de diagnóstico molecular
title_short Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
title_full Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
title_fullStr Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
title_full_unstemmed Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
title_sort Novas abordagens na investigação genético-molecular no hipogonadismo hipogonadotrófico congenito
author Yasuda, Caroline Schnoll
author_facet Yasuda, Caroline Schnoll
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Silveira, Letícia Ferreira Gontijo
dc.contributor.author.fl_str_mv Yasuda, Caroline Schnoll
dc.subject.por.fl_str_mv Genes
Genes
Genótipo
Genotype
Gonadotropin-releasing hormone
Hipogonadismo
Hormônio liberador de gonadotrofina
Hypogonadism
Kallmann syndrome
Molecular genotype techniques
Síndrome de Kallmann
Técnicas de diagnóstico molecular
topic Genes
Genes
Genótipo
Genotype
Gonadotropin-releasing hormone
Hipogonadismo
Hormônio liberador de gonadotrofina
Hypogonadism
Kallmann syndrome
Molecular genotype techniques
Síndrome de Kallmann
Técnicas de diagnóstico molecular
description Introdução: O Hipogonadismo Hipogonadotrófico Isolado congênito (HHC) é causado por um defeito na produção ou secreção de GnRH pelo hipotálamo ou pela resistência hipofisária à ação do GnRH. O HHc é uma condição rara, clínica e geneticamente heterogênea; cerca de 50 a 60% dos indivíduos afetados apresentam anosmia associada, caracterizando a síndrome de Kallmann. Com o avanço das técnicas de biologia molecular na última década, um número cada vez maior de defeitos genéticos tem sido implicado na patogênese molecular do HHC congênito. No entanto, atualmente somente cerca de 40 a 50% dos casos de HHC apresentam diagnóstico molecular definido. O estudo das CNVs é indicado para investigação molecular de fenótipos sindrômicos complexos, porém até o presente momento, essa analise ainda não havia sido utilizada em uma grande coorte de pacientes com HHC. O Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array) é uma técnica de citogenômica que permite avaliar, com uma maior resolução a detecção de variação no número de cópias (copy number variation - CNV). Objetivos: Detectar deleções ou duplicações submicroscópicas em um grupo selecionado de pacientes de HHC com apresentação sindrômica sem causa definida. Identificar novas regiões cromossômicas e/ou novos genes possivelmente relacionados à etiologia da HHC. E estabelecer a correlação entre o genótipo mutante e o fenótipo observado nesses pacientes. Pacientes e Métodos: A coorte foi constituída por 50 indivíduos, dos quais: 35 homens e 15 mulheres; 21 com síndrome de Kallmann e 29 com HHC normósmico. Onze deles apresentavam alguma característica clinica adicional não relacionada ao quadro reprodutivo, como defeitos da linha da média, malformações renais, surdez, anormalidades esqueléticas, alterações neurológicas ou distúrbios psiquiátricos. Os achados foram comparados com CNVs descritas em bancos de dados de controles normais compilados pelo Database of Genomic Variants, e também pelos estudos de CNV em indivíduos com fenótipos alterados, depositados no banco de dados do DECIPHER (Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensemble Resources). Resultados: Foram identificadas 21 CNVs em 19 pacientes e entre os resultados mais importantes, destacamos três CNVs identificadas em regiões cromossômicas com genes codificantes e associados a síndromes conhecidas. Duas foram classificadas como patogênicas. Ambas deleções: uma de 515 kb, localizada no cromossomo 16 associada à síndrome de microdeleção 16p11.2 e a outra, de 598 kb localizada no cromossomo 15 abrangendo o gene SIN3A causador da síndrome Witteveen-Kolk. A terceira CNV foi uma VUS de destaque por ser uma duplicação de 40,6 kb do tipo intragênica envolvendo o gene KMT2C, causador da Síndrome de Kleefstra tipo 2 possivelmente associada ao HHC em alguns casos. Conclusão: Os resultados obtidos sugerem a associação de síndromes complexas ao HHC colocando principalmente os genes SIN3A e o KMT2C como possíveis genes candidatos nas próximas investigações de casos de HHC. Nossos resultados corroboram as evidências atuais da importância da análise global do número de cópias genômicas como um teste genético-clínico para elucidação diagnóstica em pacientes com HHC especialmente os casos sindrômicos
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-02-17
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-26052023-151437/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-26052023-151437/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257393012932608