Identificação de fatores de transcrição em células tímicas epiteliais medulares (mTECs) por meio de análise sequenciamento de RNA

• Autor(a) principal: Souza, Álex Cardoso de
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-06122021-122900/
• topic: Aire; Aire; Células epiteliais tímicas corticais (cTECs); Células epiteliais tímicas medulares (mTECs); Cortical thymic epithelial cells (cTECs); Fezf2; Fezf2; Medullary thymic epithelial cells (mTECs); RNA sequencing (RNA-Seq); Sequenciamento de RNA (RNA-Seq)

A não responsividade dos autoantígenos que refere à tolerância imunológica central envolve processos de desenvolvimento e seleção de linfócitos T que caracteriza o crosstalk tímico entre os timócitos e células tímicas epiteliais. Em mTECs, o processo de eliminação de timócitos autorreativos contra a expressão de TRAs ocorre por meio da eliminação por apoptose antes destas células chegarem a periferia. Os principais genes envolvidos no processo da tolerância imunológica são o Aire e o Fezf2, correspondendo a aproximadamente 60% de todos os TRAs expressos nas células mTECs, logo, hipotetizamos que 40% desses TRAs expressos possa ser evidenciado e que existem genes ainda não identificados. Foi realizado um ensaio de adesão das células tímicas epiteliais medulares comparado com células tímicas epiteliais corticais aos timócitos extraídos por timectomia de camundongos, onde, demonstrou-se que houve uma redução no número de fatores de transcrição após o processo de adesão causando uma modulação. A análise de bioinformática dos dados de sequenciamento de RNA (análise de qualidade, trimagem, indexação do genoma e análise estatística) mostrou genes diferencialmente expressos que foram identificados e classificados por enriquecimento funcional. Identificamos os potenciais fatores de transcrição antes da adesão com 73 diferencialmente expressos, enquanto que, após adesão 55 genes diferencialmente expressos. Esse estudo demonstra a predição de novos fatores de transcrição no processo de adesão das células tímicas aos timócitos.