Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Penha, Helen Alves
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20191218-182401/
Resumo: O gênero Passiflora possui cerca de 450 espécies tropicais e subtropicais. Algumas delas têm crescente importância comercial, sendo cultivadas devido às características do fruto, como plantas ornamentais ou devido ao valor medicinal. Além de Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg., o maracujá-amarelo, Passiflora alata Curtis, o maracujá-doce vem ganhando espaço no mercado, principalmente para consumo in natura. No entanto, não há variedades comerciais oriundas de programas de melhoramento genético, e os pomares mostram susceptibilidade a algumas pragas e doenças. Por isso, há a necessidade de um esforço para melhorar a produção de frutos e desenvolver variedades resistentes. O desenvolvimento de marcadores moleculares tem importância nesse processo, já que podem estar ligados a regiões genômicas que controlam caracteres agronômicos. Os microssatélites são a classe mais informativa existente de marcadores genéticos. Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de marcadores microssatélites de Passiflora alata a partir de análises de transferibilidade de primers desenhados para P. edulis f. flavicarpa; a construção de uma biblioteca enriquecida em microssatélites de Passiflora alata e o desenho de primers para tais seqüências; e a validação de uma amostra desses pares de primers, usando parte de uma população segregante (F1) de Passiflora alata e os respectivos genitores. A taxa de transferibilidade foi de 34%, indicando que essas sequências flanqueadoras de microssatélites são conservadas em ambas as espécies. A biblioteca genômica enriquecida de Passiflora alata forneceu 221 clones contendo microssatélites, com uma eficiência de enriquecimento da ordem de 42%. Foram desenhados pares de primers para 177 seqüências, uma amostra de 59 deles foi validada e os alelos foram identificados. Obteve-se elevada qualidade nas amplificações, via PCR, dando suporte ao uso destes locos em estudos genéticos de Passiflora alata
id USP_67c401e831db891dd572b22087bf66c3
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-20191218-182401
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata CurtisNot avaliableMARACUJÁ DOCEMARCADOR MOLECULARMELHORAMENTO GENÉTICO VEGETALO gênero Passiflora possui cerca de 450 espécies tropicais e subtropicais. Algumas delas têm crescente importância comercial, sendo cultivadas devido às características do fruto, como plantas ornamentais ou devido ao valor medicinal. Além de Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg., o maracujá-amarelo, Passiflora alata Curtis, o maracujá-doce vem ganhando espaço no mercado, principalmente para consumo in natura. No entanto, não há variedades comerciais oriundas de programas de melhoramento genético, e os pomares mostram susceptibilidade a algumas pragas e doenças. Por isso, há a necessidade de um esforço para melhorar a produção de frutos e desenvolver variedades resistentes. O desenvolvimento de marcadores moleculares tem importância nesse processo, já que podem estar ligados a regiões genômicas que controlam caracteres agronômicos. Os microssatélites são a classe mais informativa existente de marcadores genéticos. Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de marcadores microssatélites de Passiflora alata a partir de análises de transferibilidade de primers desenhados para P. edulis f. flavicarpa; a construção de uma biblioteca enriquecida em microssatélites de Passiflora alata e o desenho de primers para tais seqüências; e a validação de uma amostra desses pares de primers, usando parte de uma população segregante (F1) de Passiflora alata e os respectivos genitores. A taxa de transferibilidade foi de 34%, indicando que essas sequências flanqueadoras de microssatélites são conservadas em ambas as espécies. A biblioteca genômica enriquecida de Passiflora alata forneceu 221 clones contendo microssatélites, com uma eficiência de enriquecimento da ordem de 42%. Foram desenhados pares de primers para 177 seqüências, uma amostra de 59 deles foi validada e os alelos foram identificados. Obteve-se elevada qualidade nas amplificações, via PCR, dando suporte ao uso destes locos em estudos genéticos de Passiflora alataThe Passiflora genus contains approximately 450 tropical and subtropical species. Some of them have increasing commercial value and are cultivated for their fruit characteristics, as ornamental plants or due to medical value. Besides Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg., the yellow passion fruit, Passiflora alata Curtis, the sweet passion fruit is growing presence in the market for fresh consumption. However, there are no commercial varieties based on genetic breeding programs, and the orchards are susceptible to some pests and diseases. Therefore efforts to improve fruit production and develop resistant varieties should be done. The development of molecular markers is important for this process, as markers could be linked to genomic regions that control agronomical traits. Microsatellites are the most informative class of genetic markers. The objective of this study was the development of microsatellites for Passiflora alata, based on transferability of primers designed for P. edulis flavicarpa; the construction of a microsatellite-enriched genomic library and the design of primers for those sequences; and the validation of a sample of primer-pairs using part of a segregating population (F1) of Passiflora alata and its parents. Transferability level was 34%, indicating that those microsatellite-flanking regions are conserved in both species. The enriched genomic library produced 221 clones containing microsatellites, meaning an efficiency of the enrichment process of 42%. Primer pairs were designed for 177 sequences, a sample of 59 of them was validated and the alleles were identified. PCR amplifications of good quality were obtained suggesting the use of these loci in Passiflora alata genetic studiesBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPVieira, Maria Lucia CarneiroPenha, Helen Alves2008-01-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20191218-182401/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2019-12-20T03:30:02Zoai:teses.usp.br:tde-20191218-182401Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212019-12-20T03:30:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
Not avaliable
title Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
spellingShingle Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
Penha, Helen Alves
MARACUJÁ DOCE
MARCADOR MOLECULAR
MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL
title_short Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
title_full Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
title_fullStr Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
title_full_unstemmed Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
title_sort Desenvolvimento de marcadores microssatélites em Passiflora alata Curtis
author Penha, Helen Alves
author_facet Penha, Helen Alves
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Vieira, Maria Lucia Carneiro
dc.contributor.author.fl_str_mv Penha, Helen Alves
dc.subject.por.fl_str_mv MARACUJÁ DOCE
MARCADOR MOLECULAR
MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL
topic MARACUJÁ DOCE
MARCADOR MOLECULAR
MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL
description O gênero Passiflora possui cerca de 450 espécies tropicais e subtropicais. Algumas delas têm crescente importância comercial, sendo cultivadas devido às características do fruto, como plantas ornamentais ou devido ao valor medicinal. Além de Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg., o maracujá-amarelo, Passiflora alata Curtis, o maracujá-doce vem ganhando espaço no mercado, principalmente para consumo in natura. No entanto, não há variedades comerciais oriundas de programas de melhoramento genético, e os pomares mostram susceptibilidade a algumas pragas e doenças. Por isso, há a necessidade de um esforço para melhorar a produção de frutos e desenvolver variedades resistentes. O desenvolvimento de marcadores moleculares tem importância nesse processo, já que podem estar ligados a regiões genômicas que controlam caracteres agronômicos. Os microssatélites são a classe mais informativa existente de marcadores genéticos. Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de marcadores microssatélites de Passiflora alata a partir de análises de transferibilidade de primers desenhados para P. edulis f. flavicarpa; a construção de uma biblioteca enriquecida em microssatélites de Passiflora alata e o desenho de primers para tais seqüências; e a validação de uma amostra desses pares de primers, usando parte de uma população segregante (F1) de Passiflora alata e os respectivos genitores. A taxa de transferibilidade foi de 34%, indicando que essas sequências flanqueadoras de microssatélites são conservadas em ambas as espécies. A biblioteca genômica enriquecida de Passiflora alata forneceu 221 clones contendo microssatélites, com uma eficiência de enriquecimento da ordem de 42%. Foram desenhados pares de primers para 177 seqüências, uma amostra de 59 deles foi validada e os alelos foram identificados. Obteve-se elevada qualidade nas amplificações, via PCR, dando suporte ao uso destes locos em estudos genéticos de Passiflora alata
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008-01-31
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20191218-182401/
url https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20191218-182401/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090917407129600