Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Batah, Sabrina Setembre
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17143/tde-23062022-093707/
Resumo: As doenças pulmonares intersticiais são um grande grupo heterogêneo de distúrbios que causam remodelamento do interstício pulmonar com diferentes padrões de lesão. Dentre esses padrões, destaca-se a pneumonite intersticial bronquiolocêntrica, a qual é definida por um remodelamento fibrótico predominantemente bronquiolocêntrico, relacionado a diferentes etiologias, como microaspiração crônica (ASP) de conteúdo alimentar/gástrico e pneumonite de hipersensibilidade (PH) por antígenos inalados. Apesar da causa inicial da lesão diferir entre estas etiologias, muitas vezes os achados clínicos, radiológicos e histopatológicos não permitem um diagnóstico etiológico preciso, afetando drasticamente no manejo e prognóstico desses pacientes. Desta forma, este projeto estudou o perfil molecular das áreas de lesão, onde o mecanismo específico inicial está presente, afim de validar biomarcadores para o diagnóstico translacional. Para isto, uma minuciosa análise dos dados clínicos e radiológicos e histopatológicos foi realizada, além do transcriptoma do tecido pulmonar de pacientes com ASP e PH. A integração dos dados com o perfil transcriptômico dos pacientes evidenciou alguns clusters gênicos relacionados à específicos processos fisiopatológicos de cada etiologia, destacando uma up-expressão de genes relacionados à colágeno e proteção das células epiteliais bronquiolares no grupo ASP. Ademais, os dados apresentados demostraram, para estes pacientes, uma maior lesão fibrosante com extenso remodelamento parenquimatoso com quadro pulmonar restritivo e pior prognóstico. Assim, a microaspiração crônica do conteúdo oral/gástrico pode modificar o perfil transcriptômico, sendo responsável pelo pior quadro fibrosante. Estas descobertas possibilitam uma melhor acurácia diagnóstica para o tratamento específico da ASP e PH, possibilitando um melhor manejo clínico.
id USP_aafe2bf85ffd91b342370d4c1140af3a
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-23062022-093707
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecularTranscriptomic profile of airway-centered myofibroblast areas as a potential biomarker of bronchiolocentric interstitial pneumonias: transitional approach to molecular diagnosisBiomarcadoresBiomarkersBronchiolocentric interstitial pneumonitisDoença intersticial pulmonarInterstitial lung diseaseOmicsOmicsPneumonite intersticial bronquiolocêntricaTranscriptomaTranscriptomeAs doenças pulmonares intersticiais são um grande grupo heterogêneo de distúrbios que causam remodelamento do interstício pulmonar com diferentes padrões de lesão. Dentre esses padrões, destaca-se a pneumonite intersticial bronquiolocêntrica, a qual é definida por um remodelamento fibrótico predominantemente bronquiolocêntrico, relacionado a diferentes etiologias, como microaspiração crônica (ASP) de conteúdo alimentar/gástrico e pneumonite de hipersensibilidade (PH) por antígenos inalados. Apesar da causa inicial da lesão diferir entre estas etiologias, muitas vezes os achados clínicos, radiológicos e histopatológicos não permitem um diagnóstico etiológico preciso, afetando drasticamente no manejo e prognóstico desses pacientes. Desta forma, este projeto estudou o perfil molecular das áreas de lesão, onde o mecanismo específico inicial está presente, afim de validar biomarcadores para o diagnóstico translacional. Para isto, uma minuciosa análise dos dados clínicos e radiológicos e histopatológicos foi realizada, além do transcriptoma do tecido pulmonar de pacientes com ASP e PH. A integração dos dados com o perfil transcriptômico dos pacientes evidenciou alguns clusters gênicos relacionados à específicos processos fisiopatológicos de cada etiologia, destacando uma up-expressão de genes relacionados à colágeno e proteção das células epiteliais bronquiolares no grupo ASP. Ademais, os dados apresentados demostraram, para estes pacientes, uma maior lesão fibrosante com extenso remodelamento parenquimatoso com quadro pulmonar restritivo e pior prognóstico. Assim, a microaspiração crônica do conteúdo oral/gástrico pode modificar o perfil transcriptômico, sendo responsável pelo pior quadro fibrosante. Estas descobertas possibilitam uma melhor acurácia diagnóstica para o tratamento específico da ASP e PH, possibilitando um melhor manejo clínico.Interstitial lung diseases are a large heterogeneous group of disorders that cause interstitial lung remodeling with different injury patterns. Among these patterns, bronchiolocentric interstitial pneumonitis is defined by a predominantly bronchiolocentric fibrotic remodeling, related to different etiologies, such as chronic microaspiration (ASP) of food/gastric content and hypersensitivity pneumonitis (HP) by inhaled antigens. Although the initial cause of the lesion differs between these etiologies, clinical, radiological, and histopathological findings often do not allow a precise etiological diagnosis, drastically affecting the management and prognosis of these patients. Thus, this project studied the molecular profile of the lesion areas, where the initial specific mechanism is present, in order to validate biomarkers for translational diagnosis. Thus, a detailed analysis of clinical, radiological, and histopathological data was performed, in addition to the transcriptome of lung tissue from patients with ASP and HP. The data integration with the transcriptomic profile of patients evidenced some gene clusters related to specific pathophysiological processes of each etiology, highlighting an up-expression of genes related to collagen and protection of bronchiolar epithelial cells in the ASP group. Furthermore, the data presented demonstrated, for these patients, a greater fibrosing lesion with extensive parenchymal remodeling, with restrictive pulmonary characteristics and worse prognosis. Thus, chronic microaspiration of oral/gastric content can modify the transcriptomic profile, which is responsible for the worst fibrous condition. These findings enable a better diagnostic accuracy for the specific treatment of ASP and PH, improving the clinical management.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFabro, Alexandre TodorovicBatah, Sabrina Setembre2022-02-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17143/tde-23062022-093707/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-02-21T13:00:30Zoai:teses.usp.br:tde-23062022-093707Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-02-21T13:00:30Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
Transcriptomic profile of airway-centered myofibroblast areas as a potential biomarker of bronchiolocentric interstitial pneumonias: transitional approach to molecular diagnosis
title Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
spellingShingle Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
Batah, Sabrina Setembre
Biomarcadores
Biomarkers
Bronchiolocentric interstitial pneumonitis
Doença intersticial pulmonar
Interstitial lung disease
Omics
Omics
Pneumonite intersticial bronquiolocêntrica
Transcriptoma
Transcriptome
title_short Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
title_full Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
title_fullStr Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
title_full_unstemmed Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
title_sort Perfil transcriptômico das áreas miofibroblásticas centradas em vias aéreas como potencial biomarcador das pneumonias intersticiais bronquiolocêntricas: abordagem transicional para diagnóstico molecular
author Batah, Sabrina Setembre
author_facet Batah, Sabrina Setembre
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Fabro, Alexandre Todorovic
dc.contributor.author.fl_str_mv Batah, Sabrina Setembre
dc.subject.por.fl_str_mv Biomarcadores
Biomarkers
Bronchiolocentric interstitial pneumonitis
Doença intersticial pulmonar
Interstitial lung disease
Omics
Omics
Pneumonite intersticial bronquiolocêntrica
Transcriptoma
Transcriptome
topic Biomarcadores
Biomarkers
Bronchiolocentric interstitial pneumonitis
Doença intersticial pulmonar
Interstitial lung disease
Omics
Omics
Pneumonite intersticial bronquiolocêntrica
Transcriptoma
Transcriptome
description As doenças pulmonares intersticiais são um grande grupo heterogêneo de distúrbios que causam remodelamento do interstício pulmonar com diferentes padrões de lesão. Dentre esses padrões, destaca-se a pneumonite intersticial bronquiolocêntrica, a qual é definida por um remodelamento fibrótico predominantemente bronquiolocêntrico, relacionado a diferentes etiologias, como microaspiração crônica (ASP) de conteúdo alimentar/gástrico e pneumonite de hipersensibilidade (PH) por antígenos inalados. Apesar da causa inicial da lesão diferir entre estas etiologias, muitas vezes os achados clínicos, radiológicos e histopatológicos não permitem um diagnóstico etiológico preciso, afetando drasticamente no manejo e prognóstico desses pacientes. Desta forma, este projeto estudou o perfil molecular das áreas de lesão, onde o mecanismo específico inicial está presente, afim de validar biomarcadores para o diagnóstico translacional. Para isto, uma minuciosa análise dos dados clínicos e radiológicos e histopatológicos foi realizada, além do transcriptoma do tecido pulmonar de pacientes com ASP e PH. A integração dos dados com o perfil transcriptômico dos pacientes evidenciou alguns clusters gênicos relacionados à específicos processos fisiopatológicos de cada etiologia, destacando uma up-expressão de genes relacionados à colágeno e proteção das células epiteliais bronquiolares no grupo ASP. Ademais, os dados apresentados demostraram, para estes pacientes, uma maior lesão fibrosante com extenso remodelamento parenquimatoso com quadro pulmonar restritivo e pior prognóstico. Assim, a microaspiração crônica do conteúdo oral/gástrico pode modificar o perfil transcriptômico, sendo responsável pelo pior quadro fibrosante. Estas descobertas possibilitam uma melhor acurácia diagnóstica para o tratamento específico da ASP e PH, possibilitando um melhor manejo clínico.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-02-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17143/tde-23062022-093707/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17143/tde-23062022-093707/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257365971206144