Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ferreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-28092021-105818/
Resumo: Objetivo: O hipopituitarismo congênito é a deficiência de um ou mais hormônios hipofisários, sendo muito comum a deficiência do hormônio de crescimento (GH). Pode também ser isolado ou estar associado à deficiência de outros hormônios da hipófise (1) . Este trabalho teve por objetivo de avaliar o exoma em filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, para não apenas determinar a etiologia genética nessa população de alta suscetibilidade, mas também fazer, quando necessário, a relação genótipo-fenótipo com posterior estudo funcional. Pacientes e Método: Avaliação do exoma em 16 pacientes, filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, que são acompanhados no ambulatório de hipopituitarismo da Unidade de Endocrinologia do Desenvolvimento. O desenvolvimento das técnicas de biologia molecular com análise da região traduzida de todos os éxons do genoma humano, denominado exoma ou sequenciamento paralelo em larga escala (SPLE), levou ao diagnóstico molecular crescente na pesquisa de doenças genéticas. Os modelos animais foram uma ferramenta importante na busca da associação de genótipo-fenótipo em humanos através da pesquisa de variantes em genes específicos encontrados com alterações em camundongos e, depois, avaliados em humanos pelo método de Sanger (2) . Resultados: A taxa de diagnóstico molecular de pacientes portadores de distúrbios do desenvolvimento hipofisário, os quais foram acompanhados no Ambulatório de Endocrinologia do Desenvolvimento com a metodologia de Sanger, foi de 13,4%, avaliando os genes GH1, GHRHR, HESX1, PROP1 e GLI2. Corroborou-se também esse dado por metanálise realizada por De Rienzo et al. com estimativa de 12,4%, podendo chegar a 63% em casos familiares (3) . Conclusão: Na filtragem de variant call formats (VCF), em busca de variantes alélicas deletérias e mutation annotation format (MAF) 1%, foram encontrados dois casos: paciente 1, com variante alélica no gene GH1 c.171delT (p.Phe 57Leufs*43), e paciente 2, com gene CDH2 c.865G>A (p.Val289Ile). Portanto, o diagnóstico molecular foi esclarecido em 12,5% (2/16) ao avaliar pacientes com hipopituitarismo congênito. Assim, a maioria permaneceu sem diagnóstico molecular, sugerindo outros mecanismos não avaliados, como poligenicidade, variantes não exônicas, fatores epignéticos e ambientais responsáveis pelo fenótipo.
id USP_bcb36eb6c26520762ebfcb18dda18f5f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-28092021-105818
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênitoMolecular investigation by exome in consanguineous patients with congenital hypopituitarism.Análise molecularAnormalidades congênitasCongenital abnormalities Dwarfism pituitaryConsanguinidadeConsanguinityCytogenetic analysis.ExomaExomeHipopituitarismoHypopituitarismNanismo hipofisárioObjetivo: O hipopituitarismo congênito é a deficiência de um ou mais hormônios hipofisários, sendo muito comum a deficiência do hormônio de crescimento (GH). Pode também ser isolado ou estar associado à deficiência de outros hormônios da hipófise (1) . Este trabalho teve por objetivo de avaliar o exoma em filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, para não apenas determinar a etiologia genética nessa população de alta suscetibilidade, mas também fazer, quando necessário, a relação genótipo-fenótipo com posterior estudo funcional. Pacientes e Método: Avaliação do exoma em 16 pacientes, filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, que são acompanhados no ambulatório de hipopituitarismo da Unidade de Endocrinologia do Desenvolvimento. O desenvolvimento das técnicas de biologia molecular com análise da região traduzida de todos os éxons do genoma humano, denominado exoma ou sequenciamento paralelo em larga escala (SPLE), levou ao diagnóstico molecular crescente na pesquisa de doenças genéticas. Os modelos animais foram uma ferramenta importante na busca da associação de genótipo-fenótipo em humanos através da pesquisa de variantes em genes específicos encontrados com alterações em camundongos e, depois, avaliados em humanos pelo método de Sanger (2) . Resultados: A taxa de diagnóstico molecular de pacientes portadores de distúrbios do desenvolvimento hipofisário, os quais foram acompanhados no Ambulatório de Endocrinologia do Desenvolvimento com a metodologia de Sanger, foi de 13,4%, avaliando os genes GH1, GHRHR, HESX1, PROP1 e GLI2. Corroborou-se também esse dado por metanálise realizada por De Rienzo et al. com estimativa de 12,4%, podendo chegar a 63% em casos familiares (3) . Conclusão: Na filtragem de variant call formats (VCF), em busca de variantes alélicas deletérias e mutation annotation format (MAF) 1%, foram encontrados dois casos: paciente 1, com variante alélica no gene GH1 c.171delT (p.Phe 57Leufs*43), e paciente 2, com gene CDH2 c.865G>A (p.Val289Ile). Portanto, o diagnóstico molecular foi esclarecido em 12,5% (2/16) ao avaliar pacientes com hipopituitarismo congênito. Assim, a maioria permaneceu sem diagnóstico molecular, sugerindo outros mecanismos não avaliados, como poligenicidade, variantes não exônicas, fatores epignéticos e ambientais responsáveis pelo fenótipo.Objective: Congenital hypopituitarism is the deficiency of one or more pituitary hormones, with GH deficiency being very common. It can be isolated or associated with deficiency of other pituitary hormones 1 . This study had the objective of evaluating the exome in patients with congenital hypopituitarism, children of consanguineous parents, in order not only to determine the genetic etiology in this discharge population susceptibility, but also, whenever necessary, to make the genotype-phenotype relationship with later functional study. Patients and Methodology: Exome evaluation in 16 patients, children of consanguineous parents and patients with congenital hypopituitarism, who follow up at the hypopituitarism outpatient clinic of the Development Endocrinology Unit. The development of molecular biology techniques with the analysis of the translated region of all exons of the human genome, called exome or next generation sequencing, has led to an increasing molecular diagnosis in the search for genetic diseases. Animal models were an important tool in the search for genotype-phenotype association in humans through the search for variants in specific genes found altered in mice and evaluated in humans by the Sanger method. Results: The molecular diagnosis of patients with pituitary developmental disorders monitored at the development endocrinology outpatient clinic, using the Sanger 2 methodology, was 13.4%, evaluating the GH1, GHGR, HESX1, PROP1 and GLI2 genes. This data was also corroborated by a meta- analysis, carried out by De Rienzo et al., which was estimated at 12.4%, reaching 63% in family 3 cases. Conclusion: In the filtering of variant call formats (VCF), in the search for harmful allelic variants and mutation annotation format (MAF) 1%, there were two cases: patient 1, with allelic variant in the gene GH1 c.171delT (p.Phe 57Leufs*43), and patient 2, with gene CDH2 c.865G>A (p.Val289Ile). Therefore, the molecular diagnosis was clarified in 12.5% (2/16) of the patients with congenital hypopituitarism evaluated. Thus, the majority remained without molecular diagnosis, suggesting other mechanisms not evaluated, such as polygenicity, non- exonic variants, epigenetic and environmental factors responsible for the phenotype.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCarvalho, Luciani Renata Silveira deFerreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira2021-05-07info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-28092021-105818/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-09-29T18:27:02Zoai:teses.usp.br:tde-28092021-105818Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-09-29T18:27:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
Molecular investigation by exome in consanguineous patients with congenital hypopituitarism.
title Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
spellingShingle Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
Ferreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira
Análise molecular
Anormalidades congênitas
Congenital abnormalities Dwarfism pituitary
Consanguinidade
Consanguinity
Cytogenetic analysis.
Exoma
Exome
Hipopituitarismo
Hypopituitarism
Nanismo hipofisário
title_short Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
title_full Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
title_fullStr Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
title_full_unstemmed Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
title_sort Investigação molecular por exoma em pacientes consanguíneos com hipopituitarismo congênito
author Ferreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira
author_facet Ferreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Carvalho, Luciani Renata Silveira de
dc.contributor.author.fl_str_mv Ferreira, Nathalia Garcia Bianchi Pereira
dc.subject.por.fl_str_mv Análise molecular
Anormalidades congênitas
Congenital abnormalities Dwarfism pituitary
Consanguinidade
Consanguinity
Cytogenetic analysis.
Exoma
Exome
Hipopituitarismo
Hypopituitarism
Nanismo hipofisário
topic Análise molecular
Anormalidades congênitas
Congenital abnormalities Dwarfism pituitary
Consanguinidade
Consanguinity
Cytogenetic analysis.
Exoma
Exome
Hipopituitarismo
Hypopituitarism
Nanismo hipofisário
description Objetivo: O hipopituitarismo congênito é a deficiência de um ou mais hormônios hipofisários, sendo muito comum a deficiência do hormônio de crescimento (GH). Pode também ser isolado ou estar associado à deficiência de outros hormônios da hipófise (1) . Este trabalho teve por objetivo de avaliar o exoma em filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, para não apenas determinar a etiologia genética nessa população de alta suscetibilidade, mas também fazer, quando necessário, a relação genótipo-fenótipo com posterior estudo funcional. Pacientes e Método: Avaliação do exoma em 16 pacientes, filhos de pais consanguíneos e portadores de hipopituitarismo congênito, que são acompanhados no ambulatório de hipopituitarismo da Unidade de Endocrinologia do Desenvolvimento. O desenvolvimento das técnicas de biologia molecular com análise da região traduzida de todos os éxons do genoma humano, denominado exoma ou sequenciamento paralelo em larga escala (SPLE), levou ao diagnóstico molecular crescente na pesquisa de doenças genéticas. Os modelos animais foram uma ferramenta importante na busca da associação de genótipo-fenótipo em humanos através da pesquisa de variantes em genes específicos encontrados com alterações em camundongos e, depois, avaliados em humanos pelo método de Sanger (2) . Resultados: A taxa de diagnóstico molecular de pacientes portadores de distúrbios do desenvolvimento hipofisário, os quais foram acompanhados no Ambulatório de Endocrinologia do Desenvolvimento com a metodologia de Sanger, foi de 13,4%, avaliando os genes GH1, GHRHR, HESX1, PROP1 e GLI2. Corroborou-se também esse dado por metanálise realizada por De Rienzo et al. com estimativa de 12,4%, podendo chegar a 63% em casos familiares (3) . Conclusão: Na filtragem de variant call formats (VCF), em busca de variantes alélicas deletérias e mutation annotation format (MAF) 1%, foram encontrados dois casos: paciente 1, com variante alélica no gene GH1 c.171delT (p.Phe 57Leufs*43), e paciente 2, com gene CDH2 c.865G>A (p.Val289Ile). Portanto, o diagnóstico molecular foi esclarecido em 12,5% (2/16) ao avaliar pacientes com hipopituitarismo congênito. Assim, a maioria permaneceu sem diagnóstico molecular, sugerindo outros mecanismos não avaliados, como poligenicidade, variantes não exônicas, fatores epignéticos e ambientais responsáveis pelo fenótipo.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-05-07
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-28092021-105818/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-28092021-105818/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257443553247232