Concordância entre perfil de restrição do fragmento 16S rDNA e testes fenotípicos para determinação do posicionamento taxonômico de cepas de Aeromonas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Uehara, Flávio Issao
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6135/tde-07112023-154327/
Resumo: A taxonomia do gênero Aeromonas é controversa e sofre mudanças constantemente, isso devido às novas espécies que vêm sendo descritas, reclassificadas ou de estudos mais aprofundados em espécies já conhecidas. Devido a heterogeneidade fenotípica e genotípica apresentada entre as espécies do gênero, consideráveis esforços estão direcionados para o desenvolvimento de métodos que permitam identificar e classificar corretamente as espécies de Aeromonas. Com base no 16S rDNA das espécies de Aeromonas, o presente estudo propõe um par de iniciadores gênero-específico para o Aeromonas e um esquema utilizando enzimas de restrição para identificação das espécies do gênero. Foram analisadas 40 cepas de amostras ambientais, previamente identificadas fenotipicamente como membros do gênero Aeromonas, todas as cepas foram confirmadas com o par de iniciadores gênero-especifco. Os resultados da identificação das espécies utilizando o esquema de RFLP foi seguinte A. jandaei 35%, A. hydrophila 30%, A. trota 5%, A. aquariorum 12,5%. A. veronii 10%, e A. media 7,5%. Os métodos apresentados no estudo podem ser empregados na rotina laboratorial podendo ser útil no estudo epidemiológico do gênero Aeromonas bem como na determinação da real distribuição dos organismos deste gênero nos diferentes ambientes, em alimentos e em casos clínicos.
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spelling Concordância entre perfil de restrição do fragmento 16S rDNA e testes fenotípicos para determinação do posicionamento taxonômico de cepas de AeromonasConsistency between profile of restriction fragment of the 16S rDNA and phenotypic tests to determine the taxonomic position of strains of AeromonasAeromonas/classificaçãoAeromonas/classificationAeromonas/genéticaAeromonas/geneticsA taxonomia do gênero Aeromonas é controversa e sofre mudanças constantemente, isso devido às novas espécies que vêm sendo descritas, reclassificadas ou de estudos mais aprofundados em espécies já conhecidas. Devido a heterogeneidade fenotípica e genotípica apresentada entre as espécies do gênero, consideráveis esforços estão direcionados para o desenvolvimento de métodos que permitam identificar e classificar corretamente as espécies de Aeromonas. Com base no 16S rDNA das espécies de Aeromonas, o presente estudo propõe um par de iniciadores gênero-específico para o Aeromonas e um esquema utilizando enzimas de restrição para identificação das espécies do gênero. Foram analisadas 40 cepas de amostras ambientais, previamente identificadas fenotipicamente como membros do gênero Aeromonas, todas as cepas foram confirmadas com o par de iniciadores gênero-especifco. Os resultados da identificação das espécies utilizando o esquema de RFLP foi seguinte A. jandaei 35%, A. hydrophila 30%, A. trota 5%, A. aquariorum 12,5%. A. veronii 10%, e A. media 7,5%. Os métodos apresentados no estudo podem ser empregados na rotina laboratorial podendo ser útil no estudo epidemiológico do gênero Aeromonas bem como na determinação da real distribuição dos organismos deste gênero nos diferentes ambientes, em alimentos e em casos clínicos.Many studies over the past years showed the phenotypical and genomic heterogeneity among the species of the genus Aeormonas. Considerable efforts are aimed at the development of a method that allows identifying and classifying correctly the species of the genus Aeromonas. Based on the 16S rDNA of the Aeromonas species, the present study proposes a pair of primers genus-specific for Aeromonas and a scheme using restriction enzymes to identífy the species of the genus. Forty Aeromonas strains from different environmental sources, previously identified, by phenotypic tests, as a member of the genus Aeromonas, were submitted to PCR using the genus-specific primers, all the forty strains were confirmed as a member of the genus Aeromonas. The results of the identification using RFLP scheme were: A. jandaei 35%, A. hydrophila 30%, A. trota 5%, A. aquariorum 12,5%. A. veronii 10%, e A. media 7 ,5%. The methods proposed in this study could be used in the laboratory routine and could be useful in epidemiological studies of the genus Aeromonas contributing to assess the real distribution of this genus in different environments, foods and clinicai samples.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMatté, Maria HelenaUehara, Flávio Issao2008-09-05info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6135/tde-07112023-154327/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-11-07T17:53:02Zoai:teses.usp.br:tde-07112023-154327Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-11-07T17:53:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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