Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-10062019-162252/ |
Resumo: | Sistemas de recuperação de imagens por conteúdo (do inglês Content-based ImageRetrieval - CBIR) têm sido cada vez mais utilizados em diversas aplicações de tratamento e análise de imagens, devido a dois fatores: CBIR é um procedimento que pode ser feito automaticamente, permitindo tratar o grande volume de imagens adquiridos em hospitais, e também é a base para o processamento de consultas por similaridade. No contexto médico tais sistemas auxiliam em diversas tarefas, desde treinamento de profissionais até em sistemas de auxílio a diagnóstico (do inglês Computer-Aided Diagnosis - CAD). Um sistema computacional capaz de comparar e classificar imagens obtidas em exames de pacientes utilizando uma base prévia de conhecimento poderia agilizar o atendimento da população e fornecer aos especialistas informações relevantes de forma rápida e simples. Neste trabalho, o foco foi na análise de imagens de úlceras venosas. Foram desenvolvidas duas técnicas para classificação dessas imagens. A primeira, denominada Counting-Labels Similarity Measure (CL-Measure) possuia vantagem de lidar com imagens segmentadas de forma automática, por superpixels, e ser versátil o suficiente para permitir adaptação para outros domínios. A ideia principal do CL-Measure consiste na criação de sub-imagens baseadas em uma classificação prévia, calcular a distância entre elas e agregar as distâncias parciais obtidas a partir de uma função apropriada. A segunda técnica, denominada Quality of Tissues from Dermatological Ulcers(QTDU), faz uso de redes convolucionais (CNNs) para rotulação dos superpixels com a vantagem de compor todo o processo de identificação de características e classificação, dispensando a necessidade de identificar qual o extrator de características mais adequado para o contexto em questão. Experimentos realizados sobre a base de imagens analisada, utilizando 179572 super pixels divididos em 4 classes, indicam que a QTDU é a abordagem mais eficaz até o momento para o contexto de classificação de imagens dermatológicas, com médias de AUC=0,986, sensitividade = 0,97,e especificidade=0,974 superando as abordagens anteriores baseadas em aprendizado de máquina em 11;7% e 8;2% considerando o coeficiente KAPPAeF-Measure, respectivamente. |
id |
USP_f8a313920a627a0849292020e081c089 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-10062019-162252 |
network_acronym_str |
USP |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository_id_str |
2721 |
spelling |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundoClassification of venous dermatological ulcers to support similarity queries using superpixels and deep learningCBIRCBIRCNNCNNConsultas por similaridadeImage processingProcessamento de imagensSimilarity searchSistemas de recuperação de imagens por conteúdo (do inglês Content-based ImageRetrieval - CBIR) têm sido cada vez mais utilizados em diversas aplicações de tratamento e análise de imagens, devido a dois fatores: CBIR é um procedimento que pode ser feito automaticamente, permitindo tratar o grande volume de imagens adquiridos em hospitais, e também é a base para o processamento de consultas por similaridade. No contexto médico tais sistemas auxiliam em diversas tarefas, desde treinamento de profissionais até em sistemas de auxílio a diagnóstico (do inglês Computer-Aided Diagnosis - CAD). Um sistema computacional capaz de comparar e classificar imagens obtidas em exames de pacientes utilizando uma base prévia de conhecimento poderia agilizar o atendimento da população e fornecer aos especialistas informações relevantes de forma rápida e simples. Neste trabalho, o foco foi na análise de imagens de úlceras venosas. Foram desenvolvidas duas técnicas para classificação dessas imagens. A primeira, denominada Counting-Labels Similarity Measure (CL-Measure) possuia vantagem de lidar com imagens segmentadas de forma automática, por superpixels, e ser versátil o suficiente para permitir adaptação para outros domínios. A ideia principal do CL-Measure consiste na criação de sub-imagens baseadas em uma classificação prévia, calcular a distância entre elas e agregar as distâncias parciais obtidas a partir de uma função apropriada. A segunda técnica, denominada Quality of Tissues from Dermatological Ulcers(QTDU), faz uso de redes convolucionais (CNNs) para rotulação dos superpixels com a vantagem de compor todo o processo de identificação de características e classificação, dispensando a necessidade de identificar qual o extrator de características mais adequado para o contexto em questão. Experimentos realizados sobre a base de imagens analisada, utilizando 179572 super pixels divididos em 4 classes, indicam que a QTDU é a abordagem mais eficaz até o momento para o contexto de classificação de imagens dermatológicas, com médias de AUC=0,986, sensitividade = 0,97,e especificidade=0,974 superando as abordagens anteriores baseadas em aprendizado de máquina em 11;7% e 8;2% considerando o coeficiente KAPPAeF-Measure, respectivamente.Content-based Image Retrieval (CBIR) systems have been increasingly used in many image processing and analysis applications because of two factors: CBIR is a procedure that can be done automatically, allowing to handle the large volume of images acquired in hospitals, and it is also the basis for processing similarity queries. In the medical context, such systems assist in various tasks, from training of professionals to develop Computer-Aided Diagnosis CAD systems. A computer system capable of comparing and classifying images obtained from patient exams using a prior knowledge base could expedite the care of the population and provide specialists with relevant information quickly. In this study, the focus was on the analysis of images of venous ulcers. Two techniques were developed to classify these images. The first, called Counting-Labels Similarity Measure (CL-Measure) has the advantage of dealing with automatically segmented images by superpixels, and is versatile enough to allow adaptation to other domains. The main idea of CL-Measure is to create sub-images based on a previous classification, calculate the distance between them and add the partial distances obtained from an appropriate function. The second technique, called Quality of Tissues from Dermatological Ulcers (QTDU), makes use of convolutional networks (CNNs) for superpixels labeling, with the advantage of encompassing the whole process of identification of features and classification, without the need of identifying which extractor would be the best for the context in question. Experiments carried out on the image database using 179,572 superpixels divided into 4 classes, indicate that the QTDU is the most effective approach to date for the context of classification of dermatological ulcer images, with averages of AUC = 0.986, sensitivity = 0.97 , and specificity = 0.974, surpassing previous approaches based on machine learning in 11.7% and 8.2% considering the KAPPA and F-Measure coefficients, respectively.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPTraina, Agma Juci MachadoBlanco, Gustavo2019-04-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-10062019-162252/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2019-07-04T17:58:14Zoai:teses.usp.br:tde-10062019-162252Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212019-07-04T17:58:14Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo Classification of venous dermatological ulcers to support similarity queries using superpixels and deep learning |
title |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
spellingShingle |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo Blanco, Gustavo CBIR CBIR CNN CNN Consultas por similaridade Image processing Processamento de imagens Similarity search |
title_short |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
title_full |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
title_fullStr |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
title_full_unstemmed |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
title_sort |
Classificação de úlceras venosas dermatológicas para apoio a consultas por similaridade utilizando superpixels e aprendizado profundo |
author |
Blanco, Gustavo |
author_facet |
Blanco, Gustavo |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Traina, Agma Juci Machado |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Blanco, Gustavo |
dc.subject.por.fl_str_mv |
CBIR CBIR CNN CNN Consultas por similaridade Image processing Processamento de imagens Similarity search |
topic |
CBIR CBIR CNN CNN Consultas por similaridade Image processing Processamento de imagens Similarity search |
description |
Sistemas de recuperação de imagens por conteúdo (do inglês Content-based ImageRetrieval - CBIR) têm sido cada vez mais utilizados em diversas aplicações de tratamento e análise de imagens, devido a dois fatores: CBIR é um procedimento que pode ser feito automaticamente, permitindo tratar o grande volume de imagens adquiridos em hospitais, e também é a base para o processamento de consultas por similaridade. No contexto médico tais sistemas auxiliam em diversas tarefas, desde treinamento de profissionais até em sistemas de auxílio a diagnóstico (do inglês Computer-Aided Diagnosis - CAD). Um sistema computacional capaz de comparar e classificar imagens obtidas em exames de pacientes utilizando uma base prévia de conhecimento poderia agilizar o atendimento da população e fornecer aos especialistas informações relevantes de forma rápida e simples. Neste trabalho, o foco foi na análise de imagens de úlceras venosas. Foram desenvolvidas duas técnicas para classificação dessas imagens. A primeira, denominada Counting-Labels Similarity Measure (CL-Measure) possuia vantagem de lidar com imagens segmentadas de forma automática, por superpixels, e ser versátil o suficiente para permitir adaptação para outros domínios. A ideia principal do CL-Measure consiste na criação de sub-imagens baseadas em uma classificação prévia, calcular a distância entre elas e agregar as distâncias parciais obtidas a partir de uma função apropriada. A segunda técnica, denominada Quality of Tissues from Dermatological Ulcers(QTDU), faz uso de redes convolucionais (CNNs) para rotulação dos superpixels com a vantagem de compor todo o processo de identificação de características e classificação, dispensando a necessidade de identificar qual o extrator de características mais adequado para o contexto em questão. Experimentos realizados sobre a base de imagens analisada, utilizando 179572 super pixels divididos em 4 classes, indicam que a QTDU é a abordagem mais eficaz até o momento para o contexto de classificação de imagens dermatológicas, com médias de AUC=0,986, sensitividade = 0,97,e especificidade=0,974 superando as abordagens anteriores baseadas em aprendizado de máquina em 11;7% e 8;2% considerando o coeficiente KAPPAeF-Measure, respectivamente. |
publishDate |
2019 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2019-04-01 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-10062019-162252/ |
url |
http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-10062019-162252/ |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
|
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
instacron_str |
USP |
institution |
USP |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
_version_ |
1815256913693114368 |