Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pereira, Lucas Campana
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-27022013-155152/
Resumo: O presente trabalho visa, através de métodos genético-epidemiológicos, identificarem genes associados à resposta ao antígeno da Leishmania. Utilizando amostras através do teste de Montenegro dos municípios de Monte Negro (RO) e Assis Brasil (AC). Na primeira abordagem foram feitos testes com TaqMan&#210 e a segunda com GWAS, e análises de associação foram feitas utilizando-se o pacote SPSS e o Plink. Não foram encontradas associações com cinco SNPs (MYD88, IL12, IL10, IFNGR1 e NRAMP1). A análise de dados de varredura genômica com filtros, indicou uma região no cromossomo 10 com 3 SNPs próximos que fazem parte de uma região regulatória que com o posterior auxilio do real time não se confirmaram, apesar do ensaio RS11251056 apresentar valores limítrofes, se tornando uma possível indicação para trabalhos futuros e por fim a último teste foi a meta-análise, através do método de Woolf, apresentou resultados indicativos de associação para ensaios encontrados no cromossomo 2 com ZNF638 relacionados a diferenciação celular e também no cromossomo 10 que contem lincRNAs e o gene NGR3, com dois ensaios apresentando valores significativos de p, onde podemos inferir que estas duas regiões podem participar ativamente na diferenciação da resposta ao antígeno da Leishmania.
id USP_fee08486753e2b786ab05793b019900a
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-27022013-155152
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.Search for genes associated with response to the Montenegro skin test for Leishmania antigens.LeishmaniaLeishmaniaDoenças infecciosasEpidemiologiaEpidemiologyGenesGenesImmune systemInfectious diseaseSistema imuneO presente trabalho visa, através de métodos genético-epidemiológicos, identificarem genes associados à resposta ao antígeno da Leishmania. Utilizando amostras através do teste de Montenegro dos municípios de Monte Negro (RO) e Assis Brasil (AC). Na primeira abordagem foram feitos testes com TaqMan&#210 e a segunda com GWAS, e análises de associação foram feitas utilizando-se o pacote SPSS e o Plink. Não foram encontradas associações com cinco SNPs (MYD88, IL12, IL10, IFNGR1 e NRAMP1). A análise de dados de varredura genômica com filtros, indicou uma região no cromossomo 10 com 3 SNPs próximos que fazem parte de uma região regulatória que com o posterior auxilio do real time não se confirmaram, apesar do ensaio RS11251056 apresentar valores limítrofes, se tornando uma possível indicação para trabalhos futuros e por fim a último teste foi a meta-análise, através do método de Woolf, apresentou resultados indicativos de associação para ensaios encontrados no cromossomo 2 com ZNF638 relacionados a diferenciação celular e também no cromossomo 10 que contem lincRNAs e o gene NGR3, com dois ensaios apresentando valores significativos de p, onde podemos inferir que estas duas regiões podem participar ativamente na diferenciação da resposta ao antígeno da Leishmania.The present study aims, through genetic-epidemiological methods, to identify genes associated with response to Leishmania antigen. Using samples Montenegro skin test through the municipalities of Monte Negro (RO) and Assis Brazil (AC). In the first approach were tested with TaqMan&#210 and the second GWAS, and association analyzes were performed using SPSS and Plink. No associations were found with five SNPs (MyD88, IL12, IL10, IFNGR1, and NRAMP1). The analysis of genome scan data with filters, indicated a region on chromosome 10 with three nearby SNPs that are part of a regulatory region that later with the help of real time is not confirmed, although the test rs11251056 have borderline values, becoming an possible direction for future work and finally the last test was the meta-analysis by the method of Woolf, presented results indicating the association found in tests for chromosome 2 with ZNF638 related to cell differentiation and also on chromosome 10 that contains lincRNAs and gene NGR3, two runs with a significant p value, where we can infer that these two regions can actively participate in the differentiation of the response to Leishmania antigen.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKrieger, HenriquePereira, Lucas Campana2012-10-09info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-27022013-155152/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:10:35Zoai:teses.usp.br:tde-27022013-155152Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:10:35Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
Search for genes associated with response to the Montenegro skin test for Leishmania antigens.
title Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
spellingShingle Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
Pereira, Lucas Campana
Leishmania
Leishmania
Doenças infecciosas
Epidemiologia
Epidemiology
Genes
Genes
Immune system
Infectious disease
Sistema imune
title_short Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
title_full Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
title_fullStr Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
title_full_unstemmed Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
title_sort Busca de genes associados à resposta ao teste de Montenegro para antígenos de Leishmania.
author Pereira, Lucas Campana
author_facet Pereira, Lucas Campana
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Krieger, Henrique
dc.contributor.author.fl_str_mv Pereira, Lucas Campana
dc.subject.por.fl_str_mv Leishmania
Leishmania
Doenças infecciosas
Epidemiologia
Epidemiology
Genes
Genes
Immune system
Infectious disease
Sistema imune
topic Leishmania
Leishmania
Doenças infecciosas
Epidemiologia
Epidemiology
Genes
Genes
Immune system
Infectious disease
Sistema imune
description O presente trabalho visa, através de métodos genético-epidemiológicos, identificarem genes associados à resposta ao antígeno da Leishmania. Utilizando amostras através do teste de Montenegro dos municípios de Monte Negro (RO) e Assis Brasil (AC). Na primeira abordagem foram feitos testes com TaqMan&#210 e a segunda com GWAS, e análises de associação foram feitas utilizando-se o pacote SPSS e o Plink. Não foram encontradas associações com cinco SNPs (MYD88, IL12, IL10, IFNGR1 e NRAMP1). A análise de dados de varredura genômica com filtros, indicou uma região no cromossomo 10 com 3 SNPs próximos que fazem parte de uma região regulatória que com o posterior auxilio do real time não se confirmaram, apesar do ensaio RS11251056 apresentar valores limítrofes, se tornando uma possível indicação para trabalhos futuros e por fim a último teste foi a meta-análise, através do método de Woolf, apresentou resultados indicativos de associação para ensaios encontrados no cromossomo 2 com ZNF638 relacionados a diferenciação celular e também no cromossomo 10 que contem lincRNAs e o gene NGR3, com dois ensaios apresentando valores significativos de p, onde podemos inferir que estas duas regiões podem participar ativamente na diferenciação da resposta ao antígeno da Leishmania.
publishDate 2012
dc.date.none.fl_str_mv 2012-10-09
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-27022013-155152/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-27022013-155152/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809091115934023680

Registros relacionados