Avaliação de resistência aos antibióticos de bactérias Escherichia coli presentes nos rios da bacia hidrográfica do Ribeirão dos Padilhas, Curitiba-PR: estudo de caso

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Autor(a) principal: Bianchi, Thiago Lima
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/31076
Resumo: A Escherichia coli faz parte do grupo de enterobactérias naturalmente presentes no trato gastrointestinal humano. Algumas estirpes, em função de seus fatores de virulência e sorologia específicos, apresentam características de patogenicidade aos seres humanos, desencadeando gastroenterites e algumas infecções, especialmente urinárias. Além da patogenicidade, a resistência aos antibióticos tem se tornado outra ameaça emergente pelas autoridades públicas, conforme retrata a Organização Mundial da Saúde. Com base nisto, foram realizados Testes de Suscetibilidade aos Antibióticos (TSA) de cepas de E. coli, detectadas em diferentes pontos de coleta na bacia hidrográfica do ribeirão dos Padilhas, situados no rio principal e seus afluentes. O objetivo do presente estudo foi delinear o perfil microbiológico de cepas de E. coli, encontradas nos corpos hídricos da bacia, quando da presença dos antibióticos amicacina, amoxicilina, ceftriaxona, ciprofloxacina e cloranfenicol e discorrer de seus impactos na saúde pública da região. Depois de detectadas, as colônias de E. coli foram isoladas e cultivadas em meios de cultura específicos seguindo os procedimentos padrões da APHA e, atingido o tempo de cultivo pré-estabelecido, foram depositados discos de antibióticos comerciais sobre os meios de cultura inoculados em placas de petri, possibilitando classificar as cepas em resistentes, de resistência intermediária ou suscetíveis, conforme os halos de inibição medidos, adotando como padrão de qualidade a cepa ATCC 25922. Dos 35 pontos amostrados, em 17 foram detectadas colônias de E. coli, das quais 88,2% se mostraram resistentes à amicacina, 100% à amoxicilina, 70,5% ao ceftriaxona, 94,1% à ciprofloxacina e 88,2% ao cloranfenicol. Esta verificação levou à constatação de uma alta variabilidade genética das cepas estudadas, corroborando com a necessidade da intervenção de profissionais dos mais diversos segmentos a fim de estabelecer uma gestão mais efetiva e abrangente dos corpos hídricos da região, bem como de profissionais da área da saúde, quando da adoção do tratamento mais eficaz no combate às cepas de E. coli consideradas patogênicas ao organismo humano.
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spelling 2023-04-05T18:32:53Z2023-04-05T18:32:53Z2022-08-29BIANCHI, Thiago Lima. Avaliação de resistência aos antibióticos de bactérias Escherichia coli presentes nos rios da bacia hidrográfica do Ribeirão dos Padilhas, Curitiba-PR: estudo de caso. 2023. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, 2022.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/31076A Escherichia coli faz parte do grupo de enterobactérias naturalmente presentes no trato gastrointestinal humano. Algumas estirpes, em função de seus fatores de virulência e sorologia específicos, apresentam características de patogenicidade aos seres humanos, desencadeando gastroenterites e algumas infecções, especialmente urinárias. Além da patogenicidade, a resistência aos antibióticos tem se tornado outra ameaça emergente pelas autoridades públicas, conforme retrata a Organização Mundial da Saúde. Com base nisto, foram realizados Testes de Suscetibilidade aos Antibióticos (TSA) de cepas de E. coli, detectadas em diferentes pontos de coleta na bacia hidrográfica do ribeirão dos Padilhas, situados no rio principal e seus afluentes. O objetivo do presente estudo foi delinear o perfil microbiológico de cepas de E. coli, encontradas nos corpos hídricos da bacia, quando da presença dos antibióticos amicacina, amoxicilina, ceftriaxona, ciprofloxacina e cloranfenicol e discorrer de seus impactos na saúde pública da região. Depois de detectadas, as colônias de E. coli foram isoladas e cultivadas em meios de cultura específicos seguindo os procedimentos padrões da APHA e, atingido o tempo de cultivo pré-estabelecido, foram depositados discos de antibióticos comerciais sobre os meios de cultura inoculados em placas de petri, possibilitando classificar as cepas em resistentes, de resistência intermediária ou suscetíveis, conforme os halos de inibição medidos, adotando como padrão de qualidade a cepa ATCC 25922. Dos 35 pontos amostrados, em 17 foram detectadas colônias de E. coli, das quais 88,2% se mostraram resistentes à amicacina, 100% à amoxicilina, 70,5% ao ceftriaxona, 94,1% à ciprofloxacina e 88,2% ao cloranfenicol. Esta verificação levou à constatação de uma alta variabilidade genética das cepas estudadas, corroborando com a necessidade da intervenção de profissionais dos mais diversos segmentos a fim de estabelecer uma gestão mais efetiva e abrangente dos corpos hídricos da região, bem como de profissionais da área da saúde, quando da adoção do tratamento mais eficaz no combate às cepas de E. coli consideradas patogênicas ao organismo humano.Escherichia coli is part of the enterobacteria present in the human gastrointestinal tract. Some strains, due to their virulence factors and specific serology, present characteristics of pathogenicity to human beings, triggering gastroenteritis and some infections, especially in the urinary tract. In addition to pathogenicity, antibiotic resistance has become another emerging threat by public authorities, as portrayed by the World Health Organization (WHO). Based on this, Antibiotic Susceptibility Tests (ATS) of E. coli strains were carried out, and detected at different collection points in the Padilhas river basin, located in the main river and its tributaries. The objective of the present study was to outline the microbiological profile of E. coli strains found in the water bodies of the basin, in the presence of the antibiotics amikacin, amoxicillin, ceftriaxone, ciprofloxacin and chloramphenicol, and to discuss their impacts on public health in the region. After being detected, the E. coli colonies were isolated and cultured in specific culture media following the APHA standard procedures and, after reaching the pre-established culture time, commercial antibiotic discs were disposed of onto the inoculated culture media in petri dishes, allowing classify the strains as resistant or susceptible according to the inhibition halos measured, adopting the ATCC 25922 strain as the quality standard. Of the 35 points sampled, 17 colonies of E. coli were detected, of which 88.2% were resistant to amikacin, 100% to amoxicillin, 70.5% to ceftriaxone, 94.1% to ciprofloxacin and 88.2% to chloramphenicol. This verification led to the finding of high genetic variability of the studied strains, corroborating the need for the intervention of professionals from the most diverse segments in order to establish more effective and comprehensive management of the water bodies, as well as health professionals aiming to adopt the most effective treatment to combat strains of E. coli considered pathogenic to the human body.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáCuritibaPrograma de Pós-Graduação em Engenharia CivilUTFPRBrasilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA SANITARIAEngenharia CivilMicro-organismos patogênicosAntibióticos - TestesDrogas - Resistência em micro-organismosBacias hidrográficas - Curitiba (PR)Contaminação microbianaEscherichia coliPathogenic microorganismsAntibiotics - TestingDrug resistance in microorganismsWatersheds - Curitiba (Brazil)Microbial contaminationAvaliação de resistência aos antibióticos de bactérias Escherichia coli presentes nos rios da bacia hidrográfica do Ribeirão dos Padilhas, Curitiba-PR: estudo de casoEvaluation of resistance to antibiotics of the bacteria Escherichia coli in the Padilha’s stream basin, Curitiba-PR: a case studyinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCuritibaPagioro, Thomaz Auréliohttps://orcid.org/0000-0002-2169-6989http://lattes.cnpq.br/3143740455413448Schellin, Lucy Martahttps://orcid.org/0000-0001-5683-5531http://lattes.cnpq.br/3166776358240189Freire, Flavio Benteshttps://orcid.org/0000-0002-5459-5578http://lattes.cnpq.br/5516837837393064Azevedo, Júlio César Rodrigues dehttps://orcid.org/0000-0001-5358-0713http://lattes.cnpq.br/8987771365126082Schellin, Lucy Martahttps://orcid.org/0000-0001-5683-5531http://lattes.cnpq.br/3166776358240189Froehner, Sandrohttps://orcid.org/0000-0003-1249-7512http://lattes.cnpq.br/5272424305045755Pagioro, Thomaz Auréliohttps://orcid.org/0000-0002-2169-6989http://lattes.cnpq.br/3143740455413448https://orcid.org/0000-0001-5796-4407http://lattes.cnpq.br/5979265835777923Bianchi, Thiago Limareponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRORIGINALavaliacaoresistenciabacteriasecoli.pdfapplication/pdf2682648http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/31076/1/avaliacaoresistenciabacteriasecoli.pdfcd1fa38b266fd68fb33af8f39df7845eMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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