Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Melo, Rafael Felipe Tasaka de
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/26469
Resumo: Algoritmos de Aprendizagem de Máquina vem sendo cada vez mais utilizados pela sua capacidade de aprender a partir de grandes volumes de dados como, por exemplo, dados de expressão gênica obtidos pela técnica de microarranjo. Uma característica das bases de dados de microarranjos é que, geralmente, ela é formada por uma grande quantidade de atributos e um pequeno número de amostras. Bases de dados com alta dimensionalidade podem possuir atributos redundantes e muitas vezes irrelevantes, podendo atrapalhar o processo de aprendizagem e o desempenho das predições. Métodos de redução de dimensionalidade são utilizados para reduzir a quantidade de atributos das bases de dados. Redes neurais autocodificadoras podem ser adaptadas e utilizadas para a extração de atributos e, consequentemente, a redução da dimensionalidade. Este trabalho tem como objetivo utilizar uma rede neural autocodificadora combinada a uma rede neural classificadora para realizar uma redução de dimensionalidade. Para isso, serão realizados experimentos em cinco bases de dados. Os resultados foram avaliados por meio da taxa de acerto dos classificadores KNN, SVM, Naive Bayes e Árvore de Decisão. Os resultados mostram que o método criou base de dados menores e que apresentam uma boa representação.
id UTFPR-12_79adb8d1d6a9f8dc9d5e6fcc86b1ea36
oai_identifier_str oai:repositorio.utfpr.edu.br:1/26469
network_acronym_str UTFPR-12
network_name_str Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
repository_id_str
spelling 2021-11-22T14:31:02Z2021-11-22T14:31:02Z2021-08-24MELO, Rafael Felipe Tasaka de. Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Ponta Grossa, 2021.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/26469Algoritmos de Aprendizagem de Máquina vem sendo cada vez mais utilizados pela sua capacidade de aprender a partir de grandes volumes de dados como, por exemplo, dados de expressão gênica obtidos pela técnica de microarranjo. Uma característica das bases de dados de microarranjos é que, geralmente, ela é formada por uma grande quantidade de atributos e um pequeno número de amostras. Bases de dados com alta dimensionalidade podem possuir atributos redundantes e muitas vezes irrelevantes, podendo atrapalhar o processo de aprendizagem e o desempenho das predições. Métodos de redução de dimensionalidade são utilizados para reduzir a quantidade de atributos das bases de dados. Redes neurais autocodificadoras podem ser adaptadas e utilizadas para a extração de atributos e, consequentemente, a redução da dimensionalidade. Este trabalho tem como objetivo utilizar uma rede neural autocodificadora combinada a uma rede neural classificadora para realizar uma redução de dimensionalidade. Para isso, serão realizados experimentos em cinco bases de dados. Os resultados foram avaliados por meio da taxa de acerto dos classificadores KNN, SVM, Naive Bayes e Árvore de Decisão. Os resultados mostram que o método criou base de dados menores e que apresentam uma boa representação.Machine Learning Algorithms have been increasingly used by its ability to learn from large volumes of data, such as gene expression data obtained by the microarray technique. A characteristic of the microarray data is that, generally, it is formed by a large amount of attributes and a few samples. It is known that data with high dimensionality can have redundant and often irrelevant attributes, it can hinder the learning process and the performance of predictions. Methods of dimensionality reduction are used to reduce the amount of attributes of the database. Autoencoder Neural Networks can be adapted and used for attribute extraction and, consequently, dimensionality reduction. This job aims to use an autoencoder neural network combined with a classifying neural network to perform a dimensionality reduction. For this, experiments will be carried out in five databases. The results were evaluated through the hit rate of the classifiers KNN, SVM, Naive Bayes and Decision Tree. The results show that the method created very representative smaller databases.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáPonta GrossaCiência da ComputaçãoUTFPRBrasilCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOMineração de dados (Computação)AlgorítmosAprendizado do computadorBanco de dadosData miningAlgorithmsMachine learningData basesRedução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadoraDimensionality reduction in microarray database using autoencoder neural networkinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisPonta GrossaBorges, Helyane BronoskiBorges, Helyane BronoskiMatos, Simone NasserRanthum, GeraldoMelo, Rafael Felipe Tasaka deinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81290http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/2/license.txtb9d82215ab23456fa2d8b49c5df1b95bMD52ORIGINALreducaodimensionalidadebasedados.pdfreducaodimensionalidadebasedados.pdfapplication/pdf1524704http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/1/reducaodimensionalidadebasedados.pdf2292f754ae9625b183bb307822599a11MD51TEXTreducaodimensionalidadebasedados.pdf.txtreducaodimensionalidadebasedados.pdf.txtExtracted texttext/plain89424http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/3/reducaodimensionalidadebasedados.pdf.txt5339e2328709a61b91c55bed3ac04a20MD53THUMBNAILreducaodimensionalidadebasedados.pdf.jpgreducaodimensionalidadebasedados.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1254http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/4/reducaodimensionalidadebasedados.pdf.jpgf59c8a9b71e85a279a468db84a925ccaMD541/264692021-11-23 04:06:08.195oai:repositorio.utfpr.edu.br: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ório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2021-11-23T06:06:08Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Dimensionality reduction in microarray database using autoencoder neural network
title Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
spellingShingle Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
Melo, Rafael Felipe Tasaka de
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Mineração de dados (Computação)
Algorítmos
Aprendizado do computador
Banco de dados
Data mining
Algorithms
Machine learning
Data bases
title_short Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
title_full Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
title_fullStr Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
title_full_unstemmed Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
title_sort Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora
author Melo, Rafael Felipe Tasaka de
author_facet Melo, Rafael Felipe Tasaka de
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Borges, Helyane Bronoski
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Borges, Helyane Bronoski
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Matos, Simone Nasser
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Ranthum, Geraldo
dc.contributor.author.fl_str_mv Melo, Rafael Felipe Tasaka de
contributor_str_mv Borges, Helyane Bronoski
Borges, Helyane Bronoski
Matos, Simone Nasser
Ranthum, Geraldo
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
topic CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Mineração de dados (Computação)
Algorítmos
Aprendizado do computador
Banco de dados
Data mining
Algorithms
Machine learning
Data bases
dc.subject.por.fl_str_mv Mineração de dados (Computação)
Algorítmos
Aprendizado do computador
Banco de dados
Data mining
Algorithms
Machine learning
Data bases
description Algoritmos de Aprendizagem de Máquina vem sendo cada vez mais utilizados pela sua capacidade de aprender a partir de grandes volumes de dados como, por exemplo, dados de expressão gênica obtidos pela técnica de microarranjo. Uma característica das bases de dados de microarranjos é que, geralmente, ela é formada por uma grande quantidade de atributos e um pequeno número de amostras. Bases de dados com alta dimensionalidade podem possuir atributos redundantes e muitas vezes irrelevantes, podendo atrapalhar o processo de aprendizagem e o desempenho das predições. Métodos de redução de dimensionalidade são utilizados para reduzir a quantidade de atributos das bases de dados. Redes neurais autocodificadoras podem ser adaptadas e utilizadas para a extração de atributos e, consequentemente, a redução da dimensionalidade. Este trabalho tem como objetivo utilizar uma rede neural autocodificadora combinada a uma rede neural classificadora para realizar uma redução de dimensionalidade. Para isso, serão realizados experimentos em cinco bases de dados. Os resultados foram avaliados por meio da taxa de acerto dos classificadores KNN, SVM, Naive Bayes e Árvore de Decisão. Os resultados mostram que o método criou base de dados menores e que apresentam uma boa representação.
publishDate 2021
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2021-11-22T14:31:02Z
dc.date.available.fl_str_mv 2021-11-22T14:31:02Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2021-08-24
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MELO, Rafael Felipe Tasaka de. Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Ponta Grossa, 2021.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/26469
identifier_str_mv MELO, Rafael Felipe Tasaka de. Redução de dimensionalidade em base de dados de microarranjo usando rede neural autocodificadora. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Ponta Grossa, 2021.
url http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/26469
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Ponta Grossa
dc.publisher.program.fl_str_mv Ciência da Computação
dc.publisher.initials.fl_str_mv UTFPR
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Ponta Grossa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
instacron:UTFPR
instname_str Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
instacron_str UTFPR
institution UTFPR
reponame_str Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
collection Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/2/license.txt
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/1/reducaodimensionalidadebasedados.pdf
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/3/reducaodimensionalidadebasedados.pdf.txt
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26469/4/reducaodimensionalidadebasedados.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv b9d82215ab23456fa2d8b49c5df1b95b
2292f754ae9625b183bb307822599a11
5339e2328709a61b91c55bed3ac04a20
f59c8a9b71e85a279a468db84a925cca
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1797044031848448000