Caracterização molecular de acessos de jabuticabeiras do banco ativo de germoplasma da UTFPR com marcadores microssatélites
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Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) |
Texto Completo: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/702 |
Resumo: | O Brasil é país detentor de grande biodiversidade, no entanto pequena parcela dessa já foi estudada e catalogada. Os recentes avanços antrópicos sobre os ecossistemas naturais tem levado a sua rápida fragmentação e eliminação de alguns biótipos ainda não estudados ou catalogados. Nessa realidade de erosão genética acelerada encontra-se também espécies de jabuticabeira (Plinia sp.) que são endêmicas do Centro Sul/Sudoeste do Paraná, no ecossistema Floresta com Araucária. Medidas de conservação de germoplasma para uso atual e futuro, bem como táticas de manejo e conservação dos recursos naturais são preponderantes para reduzir ao mínimo os danos causados a biodiversidade brasileira. Para tanto é necessário entender a diversidade genética existente nos ecossistemas naturais, que é o insumo básico para a sobrevivência e evolução entre os indivíduos frente as modificações ambientais. No presente trabalho foi realizado a caracterização genética de 110 jabuticabeiras que constituem o banco ativo de germoplasma desta espécie na UTFPR – Câmpus Dois Vizinhos. Foi possível identificar a transferibilidade de 9 marcadores moleculares microssatélites (SSR) com caráter polimórfico para a população estudada, e realizar a padronização de reação de PCR para cada um deles. Da análise das jabuticabeiras do banco ativo de germoplasma chegou-se a conclusão de que o mesmo abrigou valor considerável de diversidade alélica. No entanto tal diversidade está mal distribuída, já que 11 indivíduos sozinhos já são capazes de representar 59,2% de todos alelos da coleção de 110 plantas. Os valores encontrados de heterozigosidade observada e conteúdo informativo (PIC) nessa subpopulação de 11 indivíduos foram superiores aos valores encontrados para o conjunto integral do banco ativo. O agrupamento dos indivíduos mostrou a existência de 8 diferentes grupos, sendo que 89 indivíduos ficaram no grupo 1, demonstrando o seu possível grau de parentesco e baixo nível de diversidade genética. |
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2014-02-07T15:46:06Z2014-02-07T15:46:06Z2013-12-16MARTINS, Diego Albino. Caracterização molecular de acessos de jabuticabeiras do banco ativo de germoplasma da UTFPR com marcadores microssatélites. 2013. 69 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Pato Branco, 2013.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/702O Brasil é país detentor de grande biodiversidade, no entanto pequena parcela dessa já foi estudada e catalogada. Os recentes avanços antrópicos sobre os ecossistemas naturais tem levado a sua rápida fragmentação e eliminação de alguns biótipos ainda não estudados ou catalogados. Nessa realidade de erosão genética acelerada encontra-se também espécies de jabuticabeira (Plinia sp.) que são endêmicas do Centro Sul/Sudoeste do Paraná, no ecossistema Floresta com Araucária. Medidas de conservação de germoplasma para uso atual e futuro, bem como táticas de manejo e conservação dos recursos naturais são preponderantes para reduzir ao mínimo os danos causados a biodiversidade brasileira. Para tanto é necessário entender a diversidade genética existente nos ecossistemas naturais, que é o insumo básico para a sobrevivência e evolução entre os indivíduos frente as modificações ambientais. No presente trabalho foi realizado a caracterização genética de 110 jabuticabeiras que constituem o banco ativo de germoplasma desta espécie na UTFPR – Câmpus Dois Vizinhos. Foi possível identificar a transferibilidade de 9 marcadores moleculares microssatélites (SSR) com caráter polimórfico para a população estudada, e realizar a padronização de reação de PCR para cada um deles. Da análise das jabuticabeiras do banco ativo de germoplasma chegou-se a conclusão de que o mesmo abrigou valor considerável de diversidade alélica. No entanto tal diversidade está mal distribuída, já que 11 indivíduos sozinhos já são capazes de representar 59,2% de todos alelos da coleção de 110 plantas. Os valores encontrados de heterozigosidade observada e conteúdo informativo (PIC) nessa subpopulação de 11 indivíduos foram superiores aos valores encontrados para o conjunto integral do banco ativo. O agrupamento dos indivíduos mostrou a existência de 8 diferentes grupos, sendo que 89 indivíduos ficaram no grupo 1, demonstrando o seu possível grau de parentesco e baixo nível de diversidade genética.Brazil is a country of great biodiversity holder, however small portion of that has been studied and cataloged. Recent advances human activities on natural ecosystems has led to its rapid fragmentation and elimination of some biotypes still, not it studied or cataloged. In this reality of genetic erosion is also accelerated jabuticaba tree species (Plinia sp.). That are endemic from South Central / Southeastern Paraná State, in Araucaria forest ecosystem. Germplasm conservation measures for current and future use, as well as tactics for management and conservation of natural resources are crucial to minimize the damage caused to Brazilian biodiversity. So it is necessary to understand the genetic diversity in natural ecosystems, which is the basic input for the survival and evolution among individuals facing environmental changes. In the present study was to characterize genetic of 110 jabuticaba tree fruit, that constitute the germoplasm bank of jabuticaba tree fruit from UTFPR - Câmpus Dois Vizinhos. It was possible to identify transferability of 9 microsatellite markers (SSR) with polymorphic character for the population studied, and it carry out standardization of PCR reaction for each of them. The analysis of plant germoplasm bank came to the conclusion that houses a considerable amount of allelic diversity, but this diversity is poorly distributed, since 11 individuals alone are already able to represent 59.2% of all alleles of the collection of 110 plant. The found values of, observed heterozygosity and information content (PIC) in this subpopulation of 11 individuals were higher than the values found for the full set of the germoplasm bank. The grouping of individuals showed the existence of 8 different groups, and 89 subjects were in group 1, demonstrating a possible relationship and low level of genetic diversity.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáPato BrancoPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaMarcadores genéticosRecursos do germoplasmaGenetic markersGermplasm resourcesCaracterização molecular de acessos de jabuticabeiras do banco ativo de germoplasma da UTFPR com marcadores microssatélitesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPato BrancoMestradoWagner Júnior, AméricoWaclawovsky, Alessandro JaquielMartins, Diego Albinoreponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessTHUMBNAILPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdf.jpgPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1388http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/702/4/PB_PPGAG_M_Martins%2c%20Diego%20Albino_2013.pdf.jpgb7eb7542107e6bbd21533e3845656cacMD54ORIGINALPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdfPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdfapplication/pdf4533883http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/702/1/PB_PPGAG_M_Martins%2c%20Diego%20Albino_2013.pdfce4e3017c4a65a426abae39af55780e7MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81220http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/702/2/license.txt3cbdb04c3d289deb9dca129a3870a6e1MD52TEXTPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdf.txtPB_PPGAG_M_Martins, Diego Albino_2013.pdf.txtExtracted texttext/plain124521http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/702/3/PB_PPGAG_M_Martins%2c%20Diego%20Albino_2013.pdf.txtfd7606fa1d403409ceff3819a0158c4bMD531/7022015-03-07 03:13:07.065oai:repositorio.utfpr.edu.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2015-03-07T06:13:07Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false |
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