Detection and partial molecular characterization of a Badnavirus isolate in Brazil / Detecção e caracterização molecular parcial de um isolado de Badnavírus no Brasil

• Autor(a) principal: Maich, Sílvia Letícia da Paz
• Data de Publicação: 2020
• Outros Autores: Neves, Carolina Garcia, Júnior, Ismail Teodoro de Souza, Nascimento, Monique Bezerra, Silva, Fábio Nascimento da, Barros, Danielle Ribeiro de
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Revista Veras
• Texto Completo: https://ojs.brazilianjournals.com.br/ojs/index.php/BRJD/article/view/14086
• topic: doenças infecciosas; Caulimoviridae; genoma parcial; variabilidade genética.

A batata doce é um dos vegetais mais importantes do mundo, sendo uma das principais fontes de nutrientes em alguns países. Apesar de ser considerada uma planta resistente, hospeda vários patógenos, principalmente vírus. Anteriormente, a maioria dos vírus relatados na colheita tinha um genoma composto por RNA, no entanto, nos últimos anos, os vírus de DNA se destacaram. Entre eles estão as espécies pertencentes ao gênero Badnavirus (família Caulimoviridae). Portanto, o objetivo do presente estudo foi identificar a presença de espécies virais pertencentes ao gênero Badnavirus em amostras de folhas de batata-doce coletadas nas principais regiões produtoras da cidade de Pelotas - RS. Através da amplificação por PCR, foi possível detectar 48 amostras positivas entre as 303 amostras testadas, utilizando iniciadores degenerados e específicos para espécies do gênero. Uma amostra foi escolhida e usada para análise com outros pares de iniciadores específicos, a fim de obter sequências genômicas. No entanto, não foi possível obter a sequência completa do genoma, apenas parcial. Os fragmentos gerados mostraram uma identidade entre 72 a 87% quando comparados ao genoma completo dos isolados SPV-A (FJ560943.2) e SPV-B (FJ560944.1), demonstrando a grande variabilidade existente entre eles. Além disso, serão realizados estudos para obter a sequência completa do genoma, para entender melhor a ação do vírus na planta.