Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains

Ruiz, Jerônimo Conceição; D'Afonseca, Vívian; Silva, Artur; Ali, Amjad; Pinto, Anne Cybelle; Santos, Anderson Rodrigues dos; Rocha, Aryane Aparecida Magalhães Cassiano; Lopes, Débora de Oliveira; Dorella, Fernanda Alves; Pacheco, Luis Gustavo Carvalho; Costa, Marcilia Pinheiro da; Turk, Meritxell Zurita; Seyffert, Núbia; Moraes, Pablo Matias Ribeiro de Oliveira; Soares, Siomar de Castro; Almeida, Sintia Silva de; Castro, Thiago Luiz de Paula; Abreu, Vinicius Augusto Carvalho de; Trost, Eva; Baumbach, Jan; Tauch, Andreas; Schneider, Maria Paula Cruz; McCulloch, John; Cerdeira, Louise Teixeira; Ramos, Rommel Thiago Juca; Zerlotini, Adhemar; Dominitini, Anderson; Resende, Daniela de Melo; Cóser, Elisangela Monteiro; Oliveira, Luciana Márcia de; Pedrosa, André Luiz; Vieira, Carlos Ueira; Guimarães, Cláudia Teixeira; Bartholomeu, Daniella Castanheira; Oliveira, Diana Magalhães de; Santos, Fabrício Rodrigues dos; Rabelo, Élida Mara; Lobo, Francisco Pereira; Franco, Gloria Regina; Costa, Ana Flávia; Castro, Ieso de Miranda; Dias, Sílvia Regina Costa; Ferro, Jesus Aparecido; Ortega, José Miguel; Paiva, Luciano Vilela; Goulart Filho, Luiz Ricardo; Almeida, Juliana Franco; Ferro, Maria Ines Tiraboschi; Carneiro, Newton Portilho; Falcão, Paula R. K.; Grynberg, Priscila; Teixeira, Santuza Maria Ribeiro; Brommonschenkel, Sérgio; Oliveira, Sergio; Meyer, Roberto; Moore, Robert J.; Miyoshi, Anderson; Oliveira, Guilherme Corrêa; Azevedo, Vasco

Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal:	Ruiz, Jerônimo Conceição
Data de Publicação:	2011
Outros Autores:	D'Afonseca, Vívian, Silva, Artur, Ali, Amjad, Pinto, Anne Cybelle, Santos, Anderson Rodrigues dos, Rocha, Aryane Aparecida Magalhães Cassiano, Lopes, Débora de Oliveira, Dorella, Fernanda Alves, Pacheco, Luis Gustavo Carvalho, Costa, Marcilia Pinheiro da, Turk, Meritxell Zurita, Seyffert, Núbia, Moraes, Pablo Matias Ribeiro de Oliveira, Soares, Siomar de Castro, Almeida, Sintia Silva de, Castro, Thiago Luiz de Paula, Abreu, Vinicius Augusto Carvalho de, Trost, Eva, Baumbach, Jan, Tauch, Andreas, Schneider, Maria Paula Cruz, McCulloch, John, Cerdeira, Louise Teixeira, Ramos, Rommel Thiago Juca, Zerlotini, Adhemar, Dominitini, Anderson, Resende, Daniela de Melo, Cóser, Elisangela Monteiro, Oliveira, Luciana Márcia de, Pedrosa, André Luiz, Vieira, Carlos Ueira, Guimarães, Cláudia Teixeira, Bartholomeu, Daniella Castanheira, Oliveira, Diana Magalhães de, Santos, Fabrício Rodrigues dos, Rabelo, Élida Mara, Lobo, Francisco Pereira, Franco, Gloria Regina, Costa, Ana Flávia, Castro, Ieso de Miranda, Dias, Sílvia Regina Costa, Ferro, Jesus Aparecido, Ortega, José Miguel, Paiva, Luciano Vilela, Goulart Filho, Luiz Ricardo, Almeida, Juliana Franco, Ferro, Maria Ines Tiraboschi, Carneiro, Newton Portilho, Falcão, Paula R. K., Grynberg, Priscila, Teixeira, Santuza Maria Ribeiro, Brommonschenkel, Sérgio, Oliveira, Sergio, Meyer, Roberto, Moore, Robert J., Miyoshi, Anderson, Oliveira, Guilherme Corrêa, Azevedo, Vasco
Tipo de documento:	Artigo
Idioma:	eng
Título da fonte:	Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo:	https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9041
Resumo:	Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil

Metadados do item

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Belém, PA, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de São João Del Rei. Centro de Ciências da Saúde. Divinópolis, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil/Universidade Federal de Bahia. Departamento de Biointeração das Ciências. Salvador, BA, BrasilUniversidade Estadual do Ceará. Departamento de Medicina Veterinária. Fortaleza, CE, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversity of Bielefeld. Department of Genetics. CeBiTech. Bielefeld, NWb, GermanyMax-Planck-Institut fur Informatik. Department of Computer Science. Saarbrucken, Saarlan, GermanyUniversity of Bielefeld. Department of Genetics. CeBiTech. Bielefeld, NWb, GermanyUniversidade Federal do Para. Departamento de Genética. Belém, PA, BrasilUniversidade Federal do Para. Departamento de Genética. Belém, PA, BrasilUniversidade Federal do Para. Departamento de Genética. Belém, PA, BrasilUniversidade Federal do Para. Departamento de Genética. Belém, PA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil/Universidade Federal de Ouro Preto. Departamento de Farmácia. Ouro Preto, MG, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Ouro Preto. Departamento de Física. Ouro Preto, MG, BrasilUniversidade Federal de Ouro Preto. Departamento de Farmácia. Ouro Preto, MG, Brasil/ Universidade Federal do Triangulo Mineiro. Instituto de Ciências Biológicas. Uberaba, MG, BrasilUniversidade Federal de Uberlândia. Departamento de Genética e Bioquímica. Uberlândia, MG, BrasilEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Sete Lagoas, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Estadual do Ceará. Departamento de Medicina Veterinária. Fortaleza, CE, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Ouro Preto. Departamento de Farmácia. Ouro Preto, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Estadual de São Paulo. Departamento de Tecnologia. Jaboticabal, SP, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Lavras. Departamento de Química. Lavras, MG, BrasilUniversidade Federal de Uberlândia. Departamento de Genética e Bioquímica. Uberlândia, MG, BrasilUniversidade Federal de Uberlândia. Departamento de Genética e Bioquímica. Uberlândia, MG, BrasilUniversidade Estadual de São Paulo. Departamento de Tecnologia. Jaboticabal, SP, BrasilEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Sete Lagoas, MG, BrasilEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Campinas, SP, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Viçosa. Departamento de Patologia Vegetal. Viçosa, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Bahia. Departamento de Biointeração das Ciências. Salvador, BA, BrasilCSIRO Livestock Industries. AustraliaUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisar René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil/ Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa René Rachou. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia. Centro de Excelência em Bioinformática. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, BrasilBackground: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in genomic architecture, gene content and genetic order. When C. pseudotuberculosis was compared with other Corynebacterium species, it became evident that this pathogenic species has lost numerous genes, resulting in one of the smallest genomes in the genus. Other differences that could be part of the adaptation to pathogenicity include a lower GC content, of about 52%, and a reduced gene repertoire. The C. pseudotuberculosis genome also includes seven putative pathogenicity islands, which contain several classical virulence factors, including genes for fimbrial subunits, adhesion factors, iron uptake and secreted toxins. Additionally, all of the virulence factors in the islands have characteristics that indicate horizontal transfer. Conclusions: These particular genome characteristics of C. pseudotuberculosis, as well as its acquired virulence factors in pathogenicity islands, provide evidence of its lifestyle and of the pathogenicity pathways used by this pathogen in the infection process. All genomes cited in this study are available in the NCBI Genbank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) under accession numbers CP001809 and CP001829.Amino acid/metabolismComparative genomicsCorynebacteriaGenomic databasesMembrane proteinsMetabolic pathwaysinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81914https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9041/1/license.txt7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81fMD51ORIGINALEvidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains.pdfEvidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains.pdfapplication/pdf390519https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9041/2/Evidence%20for%20Reductive%20Genome%20Evolution%20and%20Lateral%20Acquisition%20of%20Virulence%20Functions%20in%20Two%20Corynebacterium%20pseudotuberculosis%20Strains.pdf73ead56e070b2da61d2ff69d45ff55bfMD52TEXTEvidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains.pdf.txtEvidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains.pdf.txtExtracted texttext/plain87955https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9041/3/Evidence%20for%20Reductive%20Genome%20Evolution%20and%20Lateral%20Acquisition%20of%20Virulence%20Functions%20in%20Two%20Corynebacterium%20pseudotuberculosis%20Strains.pdf.txt0bccf97a95d71b8034c229f0db033fcbMD53icict/90412019-06-19 10:14:12.512oai:www.arca.fiocruz.br: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ório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-06-19T13:14:12Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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