Aplicabilidade de uma metodologia in-house de diagnóstico e caracterização molecular em uma população de indivíduos com sorologia positiva para HIV no estado do Amapá

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Lindomar dos Anjos
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40030
Resumo: A epidemia de HIV-1 no Brasil constitui um fenômeno dinâmico e complexo composto por um mosaico de sub-epidemias regionais com um padrão heterogêneo de prevalência de distintas formas genéticas do vírus assim como de mutações de resistência transmitida aos antirretrovirais (TDRM). Há pouca informação disponível sobre o perfil epidemiológico molecular do HIV-1 no Norte do Brasil. Neste trabalho foi analisada a aplicabilidade de uma metodologia “in-house” para diagnóstico e caracterização molecular do DNA do HIV-1 associado à células de sangue periférico. Foram analisados 113 indivíduos virgens de tratamento, e com sorologia positiva para o HIV provenientes de diferentes municípios do Estado do Amapá. Foi possível amplificar e sequenciar os genes que codificam para a protease e para a transcriptase reversa viral em 97 (86%) dos 113 indivíduos analisados. A determinação do subtipo viral revelou que o clado mais prevalente do HIV-1 no Amapá foi o B (74%), seguido pelo subtipo F1 (14%), recombinantes BF1 (8%), subtipo C (1%), CRF31_BC (1%) e CRF02_AG (1 %). Apenas uma TDRM (K103N) foi detectada em um único paciente da nossa população de estudo. Concluiu-se que a metodologia in-house utilizada neste trabalho pode ser aplicada com sucesso na vigilância epidemiológica molecular da epidemia de HIV-1 no estado do Amapá. Este estudo revelou ainda que, a epidemia de HIV-1 no Amapá se caracteriza por um alto nível de diversidade genética, comparável ao observado nas principais cidades brasileiras, e uma baixa prevalência de TDRM (1%). Consequentemente, segundo as diretrizes da ONUSIDA não se faz necessário a implementação do teste de genotipagem de mutações de resistência antes da introdução da terapia antirretroviral na população de indivíduos infectados pelo HIV-1 no Amapá.
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spelling Silva, Lindomar dos AnjosFilippis, Ivano deSantos, Flávia Barreto dosOliveira, Jaqueline Mendes deMascarenhas, Joana D’Arc PereiraBetancor, Gonzalo José BelloFilippis, Ivano deBetancor, Gonzalo José Bello2020-02-18T02:38:15Z2020-02-18T02:38:15Z2015SILVA, L. A. Aplicabilidade de uma metodologia in-house de diagnóstico e caracterização molecular em uma população de indivíduos com sorologia positiva para HIV no estado do Amapá. 2015. 67 f. Dissertação (Mestrado Profissional em Vigilância Sanitária)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Macapá, 2015.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40030A epidemia de HIV-1 no Brasil constitui um fenômeno dinâmico e complexo composto por um mosaico de sub-epidemias regionais com um padrão heterogêneo de prevalência de distintas formas genéticas do vírus assim como de mutações de resistência transmitida aos antirretrovirais (TDRM). Há pouca informação disponível sobre o perfil epidemiológico molecular do HIV-1 no Norte do Brasil. Neste trabalho foi analisada a aplicabilidade de uma metodologia “in-house” para diagnóstico e caracterização molecular do DNA do HIV-1 associado à células de sangue periférico. Foram analisados 113 indivíduos virgens de tratamento, e com sorologia positiva para o HIV provenientes de diferentes municípios do Estado do Amapá. Foi possível amplificar e sequenciar os genes que codificam para a protease e para a transcriptase reversa viral em 97 (86%) dos 113 indivíduos analisados. A determinação do subtipo viral revelou que o clado mais prevalente do HIV-1 no Amapá foi o B (74%), seguido pelo subtipo F1 (14%), recombinantes BF1 (8%), subtipo C (1%), CRF31_BC (1%) e CRF02_AG (1 %). Apenas uma TDRM (K103N) foi detectada em um único paciente da nossa população de estudo. Concluiu-se que a metodologia in-house utilizada neste trabalho pode ser aplicada com sucesso na vigilância epidemiológica molecular da epidemia de HIV-1 no estado do Amapá. Este estudo revelou ainda que, a epidemia de HIV-1 no Amapá se caracteriza por um alto nível de diversidade genética, comparável ao observado nas principais cidades brasileiras, e uma baixa prevalência de TDRM (1%). Consequentemente, segundo as diretrizes da ONUSIDA não se faz necessário a implementação do teste de genotipagem de mutações de resistência antes da introdução da terapia antirretroviral na população de indivíduos infectados pelo HIV-1 no Amapá.The Brazilian HIV-1 epidemic in is a dynamic and complex phenomenon composed of a mosaic of regional sub-epidemics with a heterogeneous pattern of prevalence of distinct genetic forms of the virus as well as of transmitted drug resistance mutations (TDRM) to antiretrovirais. There is little information available on the molecular epidemiology of HIV-1 in northern Brazil. This work examined the applicability of an “in-house” methodology for diagnosis and molecular characterization of HIV-1 DNA associated to peripheral blood cells. We analyzed 113 drug-naïve HIV-1-infected individuals from different municipalities in the state of Amapá. We amplified and determined the sequence of the genes that encode the viral protease and reverse transcriptase in 97 (86%) out of 113 subjects analyzed. The determination of viral subtype revealed that the most prevalent HIV-1 clade in Amapá was B (74%), followed by subtype F1 (14%), recombinant BF1 (8%), subtype C (1%), CRF31_BC (1%) and CRF02_AG (1%). Only one TDRM (K103N) was detected in one patient from our study population. In conclusion, the in-house methodology used in this work could be successfully applied for the molecular epidemiological surveillance of the HIV-1 epidemic in the state of Amapá. This study also revealed that the HIV-1 epidemic in Amapá is characterized by a high level of genetic diversity, comparable to that observed in major Brazilian cities, and a low prevalence of TDRM (1%). Thus, the implementation of resistance genotyping tests before the introduction of antiretroviral therapy is not necessary for the population of HIV-1-infected individuals in Amapá according to the UNAIDS guidelines.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porHIV-1Epidemiologia MolecularResistência aos AntirretroviraisMonitoramento EpidemiológicoHIVMolecular EpidemiologyResistance to Antiretroviral AgentsEpidemiological MonitoringHIV-1Epidemiologia MolecularAntirretroviraisVigilância EpidemiológicaAplicabilidade de uma metodologia in-house de diagnóstico e caracterização molecular em uma população de indivíduos com sorologia positiva para HIV no estado do Amapáinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2015Coordenação de Pós-GraduaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em SaúdeMestrado AcadêmicoMacapá/APPrograma de Pós-Graduação em Vigilância Sanitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40030/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALDissertação_LindomarAS.pdfDissertação_LindomarAS.pdfapplication/pdf4855082https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40030/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o_LindomarAS.pdf5360aba6a3597cf97d822b5d12f58817MD52TEXTDissertação_LindomarAS.pdf.txtDissertação_LindomarAS.pdf.txtExtracted texttext/plain93100https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40030/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_LindomarAS.pdf.txtb6ab88869125bfcc89f5e8c8009747fbMD53icict/400302020-02-18 16:36:45.406oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352020-02-18T19:36:45Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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