Diferenciação de micobactérias por PCR multiplex
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Data de Publicação: | 2009 |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/26308 |
Resumo: | O trabalho visou à otimização de um método baseado na reação em cadeia da polimerase multiplex - para diferenciação de micobactérias de interesse para a saúde pública. A PCR Multiplex baseou-se na amplificação simultânea do genehsp65, presente em todo gênero Mycobacterium, do gene dnaJ, presente apenas em Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium avium e da sequência de inserção IS6110 presente no complexo Mycobacterium tuberculosis, gerando amplicons de 165pb, 365pb e 541pb, respectivamente. O limite de detecção foi de 1fg para o alvo hsp65, 100pg para o dnaJ e 0,1fg para o IS6110. A PCR multiplex detectou até 100pg de DNA de Mycobacterium tuberculosis. O sistema demonstrou ser específico e sensível na detecção de Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, Mycobacterium avium e Mycobacterium smegmatis. Os resultados obtidos utilizando cepas de referência demonstraram que a PCR multiplex pode ser uma ferramenta rápida, sensível e específica na diferenciação de micobactérias. |
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Poroca, Diogo da RochaLima, Andrea SantosLima, Juliana Falcão de AraújoCruz, Heidi Lacerda Alves daMontenegro, Rosana de AlbuquerqueMelo, Fábio Lopes deSchindler, Haiana CharifkerMontenegro, Lílian Maria Lapa2018-05-07T13:40:04Z2018-05-07T13:40:04Z2009POROCA, D. DA R. et al. Diferenciação de micobactérias por PCR multiplex. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, v. 42, n. 6, p. 716–722, dez. 2009.1678-9849https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/2630810.1590/S0037-86822009000600020O trabalho visou à otimização de um método baseado na reação em cadeia da polimerase multiplex - para diferenciação de micobactérias de interesse para a saúde pública. A PCR Multiplex baseou-se na amplificação simultânea do genehsp65, presente em todo gênero Mycobacterium, do gene dnaJ, presente apenas em Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium avium e da sequência de inserção IS6110 presente no complexo Mycobacterium tuberculosis, gerando amplicons de 165pb, 365pb e 541pb, respectivamente. O limite de detecção foi de 1fg para o alvo hsp65, 100pg para o dnaJ e 0,1fg para o IS6110. A PCR multiplex detectou até 100pg de DNA de Mycobacterium tuberculosis. O sistema demonstrou ser específico e sensível na detecção de Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, Mycobacterium avium e Mycobacterium smegmatis. Os resultados obtidos utilizando cepas de referência demonstraram que a PCR multiplex pode ser uma ferramenta rápida, sensível e específica na diferenciação de micobactérias.This study aimed to optimize a method based on the polymerase chain reaction - multiplex PCR - for differentiation of mycobacteria species of interest for public health. The multiplex PCR was based on simultaneous amplification of the hsp65 gene, which is present in all species of the Mycobacterium genus, the dnaJ gene, which is present only in Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium avium and the IS6110 insertion sequence, which is present in the Mycobacterium tuberculosis complex, generating amplicons of 165 bp, 365 bp and 541 bp, respectively. The detection limit was 1 fg for the hsp65 target, 100 pg for dnaJ and 0.1 fg for IS6110. The multiplex PCR detected down to 100 pg of DNA of Mycobacterium tuberculosis. The system was shown to be specific and sensitive for detection of Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, Mycobacterium avium and Mycobacterium smegmatis. The results obtained using reference strains of mycobacteria showed that multiplex PCR may be a fast, sensitive and specific tool for differentiation of mycobacteria.CPqAM/FIOCRUZ e FACEPEFundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Parasitologia. Laboratório de Doenças Transmissíveis. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Imunologia. Laboratório de Imunoepidemiologia. Recife, PE, Brasil.porMicobactériasPCR multiplexIS6110dnaJhsp65MycobacteriaMultiplex PCRIS6110dnaJhsp65Proteínas Bacterianas / análiseProteínas Bacterianas / genéticaTécnicas de Tipagem BacterianaChaperonina 60 / análiseChaperonina 60 / genéticaDNA bacteriano / análiseMycobacterium / classificaçãoMycobacterium / genéticaReação em Cadeia da Polimerase / métodosDiferenciação de micobactérias por PCR multiplexDifferentiation of micobacteria by multiplex PCRinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83092https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/26308/1/license.txt447f2497af1ef5cf99b5c07f6fa18dceMD51ORIGINALDiferenciação de micobactérias por PCR multiplex.pdfDiferenciação de micobactérias por PCR 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