Desenvolvimento e avaliação de métodos baseados em PCR para diagnóstico e tipagem molecular de cepas isoladas em epidemias urbanas de leptospirose em Salvador - Bahia
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Data de Publicação: | 2000 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34018 |
Resumo: | A leptospirose, uma zoonose causada por uma espiroqueta do gênero Leptospira, é uma doença presente na maioria dos países do mundo sendo um problema de grande impacto social no Brasil. Os objetivos deste estudo foram de confin Ilar o diagnóstico dos casos com suspeita clínica de leptospirose pela microaglutinação e cultura, desenvolver o ensaio da polimerase em cadeia (PCR) para o diagnóstico da leptospirose, determinando a sensibilidade e especificidade desse teste e desenvolver e aplicar métodos baseados em reação da polimerase em cadeia para amplificação de regiões intergênicas entre elementos repetitivos de leptospiras para tipagem molecular de cepas isoladas em estudos epidemiológicos. A população do estudo foi composta por pacientes admitidos no Hospital Couto Maia com diagnóstico clínico de leptospirose na admissão, durante o período de 05/05/97 a 28/11/97. A confirmação diagnóstica foi realizada através da microaglutinação em 51,3% (83/162)dos casos identificados. 36,4% (59/162) dos pacientes não foram confirmados por este teste. O isolamento de leptospiras foi realizado em 45,5% (30/66) dos pacientes testados. Foram identificados através da hemocultura 56,7% (17/35) dos casos confirmados pela MAT. Para a realização do PCR para diagnóstico foram obtidas amostras de plasma e/ou urina de 129 pacientes. O PCR apresentou uma sensibilidade de 44% (36/83) em amostras de urina, 21% (16/78) em plasma e de 57% (37/65)quando foram testadas amostras pareadas de plasma e urina. No grupo de controles negativo não houve reação positiva pelo PCR, representando uma especificidade de 100%. Nos pacientes nos quais foram colhidas amostras com menos de sete dias de sintoma, a positividade do PCR foi de 42% (13/31) para amostras de urina e 30% (6/23)para amostras de plasma. O PCR de leptospirose mostrou não possuir as condições requeridas para sua implantação a nível ambulatorial, fazendo-se necessário o desenvolvimento de novos testes diagnósticos. Foram tipadas pelo método de PCR 63 (71%) dos isolados de casos humanos e 35 (35%) de ratos em Salvador-Ba e os padrões obtidos foram comparadas com os de cepas de referência. As amostras pertencentes ao sorogrupo Icterohaemorrhagiae possuíram padrão semelhante entre si. O método de tipagem molecular pelo PCR demonstrou ser uma técnica reprodutível e fácil de ser realizada, funcionando como uma metodologia alternativa para tipagem de cepas de leptospiras. |
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Ferrer, Suzana RamosPereira, Martha MariaTavares-Neto, JoséReis, Mitermayer Galvão dosReis, Mitermayer Galvão dos2019-07-12T12:48:55Z2019-07-12T12:48:55Z2000FERRER, Suzana Ramos. Desenvolvimento e avaliação de métodos baseados em PCR para diagnóstico e tipagem molecular de cepas isoladas em epidemias urbanas de leptospirose em Salvador - Bahia. 2000. 70 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldoa Cruz, Salvador, 2000.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34018A leptospirose, uma zoonose causada por uma espiroqueta do gênero Leptospira, é uma doença presente na maioria dos países do mundo sendo um problema de grande impacto social no Brasil. Os objetivos deste estudo foram de confin Ilar o diagnóstico dos casos com suspeita clínica de leptospirose pela microaglutinação e cultura, desenvolver o ensaio da polimerase em cadeia (PCR) para o diagnóstico da leptospirose, determinando a sensibilidade e especificidade desse teste e desenvolver e aplicar métodos baseados em reação da polimerase em cadeia para amplificação de regiões intergênicas entre elementos repetitivos de leptospiras para tipagem molecular de cepas isoladas em estudos epidemiológicos. A população do estudo foi composta por pacientes admitidos no Hospital Couto Maia com diagnóstico clínico de leptospirose na admissão, durante o período de 05/05/97 a 28/11/97. A confirmação diagnóstica foi realizada através da microaglutinação em 51,3% (83/162)dos casos identificados. 36,4% (59/162) dos pacientes não foram confirmados por este teste. O isolamento de leptospiras foi realizado em 45,5% (30/66) dos pacientes testados. 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Foram tipadas pelo método de PCR 63 (71%) dos isolados de casos humanos e 35 (35%) de ratos em Salvador-Ba e os padrões obtidos foram comparadas com os de cepas de referência. As amostras pertencentes ao sorogrupo Icterohaemorrhagiae possuíram padrão semelhante entre si. O método de tipagem molecular pelo PCR demonstrou ser uma técnica reprodutível e fácil de ser realizada, funcionando como uma metodologia alternativa para tipagem de cepas de leptospiras.Development and evaluation of the PCR method for the diagnosis and molecular typing of urban epidemic leptospirosis in Salvador-BA. Leptospirosis, a zoonose caused by the spiroquete Leptospira, is an illness present in many countries around the world. It’s considered a problem of great social impact in Brazil. The objectives of this study were: (1) to confirm the diagnosis of cases with clinical suspicion of leptospirosis by the microagglutination test and culture, (2) to develop the polimerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of leptospirosis, including determination of the sensitivity and specificity of this test , (3) to develop and apply these methods based on the amplification of Intervening regions between repetitive elements of leptospira’s genome for the molecular typing of strains in Salvador-Ba. The population selected for the study were patients who were to admitted to Couto Maia Hospital, clinically suspected of having leptospirosis in the period between 05/05/97 to 11/28/97. Diagnostic confirmation was done by microagglutination test from 51,3%(83/162) of identified cases. 36,4% (59/162 ) of the patients were not confirmed by this test. From 45,5%(30/66) of the patients tested, 56,7% had a positive blood culture for Leptospira. Polimerase chain reaction was carried out for 129 patients either from plasma or urine samples by using previous described methodology of centrifugation and boiling for extraction of DNA. The PCR resulted in a 44%(36/83) sensitivity when urine samples were tested, 21% (16/78) from plasma samples and 57% (37/95) when both plasma and urine were used. In the negative control group there were no positives PCR reaction, showing thus a 100% sensitivity. From patients whose samples were taken before the seventh day of symptoms, there was a positive reaction from 42% (13/31) of urine samples and 30%(6/23) of plasma samples. The PCR method for leptospira used in this study did not yield the necessary results to be used in out-patient clinics, showing a need for the development of new diagnostic tests. Molecular typing of isolates were also done by PCR methodology. Sixty-three human isolates and 35 rat isolates studied from Salvador Ba were also processed comparing the isolates to reference isolates using the PCR method described above. All the samples typed as Icterohaemorrhagiae seragroup had a similar band pattern. The PCR molecular typing method used Is a reptoductible and easy to use technic, and can be used as an alternative methodology for the typing of leptopira strains.CNPq, processo número 521229/98-7.Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porCentro de Pesquisas Gonçalo MonizLeptospiroseLeptospiraTécnica de Tipagem BacterianaReação em Cadeia da PolimeraseDiagnósticoLeptospirosis-LeptospiraBacterial Typing TechniquePolymerase Chain ReactionDiagnosticDesenvolvimento e avaliação de métodos baseados em PCR para diagnóstico e tipagem molecular de cepas isoladas em epidemias urbanas de leptospirose em Salvador - Bahiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2000Coordenação de EnsinoUniversidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo MonizMestrado AcadêmicoSalvador/BAPós-Graduação em Patologiainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34018/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALSuzana Ramos Ferrer Desenvolvimento...2000.pdfSuzana Ramos Ferrer Desenvolvimento...2000.pdfapplication/pdf4018825https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34018/2/Suzana%20Ramos%20Ferrer%20Desenvolvimento...2000.pdf58580669cbb2172a9303f87515a3c7c7MD52TEXTSuzana Ramos Ferrer Desenvolvimento...2000.pdf.txtSuzana Ramos Ferrer Desenvolvimento...2000.pdf.txtExtracted texttext/plain118709https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34018/3/Suzana%20Ramos%20Ferrer%20Desenvolvimento...2000.pdf.txt2c5eab8a7fdb375d82db0fae9b70f4d8MD53icict/340182021-07-08 14:59:43.455oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352021-07-08T17:59:43Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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