Avaliação da diversidade bacteriana e do resistoma microbiano em efluentes de sistemas de tratamento alternativo e convencional

• Autor(a) principal: Moreira, Thaís Costa
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
• Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60074
• topic: Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias; Monitoramento Biológico; Saneamento; Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias; Monitoramento Biológico; Saneamento

O saneamento é fundamental para uma vida saudável e produtiva, e a prestação deste serviço para populações urbanas e rurais é um desafio permeado por dificuldades políticas de gestão e interesses. O objetivo desse estudo foi avaliar a diversidade bacteriana e o resistoma microbiano em efluentes de sistemas alternativo e convencional de tratamento por meio de abordagem microbiológica e genômica. Para isso, foram realizadas 2 coletas dos pontos de entrada e saída de estação convencional de tratamento de esgoto (ECE) e alternativa (ESA). Foram obtidas 147 linhagens a partir de meios de cultivo contendo antimicrobianos. Em seguida, foram identificadas pelos sistemas Vitek II e Maldi-TOF. Na coleta 1 foram identificados 62 isolados (15 ECE e 47 ESA), 43,5% (27/62) da ordem Enterobacteriales (16% de Enterobacter cloacae) e 56% (35/62) de diferentes espécies, incluindo um isolado de Elizabethkingia anophelis (ESA/entrada). Na coleta 2 foram identificados 28 isolados (9 ECE e 19 ESA), 35% (10/28) de Pseudomonas spp. sendo 32% P. aeruginosa. Dos 27 isolados de Enterobacteriales, 15 (55%) apresentaram resistência aos antibióticos, 64,2 % perfil de resistência não-MDR, 21,4% MDR e 14,35% XDR. Elizabethkingia anophelis apresentou perfil de resistência PDR (resistência a 14 antimicrobianos). Os isolados de Pseudomonas spp. apresentaram perfis de resistência Sensível e MDR (P. putida (ESA/saída)). Os 2 isolados selecionados para o sequenciamento genômico, E. anophelis (entrada da ESA) e P. putida (saída da ESA) apresentaram conteúdo GC entre 35,5-62% e tamanho médio de 4,2-5,8 MB, respectivamente. O genoma de E. anophelis apresentou 256 subsistemas. Foram revelados genes de resistência antimicrobiana consistentes com seus fenótipos de resistência, incluindo fluoroquinolonas (gene adeF), metalo-β-lactamase (blaGOB-1 e blaB-1) e desinfetantes (qacG). De acordo com o perfil do cgMLST gerado pelo software GrapeTree, este isolado derivou diretamente da sublinhagem 15 associada a um surto em Wisconsin, EUA (2016). O genoma de P. putida resultou em 81 contigs e 5375 sequências codificadoras, incluindo 71 RNAs. Apresentou 369 subsistemas, incluindo resistência a antibióticos e compostos tóxicos, como genes cutE e corC (homeostase do cobre) operon czc (resistência ao cobalto, zinco e cádmio), gyrA e gyrB (fluoroquinolonas), blaBLI (Beta-lactamase) e creA e creD (colicina e outros antibióticos). De acordo com o agrupamento MLST pertence ao ST154, derivado diretamente do ST192 (EUA) e, assim como os STs 78, 216 e 150, é originário do ST central 69 (origem clínica e ambiental). Os resultados obtidos no presente estudo sinalizam a importância de investigações do microbioma e do conjunto de genes de resistência em efluentes de estações de tratamento de esgoto. Além disso, reafirmam a necessidade de maior cobertura na captação e tratamento de esgotos que serão descartados em corpos hídricos receptores e poderão promover a disseminação de contaminantes emergentes, danos ao meio ambiente e à saúde humana.