Exploration of Plasmodium vivax merozoite surface proteins 1 and 7 genetic diversity in Brazilian Amazon and Rio de Janeiro Atlantic Forest

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida-de-Oliveira, Natália Ketrin
Data de Publicação: 2020
Outros Autores: Abreu-Fernandes, Rebecca, Lavigne, Aline Rosa, Pina-Costa, Anielle, Perce-da-Silva, Daiana de Souza, Catanho, Marcos, Rossi, Átila Duque, Brasil, Patrícia, Daniel-Ribeiro, Cláudio Tadeu, Ferreira-da-Cruz, Maria de Fátima
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/59910
Resumo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES; https://www.capes.gov.br/) by Doctoral Fellowship that NKAO is recipient; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq; http://www.cnpq.br/) by Research Productivity Fellowships whom CTDR (310445/2017-5) and MFFC (306025/2018-3) are recipients; “Cientistas do Nosso Estado” from the Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado de Rio de Janeiro (FAPERJ; http://www.faperj.br/), number grant CTDR (E-26/202.921/2018) and MFFC (E-26/203.295/2015) are. This work was also supported by the IOC/FIOCRUZ of Health ministry of Brazil, CPD-MalCenter of reference malaria diagnoses at Oswaldo Cruz Foundation.
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The pvmsp-7F has only two SNPs - A610G and A1054T –, with nucleotide diversity of π = 0.0004 in AF, and π = 0.0007 in BA. The haplotype diversity of pvmsp-1₄₂, pvmsp-7E, and pvmsp-7F genes is 0.997, 1.00, and 0.649, respectively. None of the pvmsp-1₄₂ or pvmsp-7E sequences are identical to the Salvador 1 strain's sequence. Conversely, most of pvmsp-7F sequences (94/48%) are identical to Sal-1. We evaluated eight Bcell epitopes in pvmsp-7E, four of them showed higher nucleotide diversity compared to pvmsp-7E's epitopes. Positive selection was detected in pvmsp-1₄₂ pvmsp-7E central region, and pvmsp-7F with Tajima's D. In pvmsp-7E, the significant nucleotide and haplotype diversities with low genetic differentiation, could be indicative of balancing selection. The genetic differentiation of pvmsp-1₄₂ (0.315) and pvmsp-7F (0.354) genes between AF and BA regions is significant, which is not the case for pvmsp-7E (0.193). We conclude that pvmsp-1₄₂ and pvmsp-7E have great genetic diversity even in AF region, an enclosure area with deficient transmission levels of P. vivax zoonotic malaria. In both Brazilian regions, pvmsp-1₁₉, pvmsp-7E, and pvmsp-7F are conserved, most likely due to their roles in parasite survival, and could be considered potential targets for a “blood-stage vaccine”.engElsevierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/44911Exploration of Plasmodium vivax merozoite surface proteins 1 and 7 genetic diversity in Brazilian Amazon and Rio de Janeiro Atlantic Forestinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleP. vivaxPvmsp-1Pvmsp-7EPvmsp-7FGenetic diversityinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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