Análise de sequenciamento revela que pimentão é um novo hospedeiro potencial de potato leafroll virus.
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Data de Publicação: | 2023 |
Outros Autores: | , , , , , , |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1163596 |
Resumo: | Sequencing analysis reveals that peppers is a potencial new host for potato leafroll virus. Tomato (Solanum lycopersicum) and pepper (Capsicum annuum) are among the most important vegetable crops worldwide. However, these crops are severely affected by multiple viral diseases. To survey the diversity of viral species infecting tomato and pepper plants in different regions of Brazil, symptomatic plants were sampled from the Federal District, Mato Grosso, Pernambuco, Goiás and São Paulo states. Pools of leaves were used for semi-purification of virus particles through a method of differential centrifugation. The pellets were resuspended and used for total RNA extraction, followed by standard Illumina library preparation with ribosomal RNA deletion, and sequencing. |
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Análise de sequenciamento revela que pimentão é um novo hospedeiro potencial de potato leafroll virus.Extração de RNA totalTomatePimentãoVírusSolanum lycopersicumCapsicum annuum var. annuumPolerovirusSolanum tuberosum subsp. tuberosumPotatoesTomatoesSequencing analysis reveals that peppers is a potencial new host for potato leafroll virus. Tomato (Solanum lycopersicum) and pepper (Capsicum annuum) are among the most important vegetable crops worldwide. However, these crops are severely affected by multiple viral diseases. To survey the diversity of viral species infecting tomato and pepper plants in different regions of Brazil, symptomatic plants were sampled from the Federal District, Mato Grosso, Pernambuco, Goiás and São Paulo states. Pools of leaves were used for semi-purification of virus particles through a method of differential centrifugation. The pellets were resuspended and used for total RNA extraction, followed by standard Illumina library preparation with ribosomal RNA deletion, and sequencing.ROBERTA RÚBIA PINTO NOGUEIRA LIMA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ERICH YUKIO TEMPEL NAKASU, CNPH; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; ONAS RAFAEL VARGAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; BÁRBARA MAVIE CAMARGO DE SOUSA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; WANDRESSA DE SOUZA PEREIRA, CENTRO UNIVERSITÁRIO ICESP; YANCA FRANCINE MARTINS FERREIRA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH.LIMA, R. R. P. N.NAKASU, E. Y. T.BLAWID, R.VARGAS, O. R.SOUSA, B. M. C. dePEREIRA, W. de S.FERREIRA, Y. F. M.INOUE-NAGATA, A. K.2024-04-15T13:03:17Z2024-04-15T13:03:17Z2024-04-152023Resumo em anais e proceedingsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 53., Brasília, DF, 2023. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2023. p. 699.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1163596enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2024-04-15T13:03:17Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1163596Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542024-04-15T13:03:17Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
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