Citrus exocortis viroid and Hop stunt viroid doubly infecting grapevines in Brazil.

• Autor(a) principal: EIRAS, M.
• Data de Publicação: 2006
• Outros Autores: TARGON, M. L. P. N., FAJARDO, T. V. M., FLORES, R., KITAJIMA, E. W.
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
• Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541733
• topic: CEVd; HSVd; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura; Hostuviroid; Pospiviroid; Pospiviroidae

Viroids, non-protein-coding small (246-40 I nt) eircular single-stranded RNAs with autonornous replication, are currently classified into two farnilics. Within the farnily Pospiviroidae, Citrus exocortis viroid (CEVd) belongs to lhe genus Pospiviroid while Hop stunt viroid (HSVd) is the single rnembcr of the genus Hostuviroid. These pathogens are distributcd worldwide and infect a large nurnbcr of hosts. In Brazil, isolates of CEVd and HSVd have been detected in both citrus and grapevine. To characterize and study the genetic variability of thcse viroids, total RNA frorn leaves of grapevine Vitis vinifera 'Cabemet Sauvignon' and V Iabrusca 'Niagara Rosada' frorn Bento Gonçalves, RS, was used as a tcmplate for RTPCR amplification with specific primers for lhe five viroids described infccting grapevines [HSVd, CEVd, Grapevine yellow peckle viroid I (GYSVd-I), Grapevine yellow speckle viroid 2 (GYSVd-2) and Australian grapevine viroid (AGVd)]. Leaf sarnples of Citrus medica infected with CEVd frorn São Paulo were also analyzed. The resulting products wcre separated by agarose gel electrophoresis and DNA fragrncnts of lhe expected sizc were eluted, cloned and sequeneed. The grapevine samples analyzed wcre doubly infcctcd by CEVd and HSVd. A phylogcnctic analysis showed that the Brazilian grapevine HSVd variants clustercd with other grapevine HSVd variants, forming a specific group separated from citrus variants, whereas the Brazilian CEVd variants clustered with other citrus and grapevine variants. Additional keywords: CEVd, HSVd, Pospiviroid, Hostuviroid, Pospiviroidae. RESUMO Videiras duplamente infectadas pelo Citrus exocortis viroid e Hop stunt viroid no Brasil Os viróides são os menores fitopatógenos conhecidos, sendo constituídos de uma molécula de RNA fita simples, circular, com forte estrutura secundária. Possuem genomas que variam entre 246 e 40 I nucleotideos e, por não traduzirem proteínas próprias, são totalmente dependentes da célula hospedeira para sua replicação. São classificados em duas famílias e sete gêneros. O Citrus exoconis viroid (CEVd) pertence ao gênero Pospiviroid, enquanto o Hop stunt viroid (HSVd) é o único membro do gênero Hostuviroid, ambos pertencentes à família Pospiviroidae. Estes patógenos apresentam ampla distribuição mundial e infcctam um grande número de hospedeiras. No Brasil, isolados do CEVd e do HSVd foram detectados em citros e videiras. Com o objetivo de caracterizar e estudar a variabilidade genética destes viróides, promoveu-se extração de RNA total de folhas de videira Vitis vinifera 'Cabernet Sauvignon' e V Iabrusca 'Niagara Rosada' provenientes de Bento Gonçalves, RS, e RT-PCR com oligonucleotídeos específicos para os cinco viróides já descritos em videira [HSVd, CEVd, Grapevine yellow speckle viroid I (GYS Vd-I), Crape vine yellow speckle viroid 2 (GYSV d-2) e Australian grapevine viroid (AGVd)). Amostras de folhas de Citrus medica infectadas pelo CEVd provenientes de São Paulo também foram analisadas. Os fragmentos de DNA amplificados foram eluídos, clonados e seqüenciados. As análises das seqüências revelaram que as amostras de videira estavam duplamente infectadas com o CEVd e HSVd. As análises filogenéticas mostraram que os clones de HSVd de videira aqui caracterizados agruparam-se com outros variantes de videira, formando um grupo separado de um segundo formado por variantes de eitros. Já os clones de CEVd de videira agruparam-se com isolados de citros e videira. Palavras-chave adicionais: CEVd, HSVd, Pospiviroid, Hostuviroid, Pospi