Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Furlani, Natália Guelfi
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP
Texto Completo: http://bdtd.famerp.br/handle/tede/105
Resumo: The Brazilian population is mainly composed of three parental populations: Native Americans, Europeans and Africans. Significant levels of tri-hybrid admixture have been detected in all regions and socioeconomic levels within the country. Recent statistical methods allied to the ability to genotype a large number of markers permit the estimate of the admixture at the individual level. In epidemiological studies with case-control design, ethnic heterogeneity between subgroups can produce false positive results. Therefore, for this type of study, it is important to evaluate individual admixture, as well as to measureits influence on the genetic structure of diverse subgroups within the Brazilian populations. Ancestry Informative Markers (AIMs), which frequencies show large differences between parental populations are suitable for tracking the effect of mixing, in order to avoid spurious associations in case control studies. This knowledge could help to further define the levels of population structure in groups and subgroups that constitute the subject of epidemiological studies, optimizing their designto avoid false positive results. Among these groups are particularly relevant studies addressing genetic factors that modulate susceptibility to malaria in regions where the population is exposed to endemic levels, for example, those residing in the municipality of Porto Velho (RO), Brazilian amazon region and surroundings. Objectives: a) to describe the Amerindian, European and African individual genomic ancestry in healthy individuals and patients with falciparum malaria in Porto Velho, RO (Western Amazonia) and assess its impact on the design of epidemiological studies and b) to determine, from the genotyped markers, the genetic structure of populations of falciparum malaria patients and healthy individuals from the same region, depending on the admixture levels .
id FMRP_f02f49aef69524559c32debbe6cfd4df
oai_identifier_str oai:localhost:tede/105
network_acronym_str FMRP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP
repository_id_str 4711
spelling Rossit, Andrea Regina BaptistaCPF:00000000083http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4791389Z0Lisoni, Flávia Cristina RodriguesCPF:00000000345http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4708029P6Pavarino-bertelli, érika CristinaCPF:00000000125http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4701298T3Ravazzi, Lilian MadiCPF:00000000474http://lattes.cnpq.br/2751372536922325CPF:35095692880http://lattes.cnpq.br/6103480397920989Furlani, Natália Guelfi2016-01-26T12:51:30Z2012-02-162011-07-27FURLANI, Natália Guelfi. Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira. 2011. 53 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas) - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, 2011.http://bdtd.famerp.br/handle/tede/105The Brazilian population is mainly composed of three parental populations: Native Americans, Europeans and Africans. Significant levels of tri-hybrid admixture have been detected in all regions and socioeconomic levels within the country. Recent statistical methods allied to the ability to genotype a large number of markers permit the estimate of the admixture at the individual level. In epidemiological studies with case-control design, ethnic heterogeneity between subgroups can produce false positive results. Therefore, for this type of study, it is important to evaluate individual admixture, as well as to measureits influence on the genetic structure of diverse subgroups within the Brazilian populations. Ancestry Informative Markers (AIMs), which frequencies show large differences between parental populations are suitable for tracking the effect of mixing, in order to avoid spurious associations in case control studies. This knowledge could help to further define the levels of population structure in groups and subgroups that constitute the subject of epidemiological studies, optimizing their designto avoid false positive results. Among these groups are particularly relevant studies addressing genetic factors that modulate susceptibility to malaria in regions where the population is exposed to endemic levels, for example, those residing in the municipality of Porto Velho (RO), Brazilian amazon region and surroundings. Objectives: a) to describe the Amerindian, European and African individual genomic ancestry in healthy individuals and patients with falciparum malaria in Porto Velho, RO (Western Amazonia) and assess its impact on the design of epidemiological studies and b) to determine, from the genotyped markers, the genetic structure of populations of falciparum malaria patients and healthy individuals from the same region, depending on the admixture levels .A população brasileira é formada majoritariamente por três populações parentais: Nativos Americanos, Europeus e Africanos. Níveis significativos de miscigenação tri-híbrida já foram detectados em todas as regiões e níveis sócio-econômicos do País. Métodos estatísticos recentes aliados à possibilidade de genotipagem de um grande número de marcadores permitem estimar a miscigenação em nível individual. Em estudos epidemiológicos com desenho de caso-controle, a heterogeneidade étnica entre estas categorias pode produzir resultados falso-positivos. Por este motivo, para este tipo de estudo, é importante estudar a miscigenação individual, assim como avaliar como a miscigenação neste nível influencia a estrutura genética dos diferentes subgrupos das populações brasileiras. O controle do efeito da miscigenação, para evitar as associações espúrias em estudos do tipo caso-controle pode ser feito estudando Marcadores Informativos de Ancestralidade (MIAs), os quais apresentam grandes diferenças de freqüência entre as populações parentais. Este conhecimento poderá contribuir para a futura definição dos níveis de estruturação populacional em grupos e subgrupos que constituirão alvo de estudos epidemiológicos, permitindo a otimização dos mesmos, a fim de evitar resultados falso-positivos. Dentre estes grupos, são de particular relevância estudos que abordem os fatores genéticos que modulam a suscetibilidade à malária em regiões onde a população se encontra exposta em nível endêmico como, por exemplo, a que reside no município de Porto Velho (RO) e região. Objetivos: a) descrever a ancestralidade genômica individual Ameríndia, Européia e Africana em indivíduos sadios e portadores de malária por Plasmodium falciparum da cidade de Porto Velho, RO (Amazônia Ocidental), Brasil, e avaliar seu impacto no desenho de estudos epidemiológicos e b) determinar, a partir dos marcadores genotipados, a estrutura genética das populações de portadores de malária falciparum e indivíduos sadios da mesma região, em função dos níveis de miscigenação.Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 nataliaguelfifurlani_dissert.pdf: 2586696 bytes, checksum: c66f56a5e70e155d3ec22d8e0643f53a (MD5) Previous issue date: 2011-07-27application/pdfporFaculdade de Medicina de São José do Rio PretoPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúde::123123123123::600FAMERPBRMedicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas::123123123123::600Molecular MarkersAncestryGenetic SusceptibilityMalariaBrazilian PopulationAmazonMarcadores molecularesAncestralidadeSusceptibilidade GenéticaMaláriaPopulação BrasileiraAmazôniaCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA::SAUDE PUBLICA::123123123123::600Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileirainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERPinstname:Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)instacron:FAMERPORIGINALnataliaguelfifurlani_dissert.pdfapplication/pdf2586696c66f56a5e70e155d3ec22d8e0643f53aMD51http://bdtd.famerp.br/bitstream/tede/105/1/nataliaguelfifurlani_dissert.pdftede/1052019-02-04 11:06:03.987oai:localhost:tede/105Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.famerp.br/PUBhttps://bdtd.famerp.br/oai/requestsbdc@famerp.br||joao.junior@famerp.bropendoar:47112019-02-04T13:06:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)false
dc.title.por.fl_str_mv Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
title Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
spellingShingle Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
Furlani, Natália Guelfi
Molecular Markers
Ancestry
Genetic Susceptibility
Malaria
Brazilian Population
Amazon
Marcadores moleculares
Ancestralidade
Susceptibilidade Genética
Malária
População Brasileira
Amazônia
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA::SAUDE PUBLICA::123123123123::600
title_short Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
title_full Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
title_fullStr Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
title_full_unstemmed Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
title_sort Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira
author Furlani, Natália Guelfi
author_facet Furlani, Natália Guelfi
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Rossit, Andrea Regina Baptista
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv CPF:00000000083
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4791389Z0
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Lisoni, Flávia Cristina Rodrigues
dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv CPF:00000000345
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4708029P6
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Pavarino-bertelli, érika Cristina
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv CPF:00000000125
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4701298T3
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Ravazzi, Lilian Madi
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv CPF:00000000474
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2751372536922325
dc.contributor.authorID.fl_str_mv CPF:35095692880
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6103480397920989
dc.contributor.author.fl_str_mv Furlani, Natália Guelfi
contributor_str_mv Rossit, Andrea Regina Baptista
Lisoni, Flávia Cristina Rodrigues
Pavarino-bertelli, érika Cristina
Ravazzi, Lilian Madi
dc.subject.eng.fl_str_mv Molecular Markers
Ancestry
Genetic Susceptibility
Malaria
Brazilian Population
Amazon
topic Molecular Markers
Ancestry
Genetic Susceptibility
Malaria
Brazilian Population
Amazon
Marcadores moleculares
Ancestralidade
Susceptibilidade Genética
Malária
População Brasileira
Amazônia
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA::SAUDE PUBLICA::123123123123::600
dc.subject.por.fl_str_mv Marcadores moleculares
Ancestralidade
Susceptibilidade Genética
Malária
População Brasileira
Amazônia
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA::SAUDE PUBLICA::123123123123::600
description The Brazilian population is mainly composed of three parental populations: Native Americans, Europeans and Africans. Significant levels of tri-hybrid admixture have been detected in all regions and socioeconomic levels within the country. Recent statistical methods allied to the ability to genotype a large number of markers permit the estimate of the admixture at the individual level. In epidemiological studies with case-control design, ethnic heterogeneity between subgroups can produce false positive results. Therefore, for this type of study, it is important to evaluate individual admixture, as well as to measureits influence on the genetic structure of diverse subgroups within the Brazilian populations. Ancestry Informative Markers (AIMs), which frequencies show large differences between parental populations are suitable for tracking the effect of mixing, in order to avoid spurious associations in case control studies. This knowledge could help to further define the levels of population structure in groups and subgroups that constitute the subject of epidemiological studies, optimizing their designto avoid false positive results. Among these groups are particularly relevant studies addressing genetic factors that modulate susceptibility to malaria in regions where the population is exposed to endemic levels, for example, those residing in the municipality of Porto Velho (RO), Brazilian amazon region and surroundings. Objectives: a) to describe the Amerindian, European and African individual genomic ancestry in healthy individuals and patients with falciparum malaria in Porto Velho, RO (Western Amazonia) and assess its impact on the design of epidemiological studies and b) to determine, from the genotyped markers, the genetic structure of populations of falciparum malaria patients and healthy individuals from the same region, depending on the admixture levels .
publishDate 2011
dc.date.issued.fl_str_mv 2011-07-27
dc.date.available.fl_str_mv 2012-02-16
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-01-26T12:51:30Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv FURLANI, Natália Guelfi. Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira. 2011. 53 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas) - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, 2011.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://bdtd.famerp.br/handle/tede/105
identifier_str_mv FURLANI, Natália Guelfi. Pesquisa da ancestralidade genômica em população da amazônia ocidental brasileira. 2011. 53 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas) - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, 2011.
url http://bdtd.famerp.br/handle/tede/105
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde::123123123123::600
dc.publisher.initials.fl_str_mv FAMERP
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Medicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas::123123123123::600
publisher.none.fl_str_mv Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP
instname:Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)
instacron:FAMERP
instname_str Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)
instacron_str FAMERP
institution FAMERP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP
bitstream.url.fl_str_mv http://bdtd.famerp.br/bitstream/tede/105/1/nataliaguelfifurlani_dissert.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv c66f56a5e70e155d3ec22d8e0643f53a
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)
repository.mail.fl_str_mv sbdc@famerp.br||joao.junior@famerp.br
_version_ 1809113649862672384