Primeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nobre, Akim Felipe Santos
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Sousa, Rita Catarina Medeiros, Santos, Mirleide Cordeiro dos, Barbagelata, Luana Soares, Costa Júnior, Edivaldo, Lima, Deimy Ferreira, Souza, Edna Maria Acunã de, Mello, Wyller Alencar de
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
Texto Completo: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/2984
Resumo: Os coronavírus humanos (CoVh) são responsáveis por ocasionar doenças respiratórias e entéricas, sendo associados às infecções agudas e graves do trato respiratório. O objetivo deste trabalho foi identificar a ocorrência dos CoVh em pacientes com infecção respiratória aguda (IRA) na Cidade de Belém, Estado do Pará, Brasil, atendidas pelo programa de vigilância do vírus da influenza do Instituto Evandro Chagas. No período compreendido entre agosto de 2009 a março de 2011, amostras de aspirado da nasofaringe ou swab combinado (nasal e oral) obtidas de 308 pacientes com diagnóstico clínico de IRA, foram laboratorialmente investigadas na busca de evidências de infecção pelo CoVh. A metodologia adotada envolveu quatro etapas principais: a) extração do RNA viral (RNAv) do espécime clínico; b) execução da técnica de reação em cadeia mediada pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR); c) eletroforese em gel de agarose dos produtos gerados; e d) sequenciamento genético de nucleotídeos. O processamento laboratorial de todos os espécimes revelou positividade para CoVh em uma amostra clínica dos pacientes investigados. A análise filogenética da amostra positiva permitiu classificá-la como pertencente ao subtipo OC43 de CoVh. O presente achado representa a primeira comprovação laboratorial da circulação deste agente viral na Região Amazônica. Estudos adicionais são necessários para um maior conhecimento da etiologia e epidemiologia deste agente viral em casos de IRA que ocorrem na Região Norte do Brasil.
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O objetivo deste trabalho foi identificar a ocorrência dos CoVh em pacientes com infecção respiratória aguda (IRA) na Cidade de Belém, Estado do Pará, Brasil, atendidas pelo programa de vigilância do vírus da influenza do Instituto Evandro Chagas. No período compreendido entre agosto de 2009 a março de 2011, amostras de aspirado da nasofaringe ou swab combinado (nasal e oral) obtidas de 308 pacientes com diagnóstico clínico de IRA, foram laboratorialmente investigadas na busca de evidências de infecção pelo CoVh. A metodologia adotada envolveu quatro etapas principais: a) extração do RNA viral (RNAv) do espécime clínico; b) execução da técnica de reação em cadeia mediada pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR); c) eletroforese em gel de agarose dos produtos gerados; e d) sequenciamento genético de nucleotídeos. O processamento laboratorial de todos os espécimes revelou positividade para CoVh em uma amostra clínica dos pacientes investigados. A análise filogenética da amostra positiva permitiu classificá-la como pertencente ao subtipo OC43 de CoVh. O presente achado representa a primeira comprovação laboratorial da circulação deste agente viral na Região Amazônica. Estudos adicionais são necessários para um maior conhecimento da etiologia e epidemiologia deste agente viral em casos de IRA que ocorrem na Região Norte do Brasil.Human coronaviruses (HCoVs) are responsible for causing respiratory and enteric diseases associated with severe acute respiratory tract infections. The aim of this study was to identify the occurrence of HCoVs in patients with acute respiratory infection (ARI) in Belém, Pará State, Brazil, assisted by the surveillance program of influenza viruses of Instituto Evandro Chagas. From August 2009 to March 2011, samples of nasopharyngeal aspirate or nasal and oral swabs obtained from 308 patients with clinical diagnosis of ARI were investigated in the laboratory in order to identify the HCoVs infection. The methodology involved four main steps: a) viral RNA (RNAV) extracted from the clinical specimen; b) application of reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR); agarose electrophoresis gel of the generated products; and d) DNA sequencing. The laboratory processing of all specimens were positive for HCoVs in a clinical sample of patients investigated. The positive sample was classified as belonging to the subtype OC43 of HCoVs by using the phylogenetic analysis. This finding represents the first laboratory confirmation of this viral agent circulation in the Amazon Region. Additional studies are needed for a better understanding of the etiology and epidemiology of this viral agent in cases of ARI occurring in Northern Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.porInstituto Evandro ChagasPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do BrasilFirst detection of human coronaviruses associated with acute respiratory infection in Northern BrazilPrimera detección de coronavirus humano asociado a infección respiratoria aguda en la Región Norte de Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleCoronavirus / patogenicidadeInfecções RespiratóriasReação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa / métodosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdfPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdfapplication/pdf560184https://patua.iec.gov.br/bitstreams/c54f4969-5922-4b96-b1ca-e0d281b575e9/downloadf0c99243a771a42034aab6ca0d5ca528MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-871https://patua.iec.gov.br/bitstreams/550bf37c-dcfe-4f20-8b2b-3a0a1a96e2cc/download52f1732ea66fbd1123abe39f5373b797MD52TEXTPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdf.txtPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdf.txtExtracted texttext/plain22573https://patua.iec.gov.br/bitstreams/d6574a11-254f-474f-8926-d7bc6ea5438a/download4a8b92aae8d0420741977115afa8a4a8MD55THUMBNAILPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdf.jpgPrimeira detecção de coronavírus humano associado à infecção respiratória aguda na Região Norte do Brasil.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5569https://patua.iec.gov.br/bitstreams/67cc2ca2-ebdc-48b2-af95-b52b02d1aaa6/download99258b987baeb105a16e7d04fac6bce8MD56iec/29842022-10-20 21:24:02.938oai:patua.iec.gov.br:iec/2984https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-10-20T21:24:02Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)falseVG9kb3Mgb3MgZG9jdW1lbnRvcyBkZXNzYSBjb2xlw6fDo28gc2VndWVtIGEgTGljZW7Dp2EgQ3JlYXRpdmUgY29tbW9ucy4=
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