Sequenciação do genoma completo como ferramenta da epidemiologia molecular: caracterização de estirpes de Neisseria meningitidis do serogrupo W isoladas em Portugal

• Autor(a) principal: Bettencourt, Célia
• Data de Publicação: 2018
• Outros Autores: Nunes, Alexandra, Simões, Maria João
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.18/5695
• topic: Neisseria meningitidis; Serogrupo W; Vigilância Laboratorial; Infecções Respiratórias; Doenças Infecciosas; Sequenciação de Nova Geração; Sequenciação do Genoma Completo; Saúde Pública; Portugal

Neisseria meningitidis é um comensal da nasofaringe que ocasionalmente causa doença invasiva. Os serogrupos são definidos com base nos antigénios capsulares e a similaridade genética, avaliada por Multilocus Sequence Typing (MLST), permite agrupar as estirpes em complexos clonais (cc). Na Europa, os serogrupos B e C têm sido os mais prevalentes. Desde a epidemia com origem no Hajj em 2000, obser va-se uma incidência crescente de doença invasiva meningocócica (DIM) por estirpes W (MenW), maioritariamente as designadas como a linhagem Hajj. Per tencendo ao cc11, estas estirpes dispersaram-se e evoluíram para várias sublinhagens, nomeadamente a sul-americana, à qual está associada DIM com apresentação clinica atípica e letalidade elevada. É objetivo deste estudo conhecer as características genómicas das estirpes MenW isoladas em Por tugal e compreender a sua relação evolutiva entre estirpes cc11 do mesmo serogrupo, com uma distribuição geográfica e temporal diversa. Caracterizaram-se as estirpes invasivas MenW isoladas em Por tugal entre 2012 e 2018, por MLST e por sequenciação do genoma completo (WGS). Para comparação genómica selecionaram-se os genomas MenWcc11 disponíveis na base de dados Neisseria PubMLST. A análise bioinformática foi realizada com o sof tware chewBBACA e a possível relação evolutiva foi analisada aplicando o algoritmo GoeBURST na plataforma PHYLOViZ Online. No período em análise registaram-se 9 casos de DIM por MenW em Por tugal, agrupadas apenas em dois genótipos cc22 e cc11. As estirpes MenW cc11 incluídas no estudo (4 invasivas e 2 de por tadores) distribuíram-se nas sublinhagens Original UK e Novel UK, emergidas sequencialmente a par tir das estirpes sul-americanas, e numa linhagem da região distal. Tal poder de diferenciação nunca teria sido possível utilizando a metodologia tradicional de caracterização do genótipo (sequenciação de Sanger). O cenário em Por tugal é semelhante ao obser vado noutros países europeus, o que reforça a impor tância da vigilância da DIM, potencialmente com um quadro clínico atípico e letalidade elevada. A metodologia de WGS é uma ferramenta fundamental nesta vigilância e no estudo de sur tos pelo seu poder de diferenciação.