Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Colaço, João Francisco Parraga Ribeiro
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10451/45485
Resumo: Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020
id RCAP_10f37cf989a8c8b06210dbbfdcdedc7e
oai_identifier_str oai:repositorio.ul.pt:10451/45485
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infectionTrypanosoma bruceiTecido adiposoFígadoRNA-SeqTranscriptomaTeses de mestrado - 2020Departamento de Biologia AnimalTese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020Trypanosoma brucei is an extracellular protozoan that causes Human African Trypanosomiasis (HAT) and Animal African Trypanosomiasis (AAT), also known as sleeping sickness and nagana respectively. This parasite is transmitted by tsetse flies, but it is inside a mammalian host that it completes its life cycle. Recently, the adipose tissue was found to be a significant reservoir for T. brucei, triggering a functional adaptation of the parasite to the tissue environment. Furthermore, during infection, most hosts experience weight loss and adipocytes lose their stored lipid content. With a host-oriented view, the goal of this project was to characterize transcriptome changes that occur throughout the infection process and identify key biological pathways for future genetic manipulation. To accomplish this goal, RNA sequencing was performed on adipocyte and liver tissue samples at different timepoints of infection. Both tissues are metabolically tied and would provide a view of the systemic changes that happen in the host during infection. This study followed a typical transcriptomic analysis methodological approach which resulted in sets of differentially expressed genes that were subsequently associated to their functionality. The comparison of experimental conditions revealed that, although there was a big change between non-infected and infected timepoints, few transcriptomic changes were identified among different timepoints of infection, suggesting that the first days after infection are when the host alters its gene expression in response to the disease. We observed that, while the adipose tissue suffers a decrease in its extracellular matrix organization, the liver has a decrease in fatty acid metabolism, with both tissues experiencing a strong immune response against the parasite. Overall, this work established the impact of T. brucei on gene expression of two key organs throughout infection, providing a better understanding of the disease and possible new ways to counteract it.Trypanosoma brucei é um protozoário extracelular que causa Tripanossomíase Humana Africana (THA) e Tripanossomíase Animal Africana (TAA), também conhecidas como doença do sono e nagana, respetivamente. Este parasita é transmitido pela mosca tsé-tsé, mas é no interior de um hospedeiro mamífero que completa o seu ciclo de vida. Recentemente, o tecido adiposo foi descrito como um importante “reservatório” para T. brucei, despoletando uma adaptação funcional do parasita ao tecido. Durante a infeção, a maioria dos hospedeiros sofrem perda de peso e os seus adipócitos perdem as reservas de lipídios. Focando-nos no hospedeiro, o objetivo deste projeto foi caracterizar as alterações do transcriptoma que ocorrem durante a infeção e identificar as vias biológicas importantes que podem vir a ser alvo de manipulação genética. Para alcançar este objetivo, sequenciamento de RNA foi realizado em amostras de adipócitos e fígado ao longo da infeção. Ambos os tecidos estão metabolicamente ligados e permitem obter uma visão sistemática das alterações que ocorrem no hospedeiro durante a infeção. Este estudo segue um médodo de análise transcriptómica comum, resultando num conjunto de genes diferencialmente expressos, que são posteriormente associados à sua funcionalidade. A comparação entre condições experimentais revelou que, mesmo existindo uma grande diferença entre amostras infetadas e não infetadas, as diferenças a nível do transcriptoma são reduzidas entre amostras infetadas de dias diferentes, sugerindo que é durante os primeiros dias de infeção que o hospedeiro altera a sua expressão génica como resposta à doença. Nós observamos que o tecido adiposo sofre uma diminuição da organização da sua matriz extracelular, o fígado tem uma redução no metabolismo dos ácidos gordos e que ambos os tecidos reagem com uma resposta imune forte contra o parasita. Globalmente, este trabalho estabeleceu o impacto de T. brucei na expressão génica ao longo do tempo de dois órgãos importantes, contribuindo para o entendimento desta doença e para a potencial descoberta de novas maneiras de a mitigar.Figueiredo, Luísa MirandaCarvalho, Margarida Henriques da Gama, 1972-Repositório da Universidade de LisboaColaço, João Francisco Parraga Ribeiro2023-06-29T00:30:28Z202020202020-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/45485TID:202596516enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-08T16:47:23Zoai:repositorio.ul.pt:10451/45485Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T21:57:55.205783Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
title Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
spellingShingle Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
Colaço, João Francisco Parraga Ribeiro
Trypanosoma brucei
Tecido adiposo
Fígado
RNA-Seq
Transcriptoma
Teses de mestrado - 2020
Departamento de Biologia Animal
title_short Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
title_full Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
title_fullStr Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
title_full_unstemmed Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
title_sort Longitudinal analysis of adipocytes and liver gene expression during T. brucei infection
author Colaço, João Francisco Parraga Ribeiro
author_facet Colaço, João Francisco Parraga Ribeiro
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Figueiredo, Luísa Miranda
Carvalho, Margarida Henriques da Gama, 1972-
Repositório da Universidade de Lisboa
dc.contributor.author.fl_str_mv Colaço, João Francisco Parraga Ribeiro
dc.subject.por.fl_str_mv Trypanosoma brucei
Tecido adiposo
Fígado
RNA-Seq
Transcriptoma
Teses de mestrado - 2020
Departamento de Biologia Animal
topic Trypanosoma brucei
Tecido adiposo
Fígado
RNA-Seq
Transcriptoma
Teses de mestrado - 2020
Departamento de Biologia Animal
description Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020
2020
2020-01-01T00:00:00Z
2023-06-29T00:30:28Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10451/45485
TID:202596516
url http://hdl.handle.net/10451/45485
identifier_str_mv TID:202596516
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799134523670134784

Registros relacionados