Análise "In silico" de transposases da família ISL3

• Autor(a) principal: Santos, Pedro Miguel Guedes
• Data de Publicação: 2006
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10773/27486
• topic: Transposase; ISL3; Relações evolutivas

Sequências de inserção são elementos genéticos móveis que codificam genes responsáveis por eventos de inserção. Apresentam na sua constituição enzimas denominadas transposases, que apresentam elevada variabilidade intraespecífica. De acordo com essa variabilidade, as sequências de inserção estão classificadas em grupos de afinidade, designados de famílias. Uma dessas famílias de transposases é a ISL3. Procedeu-se à exploração de bases de dados de proteínas e sequências de aminoácidos para extrair a informação existente sobre sequências de transposases da família ISL3. Utilizando as aplicações informáticas ClustalW e TreeView, efectuou-se a análise comparativa de trinta e quatro sequências de transposases da família ISL3 e determinação das relações evolutivas das respectivas sequências com base nos alinhamentos e cladogramas gerados pelos programas acima indicados. As trinta e quatro transposases analisadas são agrupadas em três grupos evolutivos distintos, sendo a transposase da IS1489v1 (de Pseudomonas putida ML2), a transposase mais próxima da raiz do cladograma. Das trinta e quatro transposases seleccionaram-se seis que se encontram presentes nos genomas de bactérias Gram-positivas de elevado contudo percentual em G+C e procedeu-se ao seu alinhamento. Verificou-se que as transposases das IS31831 e IS13869 apresentam as sequências de aminoácidos com maior grau de homologia (79,1%) entre si