Resistência a antimicrobianos em Staphylococcus aureus isolados de animais de companhia
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/116300 |
Resumo: | Em medicina veterinária, as infeções da pele e tecidos moles (skin and soft tissue infecti-ons, SSTIs) são uma das patologias mais frequentes, maioritariamente causadas por Staphylococcus spp., incluindo S. aureus. Para além da sua relevância na saúde humana, as estirpes resistentes à meticilina (methicillin-resistant S. aureus, MRSA) são agora um problema emergente em medicina veterinária. Adicionalmente, o uso intensivo de antibi-óticos e biocidas é apontado como uma potencial força seletiva da emergência e dissemi-nação de bactérias resistentes a antimicrobianos. Esta Dissertação teve como alvo uma coleção de 55 S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, sobretudo cães e gatos. Estes são provenientes de isolados obtidos de amostras biológicas rececionadas por dois laboratórios em Lisboa, entre 1999 e 2018. A identificação dos isolados foi confirmada por amplificação do gene nuc, utilizando pri-mers específicos da espécie. A caracterização dos perfis de suscetibilidade a antibióticos (incluindo tópicos) e biocidas (antissépticos e metais pesados) foi realizada pelo método de difusão em disco e determinação da concentração mínima inibitória (CMI), respetiva-mente. A distribuição de halos de inibição e/ou CMIs foi utilizada para estimar ECOFFs (epidemiological cut-off values) para cada combinação S. aureus-antibiótico/biocida. A presença de determinantes genotípicos de resistência a antibióticos e biocidas foi pesqui-sada por PCR. Já a atividade de efluxo foi avaliada pelo Método Cartwheel-EtBr e por determinação da CMI de brometo de etídio (EtBr). No total dos 55 S. aureus caracterizados, 56,4 % (31/55) são MRSA. Mais de 85 % dos isolados são resistentes a, pelo menos, um antibiótico e 12,7 % demonstram um fenótipo de multi-resistência (multidrug resistance, MDR). As classes antibióticas mais prevalen-tes nos perfis de resistência foram os β-lactâmicos (81,8 %), fluoroquinolonas (56,4 %) e macrólidos/lincosamidas (14,5 %). A resistência aos β-lactâmicos e aos macrólidos/lin-cosamidas encontra-se associada aos determinantes genotípicos blaZ e/ou mecA, erm(A) ou erm(C), respetivamente. Também foi detetada resistência ao ácido fusídico, florfenicol e gentamicina, relacionada com a presença dos genes fusC, fexA, e aadD, e ainda à baci-tracina. Quanto aos biocidas, a determinação de ECOFFs permitiu a identificação de vários iso-lados non wild-type (NWT) para o brometo de tetrafenilfosfónio, arseniato, cádmio e zinco. A diminuição da suscetibilidade a estes foi associada à presença dos genes smr, arsB, cadA e cadD. Os isolados NWT para estes biocidas também demonstraram maior atividade de efluxo. No seu conjunto, os dados obtidos demonstram uma elevada prevalência de resistência a antimicrobianos em S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, particular-mente MRSA e MDR, evidenciando a crescente limitação das opções terapêuticas para estas infeções. Estes resultados reforçam a necessidade de uma abordagem One Health no estudo de infeções bacterianas causadas por estafilococos em animais de companhia. |
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Resistência a antimicrobianos em Staphylococcus aureus isolados de animais de companhiaCiências biomédicasMicrobiologia médicaResistência a antimicrobianos em Staphylococcus aureusAnimais de companhiaDomínio/Área Científica::Ciências MédicasEm medicina veterinária, as infeções da pele e tecidos moles (skin and soft tissue infecti-ons, SSTIs) são uma das patologias mais frequentes, maioritariamente causadas por Staphylococcus spp., incluindo S. aureus. Para além da sua relevância na saúde humana, as estirpes resistentes à meticilina (methicillin-resistant S. aureus, MRSA) são agora um problema emergente em medicina veterinária. Adicionalmente, o uso intensivo de antibi-óticos e biocidas é apontado como uma potencial força seletiva da emergência e dissemi-nação de bactérias resistentes a antimicrobianos. Esta Dissertação teve como alvo uma coleção de 55 S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, sobretudo cães e gatos. Estes são provenientes de isolados obtidos de amostras biológicas rececionadas por dois laboratórios em Lisboa, entre 1999 e 2018. A identificação dos isolados foi confirmada por amplificação do gene nuc, utilizando pri-mers específicos da espécie. A caracterização dos perfis de suscetibilidade a antibióticos (incluindo tópicos) e biocidas (antissépticos e metais pesados) foi realizada pelo método de difusão em disco e determinação da concentração mínima inibitória (CMI), respetiva-mente. A distribuição de halos de inibição e/ou CMIs foi utilizada para estimar ECOFFs (epidemiological cut-off values) para cada combinação S. aureus-antibiótico/biocida. A presença de determinantes genotípicos de resistência a antibióticos e biocidas foi pesqui-sada por PCR. Já a atividade de efluxo foi avaliada pelo Método Cartwheel-EtBr e por determinação da CMI de brometo de etídio (EtBr). No total dos 55 S. aureus caracterizados, 56,4 % (31/55) são MRSA. Mais de 85 % dos isolados são resistentes a, pelo menos, um antibiótico e 12,7 % demonstram um fenótipo de multi-resistência (multidrug resistance, MDR). As classes antibióticas mais prevalen-tes nos perfis de resistência foram os β-lactâmicos (81,8 %), fluoroquinolonas (56,4 %) e macrólidos/lincosamidas (14,5 %). A resistência aos β-lactâmicos e aos macrólidos/lin-cosamidas encontra-se associada aos determinantes genotípicos blaZ e/ou mecA, erm(A) ou erm(C), respetivamente. Também foi detetada resistência ao ácido fusídico, florfenicol e gentamicina, relacionada com a presença dos genes fusC, fexA, e aadD, e ainda à baci-tracina. Quanto aos biocidas, a determinação de ECOFFs permitiu a identificação de vários iso-lados non wild-type (NWT) para o brometo de tetrafenilfosfónio, arseniato, cádmio e zinco. A diminuição da suscetibilidade a estes foi associada à presença dos genes smr, arsB, cadA e cadD. Os isolados NWT para estes biocidas também demonstraram maior atividade de efluxo. No seu conjunto, os dados obtidos demonstram uma elevada prevalência de resistência a antimicrobianos em S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, particular-mente MRSA e MDR, evidenciando a crescente limitação das opções terapêuticas para estas infeções. Estes resultados reforçam a necessidade de uma abordagem One Health no estudo de infeções bacterianas causadas por estafilococos em animais de companhia.In veterinary medicine, skin and soft tissue infections (SSTIs) are among the most fre-quent pathologies, often caused by staphylococci, including Staphylococcus aureus. Be-side their relevance in human medicine, methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strains became an emerging problem in veterinary medicine. Additionally, the overuse of antibi-otics and biocides is suggested as a potential selective force for the emergence and dis-semination of antimicrobial resistant bacteria. This work aimed to study a collection of 55 S. aureus associated with SSTIs in companion animals (mainly dogs and cats) from two laboratories in Lisbon, collected between 1999 and 2018. Identification was confirmed by a species-specific nuc gene PCR. The antibi-otic and biocide (antiseptics and heavy-metals) susceptibility profiles of the isolates were determined by disk diffusion and MIC determination, respectively. The distributions of inhibition halos and MICs were used to estimate epidemiological cut-off (ECOFF) values for each combination S. aureus-antibiotic/biocide. The presence of antibiotic and biocide resistance determinants was screened by PCR. Efflux activity was evaluated by the eth-idium bromide (EtBr)-agar Cartwheel Method and EtBr MIC determination. Among these 55 SSTIs-related S. aureus, 56.4 % (31/55) were MRSA. Over 85 % of the isolates were resistant to at least one antibiotic and 12.7 % showed a multidrug resistance (MDR) phenotype. Resistance was most frequently observed for beta-lactams (81.8 %), fluoroquinolones (56.4 %) and macrolides/lincosamides (14.5 %), Resistance to beta-lac-tams and macrolides/lincosamides was mostly related to carriage of blaZ and/or mecA, erm(A) or erm(C), respectively. We also detected resistance to fusidic acid, florfenicol and gentamicin, related to fusC, fexA, and aadD, as well as to bacitracin. Biocides ECOFFs allowed the identification of several non wild-type (NWT) isolates for tetraphenylphosphonium, arsenate, cadmium and zinc. Decreased susceptibility to these compounds was associated with the presence of the smr, arsB, cadA and cadD genes. These NWT isolates also showed increased efflux activity. Overall, our findings demonstrate a high prevalence of antimicrobial resistant S. aureus strains associated with SSTIs in pets, particularly MRSA and MDR, evidencing a grow-ing limitation of available therapeutic options for the management of these infections. These results reinforce the need of a One Health approach on the study of staphylococci causing infections in pets.COUTO, IsabelCOSTA, Sofia SantosRUNRIBEIRO, Rute2022-03-03T01:31:04Z202020202020-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/116300TID:202557600porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T04:58:47Zoai:run.unl.pt:10362/116300Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:43:01.517363Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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Em medicina veterinária, as infeções da pele e tecidos moles (skin and soft tissue infecti-ons, SSTIs) são uma das patologias mais frequentes, maioritariamente causadas por Staphylococcus spp., incluindo S. aureus. Para além da sua relevância na saúde humana, as estirpes resistentes à meticilina (methicillin-resistant S. aureus, MRSA) são agora um problema emergente em medicina veterinária. Adicionalmente, o uso intensivo de antibi-óticos e biocidas é apontado como uma potencial força seletiva da emergência e dissemi-nação de bactérias resistentes a antimicrobianos. Esta Dissertação teve como alvo uma coleção de 55 S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, sobretudo cães e gatos. Estes são provenientes de isolados obtidos de amostras biológicas rececionadas por dois laboratórios em Lisboa, entre 1999 e 2018. A identificação dos isolados foi confirmada por amplificação do gene nuc, utilizando pri-mers específicos da espécie. A caracterização dos perfis de suscetibilidade a antibióticos (incluindo tópicos) e biocidas (antissépticos e metais pesados) foi realizada pelo método de difusão em disco e determinação da concentração mínima inibitória (CMI), respetiva-mente. A distribuição de halos de inibição e/ou CMIs foi utilizada para estimar ECOFFs (epidemiological cut-off values) para cada combinação S. aureus-antibiótico/biocida. A presença de determinantes genotípicos de resistência a antibióticos e biocidas foi pesqui-sada por PCR. Já a atividade de efluxo foi avaliada pelo Método Cartwheel-EtBr e por determinação da CMI de brometo de etídio (EtBr). No total dos 55 S. aureus caracterizados, 56,4 % (31/55) são MRSA. Mais de 85 % dos isolados são resistentes a, pelo menos, um antibiótico e 12,7 % demonstram um fenótipo de multi-resistência (multidrug resistance, MDR). As classes antibióticas mais prevalen-tes nos perfis de resistência foram os β-lactâmicos (81,8 %), fluoroquinolonas (56,4 %) e macrólidos/lincosamidas (14,5 %). A resistência aos β-lactâmicos e aos macrólidos/lin-cosamidas encontra-se associada aos determinantes genotípicos blaZ e/ou mecA, erm(A) ou erm(C), respetivamente. Também foi detetada resistência ao ácido fusídico, florfenicol e gentamicina, relacionada com a presença dos genes fusC, fexA, e aadD, e ainda à baci-tracina. Quanto aos biocidas, a determinação de ECOFFs permitiu a identificação de vários iso-lados non wild-type (NWT) para o brometo de tetrafenilfosfónio, arseniato, cádmio e zinco. A diminuição da suscetibilidade a estes foi associada à presença dos genes smr, arsB, cadA e cadD. Os isolados NWT para estes biocidas também demonstraram maior atividade de efluxo. No seu conjunto, os dados obtidos demonstram uma elevada prevalência de resistência a antimicrobianos em S. aureus associados a SSTIs em animais de companhia, particular-mente MRSA e MDR, evidenciando a crescente limitação das opções terapêuticas para estas infeções. Estes resultados reforçam a necessidade de uma abordagem One Health no estudo de infeções bacterianas causadas por estafilococos em animais de companhia. |
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