Caracterização de novos flebovírus de ixodídeos: diversidade genética e distruição geográfica em Portugal e na Estremadura espanhola

• Autor(a) principal: AFONSO, Rita
• Data de Publicação: 2018
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10362/52951
• topic: Ciências biomédicas; Biologia molecular; Phebovírus; Ixodídeos; Sequências do segmento - L; Caracterização filogenética; Portugal; Estremadura espanhola; Domínio/Área Científica::Ciências Médicas

A descoberta dos vírus Heartland e Severe fever with thrombocytopenia syndrome, ambos patogénicos para o Homem, estimulou na última década a identificação e caracterização de novos flebovírus (Bunyavirales, Phenuiviridae, Phlebovirus), transmitidos por, ou associados a ixodídeos. Este trabalho foi realizado com o objetivo de investigar a distribuição natural destes agentes, e caracterizar a sua diversidade em ixodídeos colhidos em Portugal e Espanha. Utilizámos para o rastreio das amostras analisadas uma estratégia de deteção baseada na utilização de RT-PCR, gerando, concomitantemente, sequências parciais de Phlebovirus correspondentes a parte da sequência que codifica a polimerase de RNA viral. As colheitas dos exemplares de ixodídeos analisados foram efetuadas no centro e norte de Portugal, na Ilha de São Miguel (arquipélago dos Açores), na Ilha da Madeira (arquipélago da Madeira) e na região ocidental de Espanha (províncias da Estremadura e Castela/Leão). Da amostra estudada, com um total de 746 ixodídeos, 221 (29,6%) foram recolhidos da vegetação e 525 (70,6%) de hospedeiros vertebrados. Foi ainda possível estudar 3 posturas de ovos ocorridas no período decorrido entre a recolha e o trabalho experimental. Os ixodídeos foram organizados em pools, tendo sido obtidos resultados positivos de amplificação de sequências virais em 45/92 (48,9%) das pools estudadas. Este resultado revelou-se independentemente dos diferentes métodos de recolha dos exemplares, dos seus estádios de desenvolvimento, bem como do género dos exemplares neles incluídos. A análise filogenética de um fragmento de cerca de 500 pb (segmento L), permitiu aferir a existência de relações de filogenia entre as sequências obtidas, onde as linhagens genéticas encontradas foram consistentes nas várias árvores filogenéticas efetuadas. Foi ainda evidente a associação de linhagens com as sequências da proteína putativa da proteína L, caracterizada pelos grupos (padrões) de resíduos de aminoácidos identificados em alinhamentos múltiplos de sequências proteicas. Na maior parte dos casos, quando analisadas múltiplas sequências obtidas a partir de um mesmo produto de amplificação, foi revelada uma baixa diversidade genética. Como perspetiva consideramos ser de extrema importância que estes estudos continuem a ser feitos e alargados, pelo menos, a toda a Europa de forma a rastrear a diversidade genética, a evolução, a taxonomia, a epidemiologia e avaliar a eventual patogenicidade (ou não) destes vírus.