Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Martins, Valquíria do Carmo Alves
Data de Publicação: 2019
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/5355326097001242, https://orcid.org/0000-0003-1259-9738
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
Texto Completo: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989
Resumo: O Câncer de pênis apresenta alta incidência no Brasil, sobretudo nas regiões Norte e Nordeste. De etiologia heterogênea, pode estar relacionado à infecção pelo HPV ou por outros mecanismos moleculares. Neste estudo, A infecção pelo HPV foi observada em 45% dos casos. A infecção pelo EBV foi 30% e 25% apresentavam co-infecção com HPV. A análise de viroma de pacientes (HPV- e EBV-) não mostrou a presença de vírus com potencial oncogênico. Entretanto, foi observado que 99% de sequência mapearam com genoma humano, possibilitando a avaliação de múltiplas alterações genéticas.
id UFAM_9eb32a421ade05517e3848a2d97c4839
oai_identifier_str oai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7989
network_acronym_str UFAM
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository_id_str 6592
spelling Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do AmazonasEpidemiologia - PesquisaNeoplasia penianaPesquisa sociodemográficaPapilomavírusVírus Epstein-BarrCIÊNCIAS DA SAÚDECâncer de pênisEpidemiologiaViromaMetagenomaAmazonasO Câncer de pênis apresenta alta incidência no Brasil, sobretudo nas regiões Norte e Nordeste. De etiologia heterogênea, pode estar relacionado à infecção pelo HPV ou por outros mecanismos moleculares. Neste estudo, A infecção pelo HPV foi observada em 45% dos casos. A infecção pelo EBV foi 30% e 25% apresentavam co-infecção com HPV. A análise de viroma de pacientes (HPV- e EBV-) não mostrou a presença de vírus com potencial oncogênico. Entretanto, foi observado que 99% de sequência mapearam com genoma humano, possibilitando a avaliação de múltiplas alterações genéticas.Penile cancer is not an uncommon neoplasm in developing countries. Brazil appears among the countries with high incidence - particularly in the North and Northeast. The etiology of this neoplasm appears to be multifactorial; phimosis, retention of smegma, inflammatory processes, zoophilia, smoking, infection with oncogenic viruses such as Human papillomavirus (HPV) and Epstein-Barr virus (EBV) may be associated with the onset of cancer. The application of next generation sequencing (NGS) is a promising strategy in the discovery of potentially oncogenic virus in tumor tissue. Objectives: In order to understand the profile of penile cancer patients in the region, this study aimed to describe the sociodemographic, behavioral, clinical and viroma characteristics of penile cancer patients treated at a public oncology referral hospital in Manaus, Amazonas - Brazil. Methods: Forty-seven patients diagnosed with penile cancer from 2013 to 2018 were included in the study. Initially screening for oncogenic viruses (HPV and EBV) was performed by PCR. For the viral study by metagenomics we used the protocol NetoVIR - Novel enrichment technique of VIRomes. Results: The mean age of patients at the time of diagnosis was 57.4 years ±SD 17.8 ranging from 20 to 90 years old. Most patients had phimosis and come from the interior of the state of Amazonas or from other states (64% and 77%, respectively). HPV infection was observed in 45% (21/47) of cases. HPV16 was detected in 13 patients (61%). Other HPV types detected were HPV 6, 11, 42, 51, 53, 68 and 44/55. EBV infection was observed in 30% (14/47) of the patients with PC. The p16INK4a overexpression was observed exclusively in HPV 16 positive cases and four HPV negative cases. In the survival analysis, the follow-up time was 35.4 months/patient. The mortality rate during the follow up time was 38%. Thirteen patients with penile cancer non-HPV/EBV-associated were submitted viral metagenomic analysis. Bioinformatics analysis of high-throughput sequencing for virus detection combined two existing workflows which resulted in a range of 190-2,232 reads (< 0.1%) by Kraken and 458,189 – 1,277,735 reads (~6%) by Kaiju – RVDB. Interestingly, between 10-70% of the sequences remained unclassified, suggesting the potential of high throughput metagenomic sequencing studies, such as ours, to identify new microorganisms possibly related to cancer. Conclusions: Penile carcinogenesis has heterogeneous etiology and could be assigned HPV infection or molecular mechanisms independent of HPV. In this study, 27% (13/47) patients with penile cancer non-HPV/EBV-associated were analyses by NGS. Most of the DNA sequencing was found to represent unclassified sequences. As the bioinformatics analysis showed ~99% sequences to map against the human genome, it becomes possible to assess multiple genetic alterations and maybe to predict of outcome in penile cancer.Universidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-graduação em Imunologia Básica e AplicadaSilva, Kátia Luz Torreshttp://lattes.cnpq.br/5785470863950566Naveca, Felipe Gomeshttp://lattes.cnpq.br/3396741165569463Ramasawmy, Rajendranathhttp://lattes.cnpq.br/3420417277915974Saito, Danielhttp://lattes.cnpq.br/9653041674065765Martins, Valquíria do Carmo Alveshttp://lattes.cnpq.br/5355326097001242https://orcid.org/0000-0003-1259-97382020-10-30T21:26:21Z2019-12-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfMARTINS, Valquíria do Carmo Alves. Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas. 2019. 121 f. Tese (Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2020-10-31T05:03:48Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/7989Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922020-10-31T05:03:48Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
dc.title.none.fl_str_mv Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
title Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
spellingShingle Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
Martins, Valquíria do Carmo Alves
Epidemiologia - Pesquisa
Neoplasia peniana
Pesquisa sociodemográfica
Papilomavírus
Vírus Epstein-Barr
CIÊNCIAS DA SAÚDE
Câncer de pênis
Epidemiologia
Viroma
Metagenoma
Amazonas
title_short Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
title_full Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
title_fullStr Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
title_full_unstemmed Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
title_sort Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas
author Martins, Valquíria do Carmo Alves
author_facet Martins, Valquíria do Carmo Alves
http://lattes.cnpq.br/5355326097001242
https://orcid.org/0000-0003-1259-9738
author_role author
author2 http://lattes.cnpq.br/5355326097001242
https://orcid.org/0000-0003-1259-9738
author2_role author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Silva, Kátia Luz Torres
http://lattes.cnpq.br/5785470863950566
Naveca, Felipe Gomes
http://lattes.cnpq.br/3396741165569463
Ramasawmy, Rajendranath
http://lattes.cnpq.br/3420417277915974
Saito, Daniel
http://lattes.cnpq.br/9653041674065765
dc.contributor.author.fl_str_mv Martins, Valquíria do Carmo Alves
http://lattes.cnpq.br/5355326097001242
https://orcid.org/0000-0003-1259-9738
dc.subject.por.fl_str_mv Epidemiologia - Pesquisa
Neoplasia peniana
Pesquisa sociodemográfica
Papilomavírus
Vírus Epstein-Barr
CIÊNCIAS DA SAÚDE
Câncer de pênis
Epidemiologia
Viroma
Metagenoma
Amazonas
topic Epidemiologia - Pesquisa
Neoplasia peniana
Pesquisa sociodemográfica
Papilomavírus
Vírus Epstein-Barr
CIÊNCIAS DA SAÚDE
Câncer de pênis
Epidemiologia
Viroma
Metagenoma
Amazonas
description O Câncer de pênis apresenta alta incidência no Brasil, sobretudo nas regiões Norte e Nordeste. De etiologia heterogênea, pode estar relacionado à infecção pelo HPV ou por outros mecanismos moleculares. Neste estudo, A infecção pelo HPV foi observada em 45% dos casos. A infecção pelo EBV foi 30% e 25% apresentavam co-infecção com HPV. A análise de viroma de pacientes (HPV- e EBV-) não mostrou a presença de vírus com potencial oncogênico. Entretanto, foi observado que 99% de sequência mapearam com genoma humano, possibilitando a avaliação de múltiplas alterações genéticas.
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019-12-06
2020-10-30T21:26:21Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv MARTINS, Valquíria do Carmo Alves. Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas. 2019. 121 f. Tese (Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989
identifier_str_mv MARTINS, Valquíria do Carmo Alves. Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas. 2019. 121 f. Tese (Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.
url https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
instname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron:UFAM
instname_str Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron_str UFAM
institution UFAM
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
repository.mail.fl_str_mv ddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.br
_version_ 1809732041667772416

Registros relacionados