Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Meira, Ariana Nascimento
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFBA
Texto Completo: http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31508
Resumo: O objetivo desta pesquisa foi identificar, em ovinos Santa Inês, polimorfismos do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphis) nos genes IGF1 (Insulin Like Growth Factor 1), GH (Growth Hormone), LEP (Leptin), CAPN1 (Calpain 1) e CAST (calpastatin) e verificar se estão associados a características que evidenciam qualidade de carne ou de carcaça. Para tanto, foram sequenciados fragmentos destes genes em até 191 animais. Na região estudada do IGF1, cerca de 4.550 pb (pares de base), foram detectados 18 SNPs em região de intron. Nos 2.045 pb estudados do gene da leptina foram identificados 21 SNPs, sendo um em região de exon. No gene GH, onde 1.194 pb foram sequenciados, 21 polimorfismos foram identificados, sendo 3 localizados em exon. Nos 3.927 pb estudados do gene CAPN1, foram identificados 45 SNPs, um deles localizado em exon. No gene CAST, 4.108 pb foram sequenciados e 58 polimorfismos identificados, sendo um em exon. Deste total de polimorfismos, 115 SPN apresentaram distribuição de frequência que permitiu utilizá-los para estimar efeitos aditivo e de dominância, sendo 6 no IGF1, 16 no LEP, 52 no CAST, 5 no GH e 36 no CAPN1. Para alguns marcadores as frequências genotípicas e alélicas diferiram de forma expressiva entres os dois grupos de animais estudados (Embrapa e UFBA). Isso indica que há variação nas frequências de alguns marcadores dentro dos rebanhos da raça Santa Inês e a resposta ao processo de seleção dependerá muito da frequência do alelo favorável no rebanho sob seleção. Vários marcadores tiveram efeito aditivo significativo sobre atributos de carne e de carcaça e podem ser boa fonte de informação para a seleção de ovinos da raça Santa Inês. Muitos desses efeitos ainda não haviam sido reportados em ovinos, o que torna o presente estudo uma fonte de referência para outros trabalhos com esta espécie.
id UFBA-2_7a7c0692ce4383d7437d1541842a2da5
oai_identifier_str oai:repositorio.ufba.br:ri/31508
network_acronym_str UFBA-2
network_name_str Repositório Institucional da UFBA
repository_id_str 1932
spelling Meira, Ariana NascimentoMeira, Ariana NascimentoPinto, Luís Fernando BatistaCoutinho, Luiz LehmannPinto, Luís Fernando BaristaMourão, Gerson BarretoCoutinho, Luiz LehmannCosta, Raphael BermalPedrosa, Victor Breno2020-03-03T16:30:22Z2020-03-03T16:30:22Z2020-03-032016-01-04http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31508O objetivo desta pesquisa foi identificar, em ovinos Santa Inês, polimorfismos do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphis) nos genes IGF1 (Insulin Like Growth Factor 1), GH (Growth Hormone), LEP (Leptin), CAPN1 (Calpain 1) e CAST (calpastatin) e verificar se estão associados a características que evidenciam qualidade de carne ou de carcaça. Para tanto, foram sequenciados fragmentos destes genes em até 191 animais. Na região estudada do IGF1, cerca de 4.550 pb (pares de base), foram detectados 18 SNPs em região de intron. Nos 2.045 pb estudados do gene da leptina foram identificados 21 SNPs, sendo um em região de exon. No gene GH, onde 1.194 pb foram sequenciados, 21 polimorfismos foram identificados, sendo 3 localizados em exon. Nos 3.927 pb estudados do gene CAPN1, foram identificados 45 SNPs, um deles localizado em exon. No gene CAST, 4.108 pb foram sequenciados e 58 polimorfismos identificados, sendo um em exon. Deste total de polimorfismos, 115 SPN apresentaram distribuição de frequência que permitiu utilizá-los para estimar efeitos aditivo e de dominância, sendo 6 no IGF1, 16 no LEP, 52 no CAST, 5 no GH e 36 no CAPN1. Para alguns marcadores as frequências genotípicas e alélicas diferiram de forma expressiva entres os dois grupos de animais estudados (Embrapa e UFBA). Isso indica que há variação nas frequências de alguns marcadores dentro dos rebanhos da raça Santa Inês e a resposta ao processo de seleção dependerá muito da frequência do alelo favorável no rebanho sob seleção. Vários marcadores tiveram efeito aditivo significativo sobre atributos de carne e de carcaça e podem ser boa fonte de informação para a seleção de ovinos da raça Santa Inês. Muitos desses efeitos ainda não haviam sido reportados em ovinos, o que torna o presente estudo uma fonte de referência para outros trabalhos com esta espécie.Submitted by Kleber Morbeck Alves (klebermorbeck@gmail.com) on 2020-03-02T19:03:14Z No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5)Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2020-03-03T16:30:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5)Made available in DSpace on 2020-03-03T16:30:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB)Genética e Melhoramento dos Animais DomésticosBiotecnologiaGenéticaMarcadores molecularesMelhoramento animalSequenciamentoOvinosIdentificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inêsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisEscola de Medicina Veterinária e ZootecniaPós-Graduação em ZootecniaPOSZOO-UFBABrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAORIGINALARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdfARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdfapplication/pdf2234049https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/1/ARIANA%20NASCIMENTO%20MEIRA%20-%2027-04-2016.pdfc5fd325c3992657d51ed70c873f10dbcMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1442https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/2/license.txt817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1aMD52TEXTARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf.txtARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf.txtExtracted texttext/plain266985https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/3/ARIANA%20NASCIMENTO%20MEIRA%20-%2027-04-2016.pdf.txt18234823f3a8ffaf290596474e2fe77eMD53ri/315082022-07-05 14:04:13.197oai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322022-07-05T17:04:13Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
title Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
spellingShingle Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
Meira, Ariana Nascimento
Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Biotecnologia
Genética
Marcadores moleculares
Melhoramento animal
Sequenciamento
Ovinos
title_short Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
title_full Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
title_fullStr Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
title_full_unstemmed Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
title_sort Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
author Meira, Ariana Nascimento
author_facet Meira, Ariana Nascimento
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Meira, Ariana Nascimento
Meira, Ariana Nascimento
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Pinto, Luís Fernando Batista
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Coutinho, Luiz Lehmann
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Pinto, Luís Fernando Barista
Mourão, Gerson Barreto
Coutinho, Luiz Lehmann
Costa, Raphael Bermal
Pedrosa, Victor Breno
contributor_str_mv Pinto, Luís Fernando Batista
Coutinho, Luiz Lehmann
Pinto, Luís Fernando Barista
Mourão, Gerson Barreto
Coutinho, Luiz Lehmann
Costa, Raphael Bermal
Pedrosa, Victor Breno
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
topic Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Biotecnologia
Genética
Marcadores moleculares
Melhoramento animal
Sequenciamento
Ovinos
dc.subject.por.fl_str_mv Biotecnologia
Genética
Marcadores moleculares
Melhoramento animal
Sequenciamento
Ovinos
description O objetivo desta pesquisa foi identificar, em ovinos Santa Inês, polimorfismos do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphis) nos genes IGF1 (Insulin Like Growth Factor 1), GH (Growth Hormone), LEP (Leptin), CAPN1 (Calpain 1) e CAST (calpastatin) e verificar se estão associados a características que evidenciam qualidade de carne ou de carcaça. Para tanto, foram sequenciados fragmentos destes genes em até 191 animais. Na região estudada do IGF1, cerca de 4.550 pb (pares de base), foram detectados 18 SNPs em região de intron. Nos 2.045 pb estudados do gene da leptina foram identificados 21 SNPs, sendo um em região de exon. No gene GH, onde 1.194 pb foram sequenciados, 21 polimorfismos foram identificados, sendo 3 localizados em exon. Nos 3.927 pb estudados do gene CAPN1, foram identificados 45 SNPs, um deles localizado em exon. No gene CAST, 4.108 pb foram sequenciados e 58 polimorfismos identificados, sendo um em exon. Deste total de polimorfismos, 115 SPN apresentaram distribuição de frequência que permitiu utilizá-los para estimar efeitos aditivo e de dominância, sendo 6 no IGF1, 16 no LEP, 52 no CAST, 5 no GH e 36 no CAPN1. Para alguns marcadores as frequências genotípicas e alélicas diferiram de forma expressiva entres os dois grupos de animais estudados (Embrapa e UFBA). Isso indica que há variação nas frequências de alguns marcadores dentro dos rebanhos da raça Santa Inês e a resposta ao processo de seleção dependerá muito da frequência do alelo favorável no rebanho sob seleção. Vários marcadores tiveram efeito aditivo significativo sobre atributos de carne e de carcaça e podem ser boa fonte de informação para a seleção de ovinos da raça Santa Inês. Muitos desses efeitos ainda não haviam sido reportados em ovinos, o que torna o presente estudo uma fonte de referência para outros trabalhos com esta espécie.
publishDate 2016
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2016-01-04
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-03-03T16:30:22Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-03-03T16:30:22Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2020-03-03
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31508
url http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31508
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.publisher.program.fl_str_mv Pós-Graduação em Zootecnia
dc.publisher.initials.fl_str_mv POSZOO-UFBA
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFBA
instname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)
instacron:UFBA
instname_str Universidade Federal da Bahia (UFBA)
instacron_str UFBA
institution UFBA
reponame_str Repositório Institucional da UFBA
collection Repositório Institucional da UFBA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/1/ARIANA%20NASCIMENTO%20MEIRA%20-%2027-04-2016.pdf
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/2/license.txt
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31508/3/ARIANA%20NASCIMENTO%20MEIRA%20-%2027-04-2016.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc
817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1a
18234823f3a8ffaf290596474e2fe77e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808459610304020480