Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Machado, Alessandro Lima
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFBA
Texto Completo: http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31060
Resumo: O objetivo deste estudo foi identificar associação entre polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP e características de interesse econômico em 192 ovinos Santa Inês. Peso vivo aos 100 (P100) e 240 dias (P240) dias de idade, as alturas na cernelha (AC) e na garupa (AG), o comprimentos do corpo (CC), os perímetros do tórax (PT) e da perna (PP), as larguras do tórax (LP) e da garupa (LG), a profundidade de corpo (PC), a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e o escore de terminação de carcaça (ETC) foram os fenótipos avaliados. Um total de 112 polimorfismos foram testados, sendo 25 no CAPN1, 42 no CAST, 16 no GH, 11 no IGF1 e 18 no LEP. Cada marcador foi testado individualmente e por fim uma abordagem de haplótipos também foi conduzida. Vinte e três associações foram detectadas entre SNPs no gene CAST e as variáveis P100, P240, ETC, EGS, PT e LT. Além disso, efeitos de haplótipos no gene CAST sobre AOL, GMD, PT, CC e PP foram encontrados. Para os SNPs no CAPN1, sete efeitos aditivos sobre P100, AG, AC, PC, EGS e AOL foram encontrados, enquanto a análise de associação por haplótipos detectou efeito sobre EGS. O SNP g.47486819C>A localizado no GH foi associado com P100, enquanto o SNP g.171110428C>T no IGF1 foi associado com AC, AG, LT, PP e GMD. Os SNPs localizados no gene LEP (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) foram associados com ETC, AG e EGS. Além disso, os SNPs g.92502623G>C e g.92502947A>C no LEP foram associados com ETC e AG. A análise da associação por haplótipos também revelou sete e três associações significativas após correção Bonferroni no IGF1 e LEP, respectivamente. Portanto, o presente estudo identificou polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP associados a variáveis de crescimento e de carcaça em ovinos Santa Inês, os quais podem ser fontes de informação para a seleção assistida por marcadores.
id UFBA-2_f448744b08ad48776ca3954df03793bd
oai_identifier_str oai:repositorio.ufba.br:ri/31060
network_acronym_str UFBA-2
network_name_str Repositório Institucional da UFBA
repository_id_str 1932
spelling Machado, Alessandro LimaMachado, Alessandro LimaPinto, Luís Fernando BaristaBittencourt, Thereza Cristina Borio dos Santos Calmon dePinto, Luís Fernando BaristaCucco, Diego de CordovaCamargo, Grgório Miguel Ferreira deBarbosa, Leandro TeixeiraPedrosa, Victor Breno2019-12-12T16:20:44Z2019-12-12T16:20:44Z2019-12-122018-05-11http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31060O objetivo deste estudo foi identificar associação entre polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP e características de interesse econômico em 192 ovinos Santa Inês. Peso vivo aos 100 (P100) e 240 dias (P240) dias de idade, as alturas na cernelha (AC) e na garupa (AG), o comprimentos do corpo (CC), os perímetros do tórax (PT) e da perna (PP), as larguras do tórax (LP) e da garupa (LG), a profundidade de corpo (PC), a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e o escore de terminação de carcaça (ETC) foram os fenótipos avaliados. Um total de 112 polimorfismos foram testados, sendo 25 no CAPN1, 42 no CAST, 16 no GH, 11 no IGF1 e 18 no LEP. Cada marcador foi testado individualmente e por fim uma abordagem de haplótipos também foi conduzida. Vinte e três associações foram detectadas entre SNPs no gene CAST e as variáveis P100, P240, ETC, EGS, PT e LT. Além disso, efeitos de haplótipos no gene CAST sobre AOL, GMD, PT, CC e PP foram encontrados. Para os SNPs no CAPN1, sete efeitos aditivos sobre P100, AG, AC, PC, EGS e AOL foram encontrados, enquanto a análise de associação por haplótipos detectou efeito sobre EGS. O SNP g.47486819C>A localizado no GH foi associado com P100, enquanto o SNP g.171110428C>T no IGF1 foi associado com AC, AG, LT, PP e GMD. Os SNPs localizados no gene LEP (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) foram associados com ETC, AG e EGS. Além disso, os SNPs g.92502623G>C e g.92502947A>C no LEP foram associados com ETC e AG. A análise da associação por haplótipos também revelou sete e três associações significativas após correção Bonferroni no IGF1 e LEP, respectivamente. Portanto, o presente estudo identificou polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP associados a variáveis de crescimento e de carcaça em ovinos Santa Inês, os quais podem ser fontes de informação para a seleção assistida por marcadores.This study aimed to identify association between polymorphisms in CAPN1, CAST, GH, IGF1, and LEP genes and phenotypic traits in 192 Santa Ines lambs. Body weight at 100 (BW100) and 240 days (BW240), average daily gain (ADG) between 100 and 240 days, withers (WH) and croup (CH) heights, body length (BL), thoracic (TG) and leg (LG) girths, thoracic (TW) and croup (CW) widths, body depth (BD), rib eye area (REA), fat thickness (FT), and carcass finish score (CFS) were evaluated. A total of 112 polymorphisms were tested, 25 in CAPN1, 42 in CAST, 16 in GH, 11 in IGF1, and 18 in LEP. Each marker was tested individually and finally a haplotype association approach was also conducted. Twenty-three associations were detected between SNPs in the CAST gene and BW100, BW240, CFS, FT, TG and TW. In addition, effects of haplotypes on the CAST gene on REA, ADG, TG, BD and LG were found. For the SNPs in CAPN1, seven additive effects on BW100, WH, CH, BD, FT and REA were found, while haplotype association analysis detected an effect on FT. The SNP g.47486819C>A in GH was associated with BW100, whereas the SNP g.171110428C>T on IGF1 was associated with WH, CH, TW, LG and ADG. The SNPs located in LEP gene (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) were associated with CFS, CH and FT. In addition, the SNPs g.92502623G>C and g.92502947A>C in LEP were associated with CFS and CH. Haplotype association analysis also revealed seven and three significant associations after Bonferroni correction in IGF1 and LEP, respectively. Therefore, the present study identified polymorphisms in CAPN1, CAST, GH, IGF1 and LEP genes associated with growth and carcass traits in Santa Ines sheep, which may be sources of information for marker-assisted selection.Submitted by Kleber Morbeck Alves (klebermorbeck@gmail.com) on 2019-12-12T16:09:44Z No. of bitstreams: 1 Alessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdf: 831655 bytes, checksum: cc74a22103cab0a7b4ff231b117838cb (MD5)Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2019-12-12T16:20:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Alessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdf: 831655 bytes, checksum: cc74a22103cab0a7b4ff231b117838cb (MD5)Made available in DSpace on 2019-12-12T16:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdf: 831655 bytes, checksum: cc74a22103cab0a7b4ff231b117838cb (MD5)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB)Genética e Melhoramento dos Animais DomésticosCordeirosGenes candidatosMutação,SNPPolimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inêsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisEscola de Medicina Veterinária e ZootecniaPós-Graduação em ZootecniaPOSZOO-UFBABrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAORIGINALAlessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdfAlessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdfapplication/pdf831655https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/1/Alessandro%20Lima%20Machado%20-%2011-05-2018.pdfcc74a22103cab0a7b4ff231b117838cbMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1442https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/2/license.txt817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1aMD52TEXTAlessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdf.txtAlessandro Lima Machado - 11-05-2018.pdf.txtExtracted texttext/plain152660https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/3/Alessandro%20Lima%20Machado%20-%2011-05-2018.pdf.txtf7010bf53cf795f32597aefb63179145MD53ri/310602022-07-05 14:04:04.006oai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322022-07-05T17:04:04Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
title Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
spellingShingle Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
Machado, Alessandro Lima
Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Cordeiros
Genes candidatos
Mutação,
SNP
title_short Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
title_full Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
title_fullStr Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
title_full_unstemmed Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
title_sort Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês
author Machado, Alessandro Lima
author_facet Machado, Alessandro Lima
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Machado, Alessandro Lima
Machado, Alessandro Lima
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Pinto, Luís Fernando Barista
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Bittencourt, Thereza Cristina Borio dos Santos Calmon de
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Pinto, Luís Fernando Barista
Cucco, Diego de Cordova
Camargo, Grgório Miguel Ferreira de
Barbosa, Leandro Teixeira
Pedrosa, Victor Breno
contributor_str_mv Pinto, Luís Fernando Barista
Bittencourt, Thereza Cristina Borio dos Santos Calmon de
Pinto, Luís Fernando Barista
Cucco, Diego de Cordova
Camargo, Grgório Miguel Ferreira de
Barbosa, Leandro Teixeira
Pedrosa, Victor Breno
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
topic Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Cordeiros
Genes candidatos
Mutação,
SNP
dc.subject.por.fl_str_mv Cordeiros
Genes candidatos
Mutação,
SNP
description O objetivo deste estudo foi identificar associação entre polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP e características de interesse econômico em 192 ovinos Santa Inês. Peso vivo aos 100 (P100) e 240 dias (P240) dias de idade, as alturas na cernelha (AC) e na garupa (AG), o comprimentos do corpo (CC), os perímetros do tórax (PT) e da perna (PP), as larguras do tórax (LP) e da garupa (LG), a profundidade de corpo (PC), a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e o escore de terminação de carcaça (ETC) foram os fenótipos avaliados. Um total de 112 polimorfismos foram testados, sendo 25 no CAPN1, 42 no CAST, 16 no GH, 11 no IGF1 e 18 no LEP. Cada marcador foi testado individualmente e por fim uma abordagem de haplótipos também foi conduzida. Vinte e três associações foram detectadas entre SNPs no gene CAST e as variáveis P100, P240, ETC, EGS, PT e LT. Além disso, efeitos de haplótipos no gene CAST sobre AOL, GMD, PT, CC e PP foram encontrados. Para os SNPs no CAPN1, sete efeitos aditivos sobre P100, AG, AC, PC, EGS e AOL foram encontrados, enquanto a análise de associação por haplótipos detectou efeito sobre EGS. O SNP g.47486819C>A localizado no GH foi associado com P100, enquanto o SNP g.171110428C>T no IGF1 foi associado com AC, AG, LT, PP e GMD. Os SNPs localizados no gene LEP (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) foram associados com ETC, AG e EGS. Além disso, os SNPs g.92502623G>C e g.92502947A>C no LEP foram associados com ETC e AG. A análise da associação por haplótipos também revelou sete e três associações significativas após correção Bonferroni no IGF1 e LEP, respectivamente. Portanto, o presente estudo identificou polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP associados a variáveis de crescimento e de carcaça em ovinos Santa Inês, os quais podem ser fontes de informação para a seleção assistida por marcadores.
publishDate 2018
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2018-05-11
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-12-12T16:20:44Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-12-12T16:20:44Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-12-12
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31060
url http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/31060
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.publisher.program.fl_str_mv Pós-Graduação em Zootecnia
dc.publisher.initials.fl_str_mv POSZOO-UFBA
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFBA
instname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)
instacron:UFBA
instname_str Universidade Federal da Bahia (UFBA)
instacron_str UFBA
institution UFBA
reponame_str Repositório Institucional da UFBA
collection Repositório Institucional da UFBA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/1/Alessandro%20Lima%20Machado%20-%2011-05-2018.pdf
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/2/license.txt
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/31060/3/Alessandro%20Lima%20Machado%20-%2011-05-2018.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv cc74a22103cab0a7b4ff231b117838cb
817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1a
f7010bf53cf795f32597aefb63179145
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808459605832892416