Mapeamento e análise in silico das proteínas referentes ao estresse salino em espécies do gênero do algodoeiro ( Gossypium ssp.).
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Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG |
Texto Completo: | https://dx.doi.org/10.52446/cursoengbiotecnologiaCDSA.2021.tccmon.santos http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/20359 |
Resumo: | A cotonicultura é uma plantação muito importante no Brasil, detentora do quinto lugar de maior produtora e terceira maior exportadora mundial. Nacionalmente, o plantio de algodão herbáceo concentrase no centrooeste e nordeste, onde é majoritariamente cultivado por irrigação, seguido da técnica de sequeiro e sem rega. Os fatores climáticos, alta evapotranspiração e baixa pluviosidade, qualidade da água de irrigação, manejo, características do solo e espécie, são determinantes para existência e agravamento do estresse salino no plantio, sendo um dos mais importantes estresses abióticos, juntamente com o hídrico, a afetar o crescimento, produtividade e qualidade da fibra. Para isto, o melhoramento genético vegetal é a alternativa mais viável para redução das consequências geradas na planta pelo excesso de sais, como uso de produtos químicos na lavoura e perda quantitativa e econômica da produção. Com desenho de primers in silico que reconhecerão os domínios conservados no gene relacionados com a tolerância e/ou resistência, viabilizando a manipulação genética para criação de cultivares mais adaptadas a este fator. Assim, a partir da bioinformática, o presente trabalho, analisou taxonomicamente e físicoquimicamente três proteínas de interesse selecionadas, segundo triagem prévia, realizando desenho dos primers, validação destes e seleção dos dez primers mais estáveis, seis das proteínas e quatro degenerados, os quais são seguros, específicos e estão de acordo com padrões qualitativos de referência. De extrema relevância para área experimental, o conhecimento do perfil, ação das proteínas e desenho dos marcadores moleculares realizados, o caminho para se minimizar os problemas gerados pela salinidade ao cultivo é palpável. |
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Mapeamento e análise in silico das proteínas referentes ao estresse salino em espécies do gênero do algodoeiro ( Gossypium ssp.).In silico mapping and analysis of proteins related to salt stress in species of the cotton genus ( Gossypium ssp.).CotoniculturaEstresse salinoSalinidadeAlgodoeiro – Gossypium ssp.Melhoramento genético vegetalBioinformáticaPrimers in silico – desenhoAnálise taxonômica de proteínasAnálise físico-química de proteínasCotton farmingSalt stressSalinityCotton – Gossypium ssp.Plant genetic improvementBioinformaticsPrimers in silico - designTaxonomic analysis of proteinsPhysicochemical analysis of proteinsA cotonicultura é uma plantação muito importante no Brasil, detentora do quinto lugar de maior produtora e terceira maior exportadora mundial. Nacionalmente, o plantio de algodão herbáceo concentrase no centrooeste e nordeste, onde é majoritariamente cultivado por irrigação, seguido da técnica de sequeiro e sem rega. Os fatores climáticos, alta evapotranspiração e baixa pluviosidade, qualidade da água de irrigação, manejo, características do solo e espécie, são determinantes para existência e agravamento do estresse salino no plantio, sendo um dos mais importantes estresses abióticos, juntamente com o hídrico, a afetar o crescimento, produtividade e qualidade da fibra. Para isto, o melhoramento genético vegetal é a alternativa mais viável para redução das consequências geradas na planta pelo excesso de sais, como uso de produtos químicos na lavoura e perda quantitativa e econômica da produção. Com desenho de primers in silico que reconhecerão os domínios conservados no gene relacionados com a tolerância e/ou resistência, viabilizando a manipulação genética para criação de cultivares mais adaptadas a este fator. Assim, a partir da bioinformática, o presente trabalho, analisou taxonomicamente e físicoquimicamente três proteínas de interesse selecionadas, segundo triagem prévia, realizando desenho dos primers, validação destes e seleção dos dez primers mais estáveis, seis das proteínas e quatro degenerados, os quais são seguros, específicos e estão de acordo com padrões qualitativos de referência. De extrema relevância para área experimental, o conhecimento do perfil, ação das proteínas e desenho dos marcadores moleculares realizados, o caminho para se minimizar os problemas gerados pela salinidade ao cultivo é palpável.Cotoniculture is a very important plantation in Brazil, holding the fifth place as the largest producer and the third largest exporter in the world. Nationally, the planting of herbaceous cotton is concentrated in the Midwest and Northeast, where it is mostly cultivated by irrigation, followed by the rainfed technique and without irrigation. Climatic factors, high evapotranspiration and low rainfall, irrigation water quality, management, soil and species characteristics, are determinant for the existence and aggravation of saline stress at planting, being one of the most important abiotic stresses, along with water, affect fiber growth, productivity and quality. For this, plant genetic improvement is the most viable alternative to reduce the consequences generated in the plant by excess salts, such as the use of chemical products in the crop and the quantitative and economic loss of production. With design of in silico primers that will recognize conserved domains in the gene related to tolerance and/or resistance, enabling genetic manipulation to create cultivars more adapted to this factor. Thus, from bioinformatics, the present work analyzed taxonomically and physico chemically three selected proteins of interest, according to previous screening, designing the primers, validating them and selecting the ten most stable primers, six from the proteins and four degenerates, the which are safe, specific and in accordance with qualitative reference standards. Of extreme relevance for the experimental area, the knowledge of the profile, action of proteins and design of molecular markers carried out, the way to minimize the problems generated by salinity in cultivation is palpable.CapesUniversidade Federal de Campina GrandeBrasilCentro de Desenvolvimento Sustentável do Semiárido - CDSAUFCGNASCIMENTO, Ana Verônica Silva do.NASCIMENTO, A. V. S.http://lattes.cnpq.br/6761533520481142JIMENEZ, Horace José.JIMENEZ, H. J.http://lattes.cnpq.br/3637176623275060QUEIROZ, Jean César Farias de.BARROS, Aldre Jorge Morais.SANTOS, Débora Souza dos.2021-05-272021-08-03T17:22:23Z2021-07-032021-08-03T17:22:23Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://dx.doi.org/10.52446/cursoengbiotecnologiaCDSA.2021.tccmon.santoshttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/20359SANTOS, Débora Souza dos. Mapeamento e análise in silico das proteínas referentes ao estresse salino em espécies do gênero do algodoeiro ( Gossypium ssp.). 2021. 92f. (Trabalho de Conclusão de Curso – Monografia), Curso de Engenharia de Biotecnologia e Bioprocessos, Centro de Desenvolvimento Sustentável do Semiárido, Universidade Federal de Campina Grande, Sumé – Paraíba – Brasil, 2021. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/20359porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCGinstname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)instacron:UFCG2023-06-28T18:07:23Zoai:localhost:riufcg/20359Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.ufcg.edu.br/PUBhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/oai/requestbdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.bropendoar:48512023-06-28T18:07:23Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)false |
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A cotonicultura é uma plantação muito importante no Brasil, detentora do quinto lugar de maior produtora e terceira maior exportadora mundial. Nacionalmente, o plantio de algodão herbáceo concentrase no centrooeste e nordeste, onde é majoritariamente cultivado por irrigação, seguido da técnica de sequeiro e sem rega. Os fatores climáticos, alta evapotranspiração e baixa pluviosidade, qualidade da água de irrigação, manejo, características do solo e espécie, são determinantes para existência e agravamento do estresse salino no plantio, sendo um dos mais importantes estresses abióticos, juntamente com o hídrico, a afetar o crescimento, produtividade e qualidade da fibra. Para isto, o melhoramento genético vegetal é a alternativa mais viável para redução das consequências geradas na planta pelo excesso de sais, como uso de produtos químicos na lavoura e perda quantitativa e econômica da produção. Com desenho de primers in silico que reconhecerão os domínios conservados no gene relacionados com a tolerância e/ou resistência, viabilizando a manipulação genética para criação de cultivares mais adaptadas a este fator. Assim, a partir da bioinformática, o presente trabalho, analisou taxonomicamente e físicoquimicamente três proteínas de interesse selecionadas, segundo triagem prévia, realizando desenho dos primers, validação destes e seleção dos dez primers mais estáveis, seis das proteínas e quatro degenerados, os quais são seguros, específicos e estão de acordo com padrões qualitativos de referência. De extrema relevância para área experimental, o conhecimento do perfil, ação das proteínas e desenho dos marcadores moleculares realizados, o caminho para se minimizar os problemas gerados pela salinidade ao cultivo é palpável. |
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