Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Luana Nepomuceno Gondim Costa Lima
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
Texto Completo: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=13788
Resumo: O estudo da detecÃÃo de DNA do M. leprae em secreÃÃo nasal de indivÃduos e as metodologias de genotipagem do M. leprae tÃm complementado a epidemiologia da hansenÃase. Este estudo avaliou a positividade de DNA de M. leprae na secreÃÃo nasal (SN) de pacientes com hansenÃase e de indivÃduos sadios; e a variabilidade genÃtica entre cepas de M. leprae, estudando a relaÃÃo com fatores clÃnico-epidemiolÃgicos. Foram coletadas amostras de SN de 185 pacientes (grupo C), de 136 indivÃduos sem hansenÃase (grupo Co) que frequentavam o Centro de ReferÃncia Nacional em Dermatologia SanitÃria Dona LibÃnia em Fortaleza, Cearà e 121 alunos da Faculdade Christus em Fortaleza (grupo GE). Foram coletadas biÃpsias de pele (BP) de 38 indivÃduos do grupo C. Todas as amostras de SN foram submetidas à amplificaÃÃo da regiÃo RLEP por meio de PCR NESTED. Para avaliaÃÃo da diversidade genÃtica do M. leprae entre indivÃduos, foram analisadas cepas de SN de 48 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quatro loci de repetiÃÃes em tandem de nÃmero variÃvel (VNTRs): AC8b, AC9, AC8a e GT9. Para o estudo da variabilidade da cepa no mesmo indivÃduo foram comparadas amostras de BP e SN de 38 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quinze loci de VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. Foram RLEP positivo 69,2% dos casos, 66,9% do grupo Co e 28,1% do grupo GE. O fato de o indivÃduo ser homem, pertencer à classe socioeconÃmica D/E e a cada ano de idade que envelhece, aumenta a chance em 6,266, 3,083 e 1,046, respectivamente, dele ser PCR positivo. Na anÃlise de distribuiÃÃo geogrÃfica dos indivÃduos RLEP positivos, o grupo Co foi o grupo de interseÃÃo entre os grupos C e GE e em relaÃÃo ao grupo C, os com baciloscopia positiva e RLEP positivo estiveram mais agrupados do que os com baciloscopia positiva e RLEP negativo. Os loci AC8b, AC9, AC8a e GTA9 apresentaram uma diversidade alÃlica considerada moderadamente discriminante. Houve a formaÃÃo de quatro grupos com cepas de genÃtipos idÃnticos. Os genÃtipos mais frequentes foram o AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 e o AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. As cepas de genÃtipos Ãnicos foram detectadas em pacientes com idade menor e em pacientes nos quais ocorreu maior tempo entre sintomas e diagnÃstico. Foi constatada a existÃncia de diferentes cepas circulando no MunicÃpio em estudo e diferenÃas de subpopulaÃÃes do bacilo entre as amostras de BP e SN de um mesmo indivÃduo.  
id UFC_712ee55128051fab8cae1f950f7eb1eb
oai_identifier_str oai:www.teses.ufc.br:9206
network_acronym_str UFC
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
spelling info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisEstudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃMolecular epidemiological study of leprosy in Fortaleza, CearÃ2015-11-26LÃgia Regina Franco Sansigolo Kerr12225734828http://lattes.cnpq.br/6549222399222061Ronald Feitosa Pinheiro87656388400http://lattes.cnpq.br/4755251182720144Haroldo Josà de Matos44275293720http://lattes.cnpq.br/9830983900880582Bernard Carl Kendallhttp://lattes.cnpq.br/8260892329689556 83795367387Luana Nepomuceno Gondim Costa LimaUniversidade Federal do CearÃPrograma de PÃs-GraduaÃÃo em CiÃncias MÃdicasUFCBRBIOLOGIA GERALO estudo da detecÃÃo de DNA do M. leprae em secreÃÃo nasal de indivÃduos e as metodologias de genotipagem do M. leprae tÃm complementado a epidemiologia da hansenÃase. Este estudo avaliou a positividade de DNA de M. leprae na secreÃÃo nasal (SN) de pacientes com hansenÃase e de indivÃduos sadios; e a variabilidade genÃtica entre cepas de M. leprae, estudando a relaÃÃo com fatores clÃnico-epidemiolÃgicos. Foram coletadas amostras de SN de 185 pacientes (grupo C), de 136 indivÃduos sem hansenÃase (grupo Co) que frequentavam o Centro de ReferÃncia Nacional em Dermatologia SanitÃria Dona LibÃnia em Fortaleza, Cearà e 121 alunos da Faculdade Christus em Fortaleza (grupo GE). Foram coletadas biÃpsias de pele (BP) de 38 indivÃduos do grupo C. Todas as amostras de SN foram submetidas à amplificaÃÃo da regiÃo RLEP por meio de PCR NESTED. Para avaliaÃÃo da diversidade genÃtica do M. leprae entre indivÃduos, foram analisadas cepas de SN de 48 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quatro loci de repetiÃÃes em tandem de nÃmero variÃvel (VNTRs): AC8b, AC9, AC8a e GT9. Para o estudo da variabilidade da cepa no mesmo indivÃduo foram comparadas amostras de BP e SN de 38 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quinze loci de VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. Foram RLEP positivo 69,2% dos casos, 66,9% do grupo Co e 28,1% do grupo GE. O fato de o indivÃduo ser homem, pertencer à classe socioeconÃmica D/E e a cada ano de idade que envelhece, aumenta a chance em 6,266, 3,083 e 1,046, respectivamente, dele ser PCR positivo. Na anÃlise de distribuiÃÃo geogrÃfica dos indivÃduos RLEP positivos, o grupo Co foi o grupo de interseÃÃo entre os grupos C e GE e em relaÃÃo ao grupo C, os com baciloscopia positiva e RLEP positivo estiveram mais agrupados do que os com baciloscopia positiva e RLEP negativo. Os loci AC8b, AC9, AC8a e GTA9 apresentaram uma diversidade alÃlica considerada moderadamente discriminante. Houve a formaÃÃo de quatro grupos com cepas de genÃtipos idÃnticos. Os genÃtipos mais frequentes foram o AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 e o AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. As cepas de genÃtipos Ãnicos foram detectadas em pacientes com idade menor e em pacientes nos quais ocorreu maior tempo entre sintomas e diagnÃstico. Foi constatada a existÃncia de diferentes cepas circulando no MunicÃpio em estudo e diferenÃas de subpopulaÃÃes do bacilo entre as amostras de BP e SN de um mesmo indivÃduo.   The study of detection of M. leprae DNA in nasal secretions from patients and healthy subjects in addition to the methodologies for genotyping of M. leprae has complemented the leprosyâs epidemiology. This study evaluated the positivity of M. leprae DNA in nasal secretion (NS) of leprosy patients and healthy individuals; and genetic variability among strains of M. leprae, studying the relationship with clinical and epidemiological factors. NS samples were collected from 185 patients (group C), 136 individuals without leprosy (Co) attending the National Reference Center for Sanitary Dermatology Dona LibÃnia in Fortaleza, Cearà and 121 students from the Faculty Christus in Fortaleza (GE group). Skin biopsies (SB) were collected from 38 individuals in group C. All samples NS were subjected to DNA extraction and amplification of RLEP region by nested PCR. To assess the genetic diversity of M. leprae among individuals, 48 strains of SN positive patients RLEP system were analyzed using the four loci of variable number tandem repeats (VNTRs): AC8b, AC9, and AC8a GT9. To study the variability of the strain in the same individual were compared BP and SN samples of 38 positive patients RLEP system using the fifteen loci VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. 69.2% of the cases, 66.9% of Co and 28.1% of group GE were positive RLEP. The fact that the individual is male, belonging to socioeconomic class D/E and every year-old age increases the chance in 6,266, 3,083 and 1,046, respectively, be it positive PCR. In the analysis of geographical distribution of individuals positive RLEP, the Co was the group of intersection between C and GE groups and the group C, the smear-positive and positive RLEP were more clustered than smear-positive and negative RLEP. The AC8b, AC9, and AC8a GTA9 loci showed allelic diversity considered moderately discriminating. There was a formation of four groups with strains of identical genotypes. The most common genotypes were AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 and AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. Strains of unique genotypes were detected in patients aged greater and in patients in whom there was more time between symptoms and diagnosis. The existence of different strains circulating in the city under study and different subpopulations of bacilli between BP and SN samples of the same individual was observed. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=13788application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCinstname:Universidade Federal do Cearáinstacron:UFC2019-01-21T11:27:01Zmail@mail.com -
dc.title.pt.fl_str_mv Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Molecular epidemiological study of leprosy in Fortaleza, CearÃ
title Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
spellingShingle Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
Luana Nepomuceno Gondim Costa Lima
BIOLOGIA GERAL
title_short Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
title_full Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
title_fullStr Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
title_full_unstemmed Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
title_sort Estudo EpidemiolÃgico Molecular da HansenÃase em Fortaleza, CearÃ
author Luana Nepomuceno Gondim Costa Lima
author_facet Luana Nepomuceno Gondim Costa Lima
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv LÃgia Regina Franco Sansigolo Kerr
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv 12225734828
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6549222399222061
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Ronald Feitosa Pinheiro
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv 87656388400
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4755251182720144
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Haroldo Josà de Matos
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv 44275293720
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9830983900880582
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Bernard Carl Kendall
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8260892329689556
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 83795367387
dc.contributor.author.fl_str_mv Luana Nepomuceno Gondim Costa Lima
contributor_str_mv LÃgia Regina Franco Sansigolo Kerr
Ronald Feitosa Pinheiro
Haroldo Josà de Matos
Bernard Carl Kendall
dc.subject.cnpq.fl_str_mv BIOLOGIA GERAL
topic BIOLOGIA GERAL
dc.description.abstract.por.fl_txt_mv O estudo da detecÃÃo de DNA do M. leprae em secreÃÃo nasal de indivÃduos e as metodologias de genotipagem do M. leprae tÃm complementado a epidemiologia da hansenÃase. Este estudo avaliou a positividade de DNA de M. leprae na secreÃÃo nasal (SN) de pacientes com hansenÃase e de indivÃduos sadios; e a variabilidade genÃtica entre cepas de M. leprae, estudando a relaÃÃo com fatores clÃnico-epidemiolÃgicos. Foram coletadas amostras de SN de 185 pacientes (grupo C), de 136 indivÃduos sem hansenÃase (grupo Co) que frequentavam o Centro de ReferÃncia Nacional em Dermatologia SanitÃria Dona LibÃnia em Fortaleza, Cearà e 121 alunos da Faculdade Christus em Fortaleza (grupo GE). Foram coletadas biÃpsias de pele (BP) de 38 indivÃduos do grupo C. Todas as amostras de SN foram submetidas à amplificaÃÃo da regiÃo RLEP por meio de PCR NESTED. Para avaliaÃÃo da diversidade genÃtica do M. leprae entre indivÃduos, foram analisadas cepas de SN de 48 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quatro loci de repetiÃÃes em tandem de nÃmero variÃvel (VNTRs): AC8b, AC9, AC8a e GT9. Para o estudo da variabilidade da cepa no mesmo indivÃduo foram comparadas amostras de BP e SN de 38 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quinze loci de VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. Foram RLEP positivo 69,2% dos casos, 66,9% do grupo Co e 28,1% do grupo GE. O fato de o indivÃduo ser homem, pertencer à classe socioeconÃmica D/E e a cada ano de idade que envelhece, aumenta a chance em 6,266, 3,083 e 1,046, respectivamente, dele ser PCR positivo. Na anÃlise de distribuiÃÃo geogrÃfica dos indivÃduos RLEP positivos, o grupo Co foi o grupo de interseÃÃo entre os grupos C e GE e em relaÃÃo ao grupo C, os com baciloscopia positiva e RLEP positivo estiveram mais agrupados do que os com baciloscopia positiva e RLEP negativo. Os loci AC8b, AC9, AC8a e GTA9 apresentaram uma diversidade alÃlica considerada moderadamente discriminante. Houve a formaÃÃo de quatro grupos com cepas de genÃtipos idÃnticos. Os genÃtipos mais frequentes foram o AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 e o AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. As cepas de genÃtipos Ãnicos foram detectadas em pacientes com idade menor e em pacientes nos quais ocorreu maior tempo entre sintomas e diagnÃstico. Foi constatada a existÃncia de diferentes cepas circulando no MunicÃpio em estudo e diferenÃas de subpopulaÃÃes do bacilo entre as amostras de BP e SN de um mesmo indivÃduo.  
dc.description.abstract.eng.fl_txt_mv The study of detection of M. leprae DNA in nasal secretions from patients and healthy subjects in addition to the methodologies for genotyping of M. leprae has complemented the leprosyâs epidemiology. This study evaluated the positivity of M. leprae DNA in nasal secretion (NS) of leprosy patients and healthy individuals; and genetic variability among strains of M. leprae, studying the relationship with clinical and epidemiological factors. NS samples were collected from 185 patients (group C), 136 individuals without leprosy (Co) attending the National Reference Center for Sanitary Dermatology Dona LibÃnia in Fortaleza, Cearà and 121 students from the Faculty Christus in Fortaleza (GE group). Skin biopsies (SB) were collected from 38 individuals in group C. All samples NS were subjected to DNA extraction and amplification of RLEP region by nested PCR. To assess the genetic diversity of M. leprae among individuals, 48 strains of SN positive patients RLEP system were analyzed using the four loci of variable number tandem repeats (VNTRs): AC8b, AC9, and AC8a GT9. To study the variability of the strain in the same individual were compared BP and SN samples of 38 positive patients RLEP system using the fifteen loci VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. 69.2% of the cases, 66.9% of Co and 28.1% of group GE were positive RLEP. The fact that the individual is male, belonging to socioeconomic class D/E and every year-old age increases the chance in 6,266, 3,083 and 1,046, respectively, be it positive PCR. In the analysis of geographical distribution of individuals positive RLEP, the Co was the group of intersection between C and GE groups and the group C, the smear-positive and positive RLEP were more clustered than smear-positive and negative RLEP. The AC8b, AC9, and AC8a GTA9 loci showed allelic diversity considered moderately discriminating. There was a formation of four groups with strains of identical genotypes. The most common genotypes were AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 and AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. Strains of unique genotypes were detected in patients aged greater and in patients in whom there was more time between symptoms and diagnosis. The existence of different strains circulating in the city under study and different subpopulations of bacilli between BP and SN samples of the same individual was observed.
description O estudo da detecÃÃo de DNA do M. leprae em secreÃÃo nasal de indivÃduos e as metodologias de genotipagem do M. leprae tÃm complementado a epidemiologia da hansenÃase. Este estudo avaliou a positividade de DNA de M. leprae na secreÃÃo nasal (SN) de pacientes com hansenÃase e de indivÃduos sadios; e a variabilidade genÃtica entre cepas de M. leprae, estudando a relaÃÃo com fatores clÃnico-epidemiolÃgicos. Foram coletadas amostras de SN de 185 pacientes (grupo C), de 136 indivÃduos sem hansenÃase (grupo Co) que frequentavam o Centro de ReferÃncia Nacional em Dermatologia SanitÃria Dona LibÃnia em Fortaleza, Cearà e 121 alunos da Faculdade Christus em Fortaleza (grupo GE). Foram coletadas biÃpsias de pele (BP) de 38 indivÃduos do grupo C. Todas as amostras de SN foram submetidas à amplificaÃÃo da regiÃo RLEP por meio de PCR NESTED. Para avaliaÃÃo da diversidade genÃtica do M. leprae entre indivÃduos, foram analisadas cepas de SN de 48 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quatro loci de repetiÃÃes em tandem de nÃmero variÃvel (VNTRs): AC8b, AC9, AC8a e GT9. Para o estudo da variabilidade da cepa no mesmo indivÃduo foram comparadas amostras de BP e SN de 38 pacientes positivos do sistema RLEP, utilizando os quinze loci de VNTRs: AT17, GGT5, GTA9, AC8b, AC8a, AT15, AC9, 21-3, GAA21, TA18, 6-7, 27-5, TA10, 23-3, 12-5. Foram RLEP positivo 69,2% dos casos, 66,9% do grupo Co e 28,1% do grupo GE. O fato de o indivÃduo ser homem, pertencer à classe socioeconÃmica D/E e a cada ano de idade que envelhece, aumenta a chance em 6,266, 3,083 e 1,046, respectivamente, dele ser PCR positivo. Na anÃlise de distribuiÃÃo geogrÃfica dos indivÃduos RLEP positivos, o grupo Co foi o grupo de interseÃÃo entre os grupos C e GE e em relaÃÃo ao grupo C, os com baciloscopia positiva e RLEP positivo estiveram mais agrupados do que os com baciloscopia positiva e RLEP negativo. Os loci AC8b, AC9, AC8a e GTA9 apresentaram uma diversidade alÃlica considerada moderadamente discriminante. Houve a formaÃÃo de quatro grupos com cepas de genÃtipos idÃnticos. Os genÃtipos mais frequentes foram o AC8b: 8, AC9: 7, AC8a: 8, GTA9: 10 e o AC8b: 7, AC9: 8, AC8a: 9, GTA9: 9. As cepas de genÃtipos Ãnicos foram detectadas em pacientes com idade menor e em pacientes nos quais ocorreu maior tempo entre sintomas e diagnÃstico. Foi constatada a existÃncia de diferentes cepas circulando no MunicÃpio em estudo e diferenÃas de subpopulaÃÃes do bacilo entre as amostras de BP e SN de um mesmo indivÃduo.  
publishDate 2015
dc.date.issued.fl_str_mv 2015-11-26
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
status_str publishedVersion
format doctoralThesis
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=13788
url http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=13788
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do CearÃ
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de PÃs-GraduaÃÃo em CiÃncias MÃdicas
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFC
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do CearÃ
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
instname:Universidade Federal do Ceará
instacron:UFC
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará
instacron_str UFC
institution UFC
repository.name.fl_str_mv -
repository.mail.fl_str_mv mail@mail.com
_version_ 1643295200976568320