Avaliação da resistência e virulência de amostras de enterococcus spp. isoladas de diferentes sítios infecciosos de pacientes atendidos no Hospital Universitário Antônio Pedro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bressan, Eduardo de Oliveira
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
Texto Completo: https://app.uff.br/riuff/handle/1/33573
Resumo: O gênero Enterococcus pode ser encontrado compondo, principalmente, a microbiota intestinal. Entretanto, nas últimas décadas, vêm emergindo como importantes patógenos oportunistas. Essa característica patogênica está relacionada tanto à resistência aos antimicrobianos, quanto à presença de fatores de virulência. O presente trabalho teve como objetivo avaliar 60 amostras clínicas de Enterococcus spp. provenientes de diferentes sítios infecciosos e de colonização de indivíduos atendidos no HUAP quanto ao perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos, à presença de genes de resistência e virulência e à capacidade de formação de biofilme. As amostras identificadas como Enterococcus spp. foram coletadas, de dezembro de 2021 a junho de 2022, de forma consecutiva, isoladas de diferentes sítios de infecção e colonização. As amostras tiveram sua identificação confirmada pelo MALDI-TOF MS. A determinação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizada pelo método de disco-difusão e a concentração mínima inibitória para vancomicina, a partir do método de microdiluição em caldo, foi determinada para amostras que apresentaram resistência a esse antimicrobiano. Foi realizada a pesquisa dos genes vanA, gelE e esp pelo método de reação em cadeia da polimerase e a avaliação da capacidade de formação de biofilme a partir do micrométodo quantitativo. Foram incluídas no estudo 41 amostras de E. faecalis, 18 de E. faecium e 1 de E. gallinarum. A maioria dos isolados (N=33) foi obtida de swab de vigilância e, dentre as de origem infecciosa, a maioria foi proveniente de amostras de urina (N=18). Entre as amostras de colonização foram detectadas altas taxas de resistência a diversos antimicrobianos, além de uma alta taxa do fenótipo intermediário a teicoplanina (58,8%) entre E. faecalis. Por outro lado, os isolados de E. faecalis de origem infecciosa (N=24) apresentaram taxas relativamente menores de resistência, enquanto os de E. faecium (N=3) foram susceptíveis apenas à cloranfenicol, linezolida, teicoplanina e vancomicina. O gene vanA foi detectado em 53,3% (N=32) dos isolados (todos de amostras de vigilância). Além disso, todas os isolados que foram resistentes ao disco de vancomicina (N=30) foram resistentes a altos níveis desse antimicrobiano (CMI = 64 µg/mL). Os genes esp e gelE foram detectados em 58,3% e 57% dos isolados, respectivamente, e, apesar da maioria desses ter sido caracterizado como formadores de biofilme, a presença dos genes sozinhos ou em conjunto não estiveram associados à esta formação (p-valor > 0,05). Entretanto, amostras da espécie E. faecalis, ou, independente da espécie, isoladas de sítios infecciosos, assim como, negativas para o gene vanA, apresentaram maiores valores na produção de biofilme. Sendo assim, concluímos que as amostras de Enterococcus spp. isoladas no HUAP apresentam altas taxas de resistência aos antimicrobianos, além da capacidade de produzir biofilme, apesar das diferenças encontradas entre as espécies, indicando a importância da constante vigilância do isolamento deste patógeno nas instituições de saúde brasileiras.
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As amostras identificadas como Enterococcus spp. foram coletadas, de dezembro de 2021 a junho de 2022, de forma consecutiva, isoladas de diferentes sítios de infecção e colonização. As amostras tiveram sua identificação confirmada pelo MALDI-TOF MS. A determinação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizada pelo método de disco-difusão e a concentração mínima inibitória para vancomicina, a partir do método de microdiluição em caldo, foi determinada para amostras que apresentaram resistência a esse antimicrobiano. Foi realizada a pesquisa dos genes vanA, gelE e esp pelo método de reação em cadeia da polimerase e a avaliação da capacidade de formação de biofilme a partir do micrométodo quantitativo. Foram incluídas no estudo 41 amostras de E. faecalis, 18 de E. faecium e 1 de E. gallinarum. A maioria dos isolados (N=33) foi obtida de swab de vigilância e, dentre as de origem infecciosa, a maioria foi proveniente de amostras de urina (N=18). Entre as amostras de colonização foram detectadas altas taxas de resistência a diversos antimicrobianos, além de uma alta taxa do fenótipo intermediário a teicoplanina (58,8%) entre E. faecalis. Por outro lado, os isolados de E. faecalis de origem infecciosa (N=24) apresentaram taxas relativamente menores de resistência, enquanto os de E. faecium (N=3) foram susceptíveis apenas à cloranfenicol, linezolida, teicoplanina e vancomicina. O gene vanA foi detectado em 53,3% (N=32) dos isolados (todos de amostras de vigilância). Além disso, todas os isolados que foram resistentes ao disco de vancomicina (N=30) foram resistentes a altos níveis desse antimicrobiano (CMI = 64 µg/mL). Os genes esp e gelE foram detectados em 58,3% e 57% dos isolados, respectivamente, e, apesar da maioria desses ter sido caracterizado como formadores de biofilme, a presença dos genes sozinhos ou em conjunto não estiveram associados à esta formação (p-valor > 0,05). Entretanto, amostras da espécie E. faecalis, ou, independente da espécie, isoladas de sítios infecciosos, assim como, negativas para o gene vanA, apresentaram maiores valores na produção de biofilme. Sendo assim, concluímos que as amostras de Enterococcus spp. isoladas no HUAP apresentam altas taxas de resistência aos antimicrobianos, além da capacidade de produzir biofilme, apesar das diferenças encontradas entre as espécies, indicando a importância da constante vigilância do isolamento deste patógeno nas instituições de saúde brasileiras.The genus Enterococcus can be found mainly in the gut microbiome. However, in the last deacdes, they have been emerging as important opportunistic pathogens. This pathogenic characteristic is related both to antimicrobial resistance and to the presence of virulence factors. Thus, this study aimed to evaluate 60 clinical isolates of Enterococcus spp. from different infectious and colonization origin of patients assisted at HUAP regarding the profile of susceptibility to antimicrobials, the presence of resistance and virulence genes and the ability to form biofilm. Isolates identified as Enterococcus spp. were collected, from December 2021 to June 2022, consecutively, isolated from different sites of infection and colonization. The isolates had their identification confirmed by MALDI-TOF MS. The antimicrobial susceptibility profile was determined using the disk-diffusion method and the minimum inhibitory concentration for vancomycin, using the broth microdilution method, was determined for isolates that showed resistance to this antimicrobial. The search of vanA, gelE and esp genes was carried out by the polymerase chain reaction method and the evaluation of biofilm formation capacity was carried out by the quantitative micromethod. Forty-one isolates of E. faecalis, 18 of E. faecium and 1 of E. gallinarum were included in the study. Most isolates (N=33) were obtained from surveillance swabs and, among those of infectious origin, most were from urine samples (N=18). Among the colonization samples, high rates of resistance to several antimicrobials were detected, in addition to a high rate of intermediate resistance to teicoplanin (58.8%) among E. faecalis. On the other hand, isolates of E. faecalis of infectious origin (N=24) showed relatively lower rates of resistance, while those of E. faecium (N=3) were susceptible only to chloramphenicol, linezolid, teicoplanin and vancomycin. The vanA gene was detected in 53,3% (N=32) of the isolates (all from surveillance samples). Furthermore, all samples that were resistant to the vancomycin disk (N=30) were resistant to high levels of this antimicrobial agent (CMI = 64 µg/mL). The gelE and esp genes were detected in 58,3% and 57% of the isolates, respectively, and, although most samples were characterized as able to form biofilm, the presence of these genes alone or together was not associated with this ability (p value > 0,05). However, E. faecalis isolates or isolates from infectious sites, regardless of the species, as well as negative for the vanA gene, showed higher values in biofilm formation. Therefore, we concluded that Enterococcus spp. isolated at HUAP, besides showing high rates of resistance to antimicrobials drugs, were able to produce biofilm, despite the differences found between species, indicating the importance of constant surveillance oh these pathogens in Brazilian health institutions.69 f.Chamon, Raiane CardosoRibeiro, Rachel LeitePaiva, Luciana de SouzaNeves, Felipe Piedade GonçalvesPinto, Tatiana de Castro AbreuBressan, Eduardo de Oliveira2024-07-24T13:40:09Z2024-07-24T13:40:09Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfBRESSAN, Eduardo de Oliveira. Avaliação da resistência e virulência de amostras de enterococcus spp. isoladas de diferentes sítios infecciosos de pacientes atendidos no Hospital Universitário Antônio Pedro. 2023. 69 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Programa de Pós-Graduação em Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, 2023.https://app.uff.br/riuff/handle/1/33573CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2024-07-24T13:40:14Zoai:app.uff.br:1/33573Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-07-24T13:40:14Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false
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