Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Luana Paula Fernandes
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/64416
Resumo: A detecção precoce de envenenamentos provocados por aranhas do gênero Loxosceles ainda é desafio para a saúde pública e para o tratamento dos acidentados, devido à dificuldade de se estabelecer um diagnóstico uma vez que a picada das aranhas é indolor e a lesão provocada por ser confundida com outras condições. Métodos de ELISA já foram avaliados quanto a possibilidade de detectar esses envenenamentos por meio da detecção de componentes proteicos do veneno. Contudo, esses métodos demandam tempo e equipamentos que inviabilizam a praticidade de um diagnóstico para ambulatórios simples. Neste trabalho, utilizamos um método rápido, simples e visual, a amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) com a proposta de detectar DNA de aranhas do gênero Loxosceles em diferentes amostras coletadas (pelo, swab e soro) de coelhos experimentalmente envenenados. Foram avaliadas diferentes condições de tempo (15, 30 e 60 minutos), concentração de iniciadores e temperatura (60, 65, 68 e 71 °C) com duas abordagens de LAMP, sendo escolhida a colorimétrica, por apresentar um limite de detecção 32 vezes melhor (0.315 pg) do que a abordagem não colorimétrica (10 pg) e 62 vezes maior que a PCR tradicional (20 pg). O ensaio desenvolvido foi capaz de detectar com eficiência, sensibilidade (de até 100%) e especificidade (100 %) o DNA de Loxosceles intermedia em diferentes amostras em um prazo de até 72 horas após o envenenamento experimental. A detecção pôde ser feita de forma visual dispensando a necessidade de visualização por géis de agarose ou poliacrilamida. Por sua facilidade de execução, rapidez, sensibilidade e especificidade a LAMP apresenta um grande potencial para a aplicação na detecção de DNA de aranhas do gênero Loxosceles o que auxiliaria no diagnóstico de envenenamentos provocados por esses animais.
id UFMG_28afeb02ae781ba7ee5f59f7916d2725
oai_identifier_str oai:repositorio.ufmg.br:1843/64416
network_acronym_str UFMG
network_name_str Repositório Institucional da UFMG
repository_id_str
spelling Liza Figueiredo Felicori Vilelahttp://lattes.cnpq.br/4618441212905355Carlos Delfin Chávez OlórteguiRubens Lima do Monte NetoAna Lúcia Teles RabeloRodrigo Ribeiro Resendehttp://lattes.cnpq.br/9600358550383942Luana Paula Fernandes2024-02-21T17:23:47Z2024-02-21T17:23:47Z2021-06-14http://hdl.handle.net/1843/64416A detecção precoce de envenenamentos provocados por aranhas do gênero Loxosceles ainda é desafio para a saúde pública e para o tratamento dos acidentados, devido à dificuldade de se estabelecer um diagnóstico uma vez que a picada das aranhas é indolor e a lesão provocada por ser confundida com outras condições. Métodos de ELISA já foram avaliados quanto a possibilidade de detectar esses envenenamentos por meio da detecção de componentes proteicos do veneno. Contudo, esses métodos demandam tempo e equipamentos que inviabilizam a praticidade de um diagnóstico para ambulatórios simples. Neste trabalho, utilizamos um método rápido, simples e visual, a amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) com a proposta de detectar DNA de aranhas do gênero Loxosceles em diferentes amostras coletadas (pelo, swab e soro) de coelhos experimentalmente envenenados. Foram avaliadas diferentes condições de tempo (15, 30 e 60 minutos), concentração de iniciadores e temperatura (60, 65, 68 e 71 °C) com duas abordagens de LAMP, sendo escolhida a colorimétrica, por apresentar um limite de detecção 32 vezes melhor (0.315 pg) do que a abordagem não colorimétrica (10 pg) e 62 vezes maior que a PCR tradicional (20 pg). O ensaio desenvolvido foi capaz de detectar com eficiência, sensibilidade (de até 100%) e especificidade (100 %) o DNA de Loxosceles intermedia em diferentes amostras em um prazo de até 72 horas após o envenenamento experimental. A detecção pôde ser feita de forma visual dispensando a necessidade de visualização por géis de agarose ou poliacrilamida. Por sua facilidade de execução, rapidez, sensibilidade e especificidade a LAMP apresenta um grande potencial para a aplicação na detecção de DNA de aranhas do gênero Loxosceles o que auxiliaria no diagnóstico de envenenamentos provocados por esses animais.The early detection of poisonings caused by spiders of the genus Loxosceles is still a challenge for public health and for the patient treatment, due to the difficulty of establishing a diagnosis since the spider bite is painless and the injury caused can be mistaken with other conditions. ELISA methods have already been evaluated for the possibility of detecting these poisonings by detecting protein components of the venom. However, these methods require time and equipment that make practical diagnosis impossible for simple clinics. In this work, we use a fast, simple and visual method, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) with the purpose of detecting DNA from Loxosceles spiders in different samples collected (hair, swab and serum) of experimentally envenomed rabbits. Different conditions of time (15, 30 and 60 minutes), concentration of iniciadores and temperature (60, 65, 68 and 71 ° C) were evaluated with two LAMP methodologies. The visual detection method was chosen because it presents a limit of detection 32 times better (0.315 pg) than non-colorimetric approach and 62 times better than traditional PCR. The developed test was able to detect with efficiency, sensitivity (up to 100%) and specificity (100%) the DNA of Loxosceles intermedia in different samples within 72 hours after the poisoning. The detection could be done visually, eliminating the need for visualization by agarose or polyacrylamide gels. For its effortlessness of implementation, speed, sensitivity and specificity, LAMP has great potential for application in DNA detection of the genus Loxosceles spiders which would help in the diagnosis of poisoning caused by these animals.FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais2023-06-14porUniversidade Federal de Minas GeraisPrograma de Pós-Graduação em Bioquímica e ImunologiaUFMGBrasilICB - DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E IMUNOLOGIABioquímica e ImunologiaEnvenenamentoAranhasVenenos de AranhaDetecção de envenenamento por LoxoscelesLoxoscelismoAmplificação isotérmicaDetecção visual por LAMPIdentificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALIDENTIFICAÇÃO DO DNA DE ARANHAS DO GÊNERO LOXOSCELES POR LAMP COMO MÉTODO DIAGNÓSTICO DO ENVENENAMENTO CAUSADO POR ESSAS ARANHAS.pdfIDENTIFICAÇÃO DO DNA DE ARANHAS DO GÊNERO LOXOSCELES POR LAMP COMO MÉTODO DIAGNÓSTICO DO ENVENENAMENTO CAUSADO POR ESSAS ARANHAS.pdfapplication/pdf5946200https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/64416/3/IDENTIFICA%c3%87%c3%83O%20DO%20DNA%20DE%20ARANHAS%20DO%20G%c3%8aNERO%20LOXOSCELES%20POR%20LAMP%20COMO%20M%c3%89TODO%20DIAGN%c3%93STICO%20DO%20ENVENENAMENTO%20CAUSADO%20POR%20ESSAS%20ARANHAS.pdff2a9d81ae5207f00a9ee691b8218cb42MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82118https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/64416/4/license.txtcda590c95a0b51b4d15f60c9642ca272MD541843/644162024-02-21 14:23:48.443oai:repositorio.ufmg.br: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ório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2024-02-21T17:23:48Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
title Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
spellingShingle Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
Luana Paula Fernandes
Detecção de envenenamento por Loxosceles
Loxoscelismo
Amplificação isotérmica
Detecção visual por LAMP
Bioquímica e Imunologia
Envenenamento
Aranhas
Venenos de Aranha
title_short Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
title_full Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
title_fullStr Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
title_full_unstemmed Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
title_sort Identificação do DNA de aranhas do gênero loxosceles por LAMP como método diagnóstico do envenenamento causado por essas aranhas.
author Luana Paula Fernandes
author_facet Luana Paula Fernandes
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Liza Figueiredo Felicori Vilela
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4618441212905355
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Carlos Delfin Chávez Olórtegui
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Rubens Lima do Monte Neto
dc.contributor.referee5.fl_str_mv Ana Lúcia Teles Rabelo
Rodrigo Ribeiro Resende
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9600358550383942
dc.contributor.author.fl_str_mv Luana Paula Fernandes
contributor_str_mv Liza Figueiredo Felicori Vilela
Carlos Delfin Chávez Olórtegui
Rubens Lima do Monte Neto
Ana Lúcia Teles Rabelo
Rodrigo Ribeiro Resende
dc.subject.por.fl_str_mv Detecção de envenenamento por Loxosceles
Loxoscelismo
Amplificação isotérmica
Detecção visual por LAMP
topic Detecção de envenenamento por Loxosceles
Loxoscelismo
Amplificação isotérmica
Detecção visual por LAMP
Bioquímica e Imunologia
Envenenamento
Aranhas
Venenos de Aranha
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Bioquímica e Imunologia
Envenenamento
Aranhas
Venenos de Aranha
description A detecção precoce de envenenamentos provocados por aranhas do gênero Loxosceles ainda é desafio para a saúde pública e para o tratamento dos acidentados, devido à dificuldade de se estabelecer um diagnóstico uma vez que a picada das aranhas é indolor e a lesão provocada por ser confundida com outras condições. Métodos de ELISA já foram avaliados quanto a possibilidade de detectar esses envenenamentos por meio da detecção de componentes proteicos do veneno. Contudo, esses métodos demandam tempo e equipamentos que inviabilizam a praticidade de um diagnóstico para ambulatórios simples. Neste trabalho, utilizamos um método rápido, simples e visual, a amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) com a proposta de detectar DNA de aranhas do gênero Loxosceles em diferentes amostras coletadas (pelo, swab e soro) de coelhos experimentalmente envenenados. Foram avaliadas diferentes condições de tempo (15, 30 e 60 minutos), concentração de iniciadores e temperatura (60, 65, 68 e 71 °C) com duas abordagens de LAMP, sendo escolhida a colorimétrica, por apresentar um limite de detecção 32 vezes melhor (0.315 pg) do que a abordagem não colorimétrica (10 pg) e 62 vezes maior que a PCR tradicional (20 pg). O ensaio desenvolvido foi capaz de detectar com eficiência, sensibilidade (de até 100%) e especificidade (100 %) o DNA de Loxosceles intermedia em diferentes amostras em um prazo de até 72 horas após o envenenamento experimental. A detecção pôde ser feita de forma visual dispensando a necessidade de visualização por géis de agarose ou poliacrilamida. Por sua facilidade de execução, rapidez, sensibilidade e especificidade a LAMP apresenta um grande potencial para a aplicação na detecção de DNA de aranhas do gênero Loxosceles o que auxiliaria no diagnóstico de envenenamentos provocados por esses animais.
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021-06-14
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-02-21T17:23:47Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-02-21T17:23:47Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1843/64416
url http://hdl.handle.net/1843/64416
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Bioquímica e Imunologia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFMG
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv ICB - DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E IMUNOLOGIA
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMG
instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron:UFMG
instname_str Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron_str UFMG
institution UFMG
reponame_str Repositório Institucional da UFMG
collection Repositório Institucional da UFMG
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/64416/3/IDENTIFICA%c3%87%c3%83O%20DO%20DNA%20DE%20ARANHAS%20DO%20G%c3%8aNERO%20LOXOSCELES%20POR%20LAMP%20COMO%20M%c3%89TODO%20DIAGN%c3%93STICO%20DO%20ENVENENAMENTO%20CAUSADO%20POR%20ESSAS%20ARANHAS.pdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/64416/4/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv f2a9d81ae5207f00a9ee691b8218cb42
cda590c95a0b51b4d15f60c9642ca272
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1803589198607810560